微卫星检测

服务简介

公司依托3730XL 测序仪检测平台专门开发了针对基因长度多态性进行检测项目，包括STR/SSR、AFLP、MLPA 和T-RFLP 检测和实验项目。STR/SSR（Microsatellite，微卫星标记）也称为短串联重复序列（STR）或简单重复序列（SSR），是广泛分布在真核生物基因组中的简单重复序列，因此被认为是继限制性片段长度多态性（RFLP）之后的第二代遗传标记，广泛应用于遗传制图、基因定位、法医学鉴定、人类学以及遗传病的诊断等许多领域的研究。AFLP（amplified fragment length polymorphism，扩增片段长度多态性）是由荷兰科学家Pieter Vos 等于1995 年发明的分子标记技术，是基于PCR 技术扩增基因组DNA限制性片段，基因组DNA 先用限制性内切酶切割，然后将双链接头连接到DNA 片段的末端，它结合了RFLP 和PCR 技术高效性特点，用荧光标记的引物进行PCR 扩增，产物进行毛细管电泳检测，可使某一品种出现特定的DNA 谱带，得到某物种DNA 多态性的指纹图谱。MLPA（multiplex ligation-dependent probe amplification，多重连接探针扩增）于2002 年由Schouten 等首先报道，是近几年发展起来的一种针对待检DNA 序列进行定性和半定量分析的新技术，基本原理包括探针和靶序列DNA 进行杂交，之后通过连接、PCR 扩增，产物通过毛细管电泳分离及数据收集，分析软件对收集的数据进行分析最后得出结论，目前已经应用于多个领域、多种疾病的研究。T-RFLP (Terminal restriction fragment length polymorphism，末端限制性长度多态性)技术是发明于上世纪末用于分析环境微生物多样性的一种新方法，其原理是在RFLP引物的一端加上荧光标记进行PCR、产物经酶切后用3730XL 测序仪检测，检测结果以峰的位置和面积表示微生物的种类和数量，进而反映目标微生物群落的组成及时空动态，目前T-RFLP技术已被广泛用于分析各种环境中某类微生物的群落结构。

 

客户提供

提供样品

血液样品：样品为EDTA 抗凝或枸椽酸钠抗凝，样品量大于0.5 ml，样品采集后于-20°C 或-80°C 保存；

动植物组织样品：样品可以为新鲜组织（最好-80°C 保存），也可以是95%乙醇中固定的组织，组织量大于500 mg；

DNA 样品：纯度OD260/OD280 在1.8-2.0，STR/SSR/T-RFLP，浓度≥ 20 ng/μl，总量>20 μl；AFLP/MLPA 浓度≥ 100 ng/μl，总量>501 μl。

提供信息

基因信息：待测STR/SSR 位点、序列或引物；

AFLP 需要提供所用内切酶名称、接头引物及PCR 标记引物信息；

T-RFLP需要提供检测基因，如16S、18S 或其它基因及引物，内切酶名称等；

MLPA需要提供待基因信息，MLPA探针试剂盒号等。

最终交付

交付报告

实验报告（实验步骤，材料方法，结果等)、PCR 电泳照片、原始文件、PDF 格式蜂图、Excel 表格数据。