转录组miRNA 测序

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更新日期 2021年11月29日

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miRNA测序分析
microRNA是一类内生的、约有22个核苷酸组成的非编码小分子RNA，其在细胞内具有多种重要的调节作用。一个miRNA可以有多个靶基因，而几个miRNA也可以调节同一个基因。这种复杂的调节网络既可以通过一个miRNA来调控多个基因的表达，也可以通过几个miRNA的组合来精细调控某个基因的表达。研究表明，microRNA可作为一些已知疾病诊断的生物标记，并参与机体各种生理活动，如细胞生长凋亡、心脏发育、胚胎后期发育等。

miRNA主要研究策略：
1. 探究某miRNA与肿瘤的增殖相关的具体调控机制；
2. 寻找在抑制或促进肿瘤细胞凋亡方面发挥作用的miRNA；
3. 探究肿瘤的血管形成、肿瘤的转移等肿瘤微环境相关的发生机制
4. 探究某种疾病的能量代谢、免疫等相关机制；
5. 寻找与肿瘤基因组不稳定性的相关性等；
主要分析内容：
1、数据产出统计和质量评估；
2、reads与参考序列比对；
3、表达丰度统计；
4、表达水平分析；
5、差异表达基因筛选；
6、miRNA靶基因预测；
7、miRNA靶基因GO富集分析；
8、miRNA靶基因KEGG Pathway富集分析。

技术参数
1. 样本类型：血清、血浆、细胞培养上清、组织等。
2. 推荐数据量：10M clean reads
3. 测序策略：HiSeq SE50
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