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- 保留组织内部精细区域的空间信息的转录组测序。一次实验即可得到全部基因表达，并比对至相应的 H&E 染色图像，达到图像化和数字化的高度整合分析
- 上海
- 2025年07月16日
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上海烈冰生物医药科技有限公司
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空间转录组测序
空间转录组是指保留组织内部精细区域的空间信息的转录组测序。一次实验即可得到全部基因表达，并比对至相应的 H&E 染色图像，达到图像化和数字化的高度整合分析。
空间转录组学分析可展示组织切片中不同区域的基因表达情况，揭示精细病理区域中激活的信号通路，完成分子特征驱动病理特征的机制解析。空间转录组以分子方式定义病理，完成了病理数字化结合病理影像化的革新，将在未来的精准医疗、免疫治疗研究中发挥重要作用。
—— 空间转录组测序能干什么？——
病理学研究，探究细胞分化发育过程
揭示肿瘤微环境及异质性
研究免疫浸润，免疫扩散和免疫细胞空间位置解析
神经科学领域揭示大脑皮层结构
解析不同发育阶段基因表达特征阴性 / 假阳性的位置
—— 技术原理 ——
当组织冷冻切片附在带有 spatial barcode 的空间转录组芯片上时，通过透化处理，细胞内的 mRNA 释放出来，从而被芯片上上百万个带有oligo-dT 的探针捕获，每个探针上都带有独特的 spatial barcodes，用以标记捕获的 mRNA 的空间位置，可以将每个 mRNA转录的序列映射回组织切片中的原始位置。
—— 技术优势 ——
保留组织形态结构，获得基因在空间上的分布信息
结合HE染色，获得不同组织形态结构下的细胞组成信息
结合单细胞数据，获得细胞在空间上的分布信息
一次实验即可得到全部基因表达
样本直接冰冻切片，避免消化过程带来的细胞类型/基因表达的偏差
样本直接冰冻切片，避免消化过程带来的细胞类型/基因表达的偏差
—— 烈冰服务方案 ——
实验平台
率先拥有先进的冷冻切片机LEICA CM1950，3DHISTECH公司的PANNORAMIC系列的数字切片扫描仪，搭配经验丰富的实验团队，对多种组织类型的切片厚度与切片温度进行测试优化，同时实现明场与荧光场下冷冻切片的快速扫描成像；Z-Stack多层聚焦扫描及Extended Focus 景深扩展多层融合扫描模式，进一步提升分辨率和清晰度，保证切片高分辨的数字图像信息精准采集。
实验流程
样本要求
样本类型：新鲜组织直接 OCT 包埋后干冰速冻，注意标明样本方向，样本于-80℃保存。
质量要求：样本大小尽量＜6.5mm×6.5mm，RIN值＞7，若样本充足，可2 份及以上用作备份。
质量要求：样本大小尽量＜6.5mm×6.5mm，RIN值＞7，若样本充足，可2 份及以上用作备份。
数据分析流程
针对每个样本的空间转录组测序数据，对所有检测到的细胞进行分群，并鉴定细胞的类型，可以在不同分组间从细胞类型的组成和丰度角度进行比较。
结果示例
烈冰生物具备全套空间转录组实验平台，为您提供完整的全服务流程，涉及各种类型样本制备、完善的实验质控流程、个性化的数据分析。
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文献和实验该产品被引用文献
[1] Guo C L, Wang C S, Wang Z C, et al. Granzyme K+ CD8+ T cells interact with fibroblasts to promote neutrophilic inflammation in nasal polyps[J]. Nature Communications, 2024, 15(1): 1-22.
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