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锐博生物
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16s rDNA测序
16S rDNA测序即16S测序,利用高通量测序技术检测特定环境下的微生物(主要是细菌),结合生物信息学分析,提供环境样本物种分类、物种丰度、种群结构、系统进化等诸多信息。16S rDNA是细菌基因组中编码核糖体16S rRNA分子对应的DNA序列,由9个高变区(V),中间穿插着保守区组成。对于不同环境样品的DNA,扩增其中16S rDNA中V3-V4区片段,可以区分鉴定绝大多数细菌,是最常用的细菌分类标准。
服务优势
● 超低建库起始量,无偏差覆盖低丰度物种
● 拼接效果好,准确高效鉴定物种
● 自主研发分析方法,轻松实现样品菌群组成、组间差异和系统进化分析
项目流程

生物信息学分析项目

代表性客户文章
- Li N, Yang Z, Liao B, et al. Chronic exposure to ambient particulate matter induces gut microbial dysbiosis in a rat COPD model[J]. Respiratory research, 2020, 21(1): 1-10.
- Wang Y, Wu Y, Wang B, et al. Bacillus amyloliquefaciens SC06 protects mice against high-fat diet-induced obesity and liver injury via regulating host metabolism and gut microbiota[J]. Frontiers in microbiology, 2019, 10: 1161.
- Mai J, Liang B, Xiong Z, et al. Oral administration of recombinant Bacillus subtilis spores expressing Helicobacter pylori neutrophil‐activating protein suppresses peanut allergy via up‐regulation of Tregs[J]. Clinical & Experimental Allergy, 2019, 49(12): 1605-1614.
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文献和实验Characterization of Mycoplasmas by PCR and Sequence Analysis with Universal 16S rDNA Primers
Ribosomes are present in all self-replicating cells and constitute their protein-synthesizing machinery. The ribosomes are composed of ribosomal proteins and ribosomal RNA (rRNA). Bacteria have three kinds of rRNA (5S, 16S, and 23S rRNA
【求助】土壤微生物总DNA的提取及细菌16S rDNA的PCR扩增出问题了,寻求大家的帮助!
tyuanc 我用MO Bio的soil DNA Isolation Kit提取土壤总DNA,提取的DNA直接跑胶,看不见任何条带,采用细菌16S rDNA通用引物(27F和1492R)进行PCR扩增,也没有结果,有一次我将试剂盒提取的DNA50倍稀释后,进行细菌16S rDNA的PCR扩增,扩增出了目的条带,我所用的酶为Takara的LA Taq,用普通的Taq酶扩增不出来,但隔了一周后再去重复,什么条件都一样,却再也扩不出来了,我重新提取了新的DNA进行
454测序仪的出现极大促进了测序业务的开展,科研人员已经将测序技术作为解决科研工作中许多常见 问题的利器。这是因为454测序仪在以下几个方面取得了质的突破:首先是解决了高通量测序问题;其次它简 化了样品准备步骤,将以往转化大肠杆菌扩增质粒的繁琐过程全部用简单的体外PCR扩增法替代了;最后, 它缩小了测序反应体积,节省了 试剂 。这样,454测序仪做到了以极其低廉的价格进行大规模平行测序反应。 它的测序规模之大、测序费用之低
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