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  • RNA pull down原理-辉骏生物 先将体外转录的RNA结合到Beads上,再将RNA-Beads和细胞裂解液孵育,这样与目标RNA结合的蛋白便会一起吸附在Beads上。洗涤掉不结合的蛋白后,用洗脱液将RNA-protein复合物从Beads洗脱下来,之后可以采用Western Blot技术检测特定的结合蛋白,还可以采用质谱方法鉴定与目标RNA结合的未知蛋白。
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  • 2025年12月30日
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      辉骏生物

    • 服务名称

      RNA pulldown技术服务选辉骏生物—高分文章案例多

    RNA pull down实验原理-辉骏生物

    先将体外转录的RNA结合到Beads上,再将RNA-Beads和细胞裂解液孵育,这样与目标RNA结合的蛋白便会一起吸附在Beads上。洗涤掉不结合的蛋白后,用洗脱液将RNA-protein复合物从Beads洗脱下来,之后可以采用Western Blot技术检测特定的结合蛋白,还可以采用质谱方法鉴定与目标RNA结合的未知蛋白。

    RNA pull down实验流程-辉骏生物
    RNA pull down 质谱,rna pull down探针,rna pull down实验外包.jpg


    RNA pull down应用范围-辉骏生物

    筛选或验证靶RNA的结合蛋白。


    RNA pull-down技术服务—辉骏优势

    1. 近十年服务经验,客户成果发表在Nature Methods,Oncogene,Cell Research等高水平期刊上;
    2. 对围绕RNA结合蛋白开展的整体课题提供全方位指导,包括上下游实验设计和结合蛋白的多方法验证等;
    3. 自有蛋白质组学平台,对RNA pull down产物这类微量蛋白的质谱鉴定有十足的把控能力,对后续的生物信息分析有独到的见解;
    4. 售后技术支持将一直保持到客户发表文章,确保客户安心进行下游实验及投稿。

     

    RNA pulldown服务信息-辉骏生物

    项目名称

    客户提供

    结果交付

    实验周期

     

     

    RNA pulldown WB

    待测基因模板
    实验样本
    待验证的蛋白抗体
    实验信息表

    1、RNA探针电泳图
    2、待测蛋白WB检测图
    3、结果整理图
    4、实验报告

     

     

    3-4周

    RNA pulldown MS

    待测基因模板
    实验样本
    实验信息表

    1、RNA探针电泳图
    2、质谱检测结果
    3、生物信息学分析结果
    4、实验报告

    6-7

     

    RNA pulldown 客户文献-辉骏生物

     

    1. Bao. X.C. et al: The p53-induced lincRNA-p21 derails somatic cell reprogramming by sustaining H3K9me3 and CpG methylation at pluripotency gene promoters.Cell Research.2015, IF=13.9.

    【研究内容】:作者通过RNA pull-down、RIP-qPCRCoIP等技术,证实了lincRNA-p21与HNRNPK结合,并和甲基化酶SETDB1、DNMT1形成复合物。该复合物甲基化了多能性基因的启动子序列及相应组蛋白,并改变了它们的表达量,从而进一步影响体细胞重编程过程。

    使用相关技术:rna pull-downRNA-蛋白相互作用
     

     

    2. Bao X.C. et al: Capturing the interactome of newly transcribed RNA. Nature Methods,15(3): 213–220. 2018,IF=28.467.
    【研究内容】:辉骏生物为作者单位之一,和客户共同开发了一种全新的RNA pull down,并用质谱鉴定新生RNA结合蛋白的方法。该方法主要是用EU标记新生RNA,再用点击反应-生物素-链霉亲和素系统做RNA-pull down,然后质谱鉴定分离的新生RNA互作蛋白。用该rna pulldown方法,首次鉴定到重要周期蛋白CCK1为RNA结合蛋白。RIP-qPCR、CLIP-Seq等实验进一步证实了CCK1为RBP蛋白,并发挥着重要的细胞。
    使用相关技术:RNA pull down WBRNA pull-down 技术服务
     

     

    3. Wang W.T. et al: The lncRNA LAMP5-AS1 drives leukemia cell stemness by directly modulating DOT1L methyltransferase activity in MLL leukemia. Journal of Hematology & Oncology.2020,IF=11.059.
    【研究内容】:研究显示高表达的LncRNA LAMP5-AS1能降低MLL白血病患者5年生存率。利用RNA pull down配合蛋白质质谱鉴定技术,作者首次发现LAMP5-AS1和DOT1L蛋白可能形成复合物。DOT1L是表观遗传中非常重要的甲基化酶。作者通过RIP-qPCR进一步确定了MLL细胞存在该复合物,并通过截短型RNA pull down实验进一步确定了DOT1L的结合序列。后续的ChIP-qPCR等实验证实了该复合物能有效影响DOT1L对组蛋白H3K79的甲基化水平,从而影响细胞的增殖分化。
    使用相关技术:rna pulldown实验rna pull down msrna pulldown探针
     

     

    4. He S.W. et al: AR-induced long non-coding RNA LINC01503 facilitates proliferation and metastasis via the SFPQ-FOSL1 axis in nasopharyngeal carcinoma. Oncogene. 2020,IF=7.971.
    【研究内容】:lncRNA LINC01503在鼻咽癌中高表达,并且促进了肿瘤的不良预后。作者在此探讨了LINC01503的作用机理,先用RNA pull down和质谱鉴定,发现SFPQ蛋白可能和LINC01503结合。RIP-qPCR实验确证了鼻炎癌中LINC01503募集了SFPQ基因。基于SFPQ-FOSL1轴在癌症研究中的重要地位,作者后续的工作思路之一也是关注该信号轴,并设计了ChIP-qPCR等实验做出证明。RNA pull down配合质谱鉴定,为此文研究提供了关键性的研究源头。
    使用相关技术RNA pulldown实验rna-pull down 打质谱

     

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    该产品被引用文献
    1.Identification of RNA-Protein Interactions Through In Vitro RNA Pull-Down Assays. Methods MolBiol 1480:99-113(2016).
           
    2.The long noncoding RNA ASNR regulates degradation of Bcl-2 mRNA through its interaction with AUF1. Sci Rep 6:32189 (2016).
           
    3.Silencing of the mRNA-binding protein HuR increases the sensitivity of colorectal cancer cells to ionizing radiation through upregulation of caspase-2. Cancer Lett 393:103-112(2017).

     
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