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微卫星(STR/SSR)分析服务
MDL-百奥思科
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简介:
微卫星标记(Microsatellite),也称为短串联重复序列(STR)或简单重复序列(SSR),是广泛分布在真核生物基因组中的简单重复序列。1-5个核苷酸为重复单位串联组成核心序列,重复数为10~20,核心序列两侧是较保守的侧翼序列,可在此处设计微卫星引物。
标记优缺点:
SSR具有数量多、特异性好、中性标记、稳定性好、在基因组内分布均匀、多态性信息丰富、易于检测等优点,是继限制性片段长度多态性(RFLP)之后被广泛应用的第二代遗传标记。
微卫星标记虽然有很多的优点,但是它存在种间特异性,在很多研究中要从头筛选,筛选的周期长、过程繁杂使得所有的微卫星分离筛选实验成为沙里淘金的过程。
标记筛选方法
传统筛选法,缺点是实验成本高、耗时长而无法大批量操作,并且由于使用放射性元素而使得操作过程不安全。
基于引物扩增的方法,缺点是操作繁杂,使用重复碱基引物扩增的效率较低从而使得一些较稀少的位点被忽略,并且这个方法在筛选三四碱基重复的位点时会出现单克隆的多拷贝情况。
选择性杂交法,缺点是需要对目标物种的基因组进行片段化和片段大小选择。
本公司采用基于FLASCO法(Fast isolation by AFLP of Sequences Containing repeats)微卫星快速分离方法,该方法优点是:
1)跳过对基因组片段化和大小的选择
2)充分利用了基因组,以免稀有微卫星的丢失
3)步骤较为简单,方便快速,优化效率高,实验成本较低
服务内容
通过磁珠富集微卫星序列,开发出40对具有一定重复特征的微卫星引物,并且对引物进行多态性和特异性验证。如果需要40 对以上,请提前说明。 您需要提供的信息 您可以直接提供起始样品或基因组DNA样本(要求完整,纯度高,无RNA污染,总量大于5 μg)。 服务承诺 我们提供40对具有一定重复特征的微卫星引物信息,包括引物序列、扩增片段大小、建议的TM值、多态性和特异性验证的 PAGE扫描图。 客户须知 1)提供的微卫星引物信息不能保证全都是多态性引物。 2)本技术服务需要签订技术服务合同。 3)本服务完成后相应的实验样品为您保存1月,一月后将统一销毁。
服务周期 30个工作日 服务价格 咨询客服
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