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- 2026年01月14日
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辉骏生物
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编码多肽或蛋白的lncRNA和circRNA研究
越来越多的研究表明，有的lncRNA和circRNA也能编码多肽或蛋白；且部分多肽还具有重要生理功能。为系统研究具有多肽或蛋白编码功能的lncRNA或circRNA，辉骏生物制定了能快速准确筛选它们及探究其产物功能的个性化解决方案。该技术的基本思路是：编码蛋白的RNA有开放阅读框（ORF），翻译时会与核糖体结合，产生对应的多肽或蛋白产物，通过分离核糖体-RNA复合物，对RNA进行测序，lncRNA/circRNA分析，ORF预测，可以预测其编码的多肽或蛋白信息；之后分离样本中的蛋白质进行质谱测定，获得实际的多肽或蛋白信息；将以上两种信息进行匹配，即可筛选到具有多肽或蛋白编码功能的lncRNA/circRNA信息。
应用领域
编码多肽或蛋白的lncRNA和circRNA研究。
技术优点-辉骏生物
可以从一次性获得很多编码多肽或蛋白的lncRNA和circRNA信息，为后续研究鉴定基础。
技术流程-辉骏生物
参考文献-辉骏生物
1.A micropeptide encoded by a putative long noncoding RNA regulates muscle performance. Cell 160(4):595-606 (2015). [IF＞30]
2.A peptide encoded by a transcript annotated as long noncoding RNA enhances SERCA activity in muscle. Science 351(6270):271-275 (2016). [IF＞30]
3.Circ-ZNF609 Is a Circular RNA that Can Be Translated and Functions in Myogenesis. Mol Cell 66(1):22-37 e29 (2017). [IF＞15]
4.Translation of CircRNAs. Mol Cell 66(1):9-21 e27 (2017). [IF＞14]
5.Extensive translation of circular RNAs driven by N6-methyladenosine. Cell Res 27(5):626-641 (2017). [IF＞15]
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文献和实验miRNA海绵作用，进而间接调控miRNA下游靶基因的表达。 图三 miRNA海绵机制（图片来自网络） 调控基因转录，circRNA也可以通过与RNA结合蛋白的结合来调控蛋白功能，比如通过与转录因子的结合来抑制基因的转录。 编码功能，circRNA虽然属于非编码RNA，但是也有少数circRNA可以编码多肽，通过该多肽行使调控功能。 circRNA过表达：同上述的lncRNA步骤类似，但是circRNA过表达由于成环效率的影响，其难度相对普通基因的过表达更大。 circRNA干扰
Nat Methods：陈玲玲/杨力/李劲松等开发新技术，实现环状 RNA 功能性筛选和研究
非编码 RNA，其 3' 和 5' 末端通过反向剪接形成共价连接。研究人员在真菌、植物、果蝇、小鼠以及人的细胞中均发现了多种 circRNA。越来越多的实验研究表明，circRNA 并非 mRNA 剪接副产物，而是细胞中发挥重要作用的一类 RNA 分子。circRNA 通常由编码基因的外显子部分反向剪接而来，但因缺乏区分 circRNA 与其同源外显子 mRNA 的方法，目前对特定 circRNA 的功能仍然知之甚少。 CRISPR-Cas 系统由具有核酸酶活性的效应蛋白复合物与效应蛋白结合的向导
导读 今年4月，《molecular Cell》杂志上刊登了一篇基于高通量测序方法研究肌细胞分化过程中circRNA功能性文章。通过RNA-Seq筛选人和老鼠（C2C12）肌母细胞（myoblasts ）分化成肌管细胞（myotubes ）过程以及肌营养不良症（DMD）状态下差异表达的circRNA，然后利用RNA干扰（RNAi）技术找到在肌肉分化过程中起作用的circRNA。更有趣的是，作者发现其中一个circRNA序列中含有开放阅读框（ORF），从而又进一步证明其具有编码蛋白的能力。由于文
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