mRNA转录组测序
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  • 上海市闵行区
  • 2025年12月10日
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      上海旭燃生物科技有限公司

    • 服务名称

      mRNA转录组测序及数据分析

    服务优势
    mRNA转录组测序
    产品描述
    mRNA是在蛋白质合成时充当模板的RNA。mRNA-seq是为检测mRNA表达发展出来的高通量测序技术。其技术原理,是对RNA中含有polyA尾的mRNA用oligo dT进行富集。进而对富集下来的mRNA进行片测序。进而对测序结果进行生物信息学分析,从而获得RNA中的基因表达、可变剪接、RNA编辑等信息。
    mRNA转录组测序
    产品优势
    1、通量高、敏感性高的技术,对于多基因分析及低频突变检测具有独特的优势
    2、全基因组分析无需预先设计特异性探针能够检测未知基因
    3、低成本,高准确性,大幅降低了测序时间
    4、数字化信号直接测定每个转录本片段序列,单核苷酸分辨率的精确度
    5、利用高深度的测序数据组装构建转录本序列,识别可变剪接模式
    实验流程

    mRNA转录组测序
    数据分析

    mRNA转录组测序
    研究方向/思路
    mRNA转录组测序
    送样要求
     
    样本类型 建议送样量 存储介质 保存、运输条件
    组织 >50mg 1.RNA later
    2.存入冻存管;
    3.大块组织样本不建议放入trizol保存
    4.1.5ml无菌离心管
    -80℃保存,干冰运输
    细胞 >2 x 10^6 1.收集的细胞沉淀,加入1ml trizol震荡混匀-80度保存;
    2.收集的细胞沉淀,液氮速冻5-10min,-80℃冰箱保存;
    -80℃保存,干冰运输
    全血 >1ml A.采用EDTA抗凝管采血,禁用肝素抗凝管,新鲜血液效果更佳。
    B.或者分离出PBMC加 trizol 混匀。
    C.或者全血离心去掉血浆加 trizol 混匀。
    D.或者使用PAXgene Blood RNA Tube静脉真空采血管(全血RNA管)
    PS:请尽量不使用RNA later保存全血。
    -80℃保存,干冰/4度(新鲜)运输
    FFPE A.切片组织面积大于1cm2,切片表面无划痕,无干裂,均匀贴片的石蜡切片;
    B.切片组织细胞>30000个;有核细胞比例>80%;肿瘤细胞比例>20%,白片厚度5~ 10um,需3-5片,组织面积偏小或细胞核占比未达80%以上,需提供5-12片;

    C.石蜡块:厚度4mm以上,组织约绿豆大小以上;
    D.蜡卷:厚度25um左右,2-5卷
    / 4℃或常温保存和运输
    RNA >1ug DEPC水;Water Nuclease-Free -80℃保存,干冰运输
     
     

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    图标文献和实验
    该产品被引用文献

    RNA-seq:从技术到生物学

       NGS技术不仅被用来分析静态基因组,还被用来分析动态转录组。这些强大且快速发展的技术为我们理解基因表达和调控做出了巨大贡献。
      基因的表达调控是将基因型与表型联系起来的基础。RNA 的合成和成熟过程受到严格控制,它们形成了复杂的基因表达网络,最终驱动生物的各类进程。深入了解控制这些复杂基因表达的机制,对于更好地了解癌症等复杂疾病也非常重要。

    参考文献:
    Marguerat S, Bähler J. RNA-seq: from technology to biology[J]. Cellular and molecular life sciences, 2010, 67: 569-579.

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