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    转录组miRNA 测序

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    转录组miRNA 测序

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      miRNA测序分析
      microRNA是一类内生的、约有22个核苷酸组成的非编码小分子RNA,其在细胞内具有多种重要的调节作用。一个miRNA可以有多个靶基因,而几个miRNA也可以调节同一个基因。这种复杂的调节网络既可以通过一个miRNA来调控多个基因的表达,也可以通过几个miRNA的组合来精细调控某个基因的表达。研究表明,microRNA可作为一些已知疾病诊断的生物标记,并参与机体各种生理活动,如细胞生长凋亡、心脏发育、胚胎后期发育等。

      miRNA主要研究策略:
      1. 探究某miRNA肿瘤的增殖相关的具体调控机制;
      2. 寻找在抑制或促进肿瘤细胞凋亡方面发挥作用的miRNA
      3. 探究肿瘤的血管形成、肿瘤的转移等肿瘤微环境相关的发生机制
      4. 探究某种疾病的能量代谢、免疫等相关机制;
      5. 寻找与肿瘤基因组不稳定性相关性等;

      主要分析内容:
      1、数据产出统计和质量评估;
      2reads与参考序列比对;
      3、表达丰度统计;
      4、表达水平分析;
      5、差异表达基因筛选;
      6miRNA靶基因预测;
      7miRNA靶基因GO富集分析;
      8miRNA靶基因KEGG Pathway富集分析。

      技术参数
      1. 样本类型:血清、血浆、细胞培养上清、组织等。
      2. 推荐数据量:10M clean reads
      3. 测序策略:HiSeq SE50


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