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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 库存:
371
- 英文名:
DNA Fragmentation Reagent
- 保质期:
长期
- 供应商:
北京百奥莱博科技有限公司
- 保存条件:
-25~-15℃保存,避免反复冻融
- 规格:
24次|96次
特别提示:包括DNA片段化试剂在内,本公司的所有产品仅可用于科研实验,严禁用于临床医疗及其他非科研用途!
产品名称:DNA片段化试剂
英文名称:DNA Fragmentation Reagent
产品货号:WH0207
产品规格:24次|96次
本制品为高通量测序平台文库构建配套试剂盒,用于文库构建前的大片段DNA片段化。模块利用时间依赖型酶促反应的原理,根据不同的作用时间将双链DNA随机切割成200~500 bp的片段,所得片段为平末端双链DNA片段,5"端基团含有5"-P,3"端基团含有3"-OH,可直接进行后续的dA或adapter添加。通过本制品对双链DNA随机的切割,表明本产品不具碱基偏好性,且不同类型切割DNA片段的测序覆盖率与机械切割一致。
适用范围:为构建NGS文库制备片段化的双链DNA。
适用样本量:1ng~1μg DNA
产品特点:
·无需特殊仪器设备,通过酶促反应简便快速的片段化双链DNA。
·使用灵活,通过调整片段化时间,灵活调整DNA片段化长度。
·反应高效,单个反应体系即可完成1ng~1μg DNA样本的片段化。
产品组成:
| 组分 | 24次 | 96次 |
| 5×Frag Enzyme Mix | 240μl | 960μl |
| 10×Frag Buffer | 120μl | 480μl |
| Nuclease-Free ddH2O | 1ml | 4×1ml |
保存条件:-25~-15℃保存,避免反复冻融,保质期为一年。
注意事项:(请务必在使用本试剂盒之前阅读此注意事项)
1.操作过程请注意避免核酸样品和产物之间的交叉污染。
2.请使用不含RNA酶或DNA酶的枪头、EP管进行试验。
3.试验开始前,请清洁操作台,确保没有RNA酶和DNA的污染。
4.进行文库扩增前,请确保PCR仪已经调试好并处于稳定的状态。
5.试验前请仔细阅读说明书,如果需要暂停试验,或者无需立即进行下游试验。可根据说明书推荐将试验产物保存于-20℃并安排后续试验。
推荐使用的其他试剂:
1.DNA末端修复/加dA尾试剂(WH0209-01/02)
2.adapter快速连接试剂(WH0201-01/02)
3.NGS文库富集试剂(WH0210-01/02)
操作步骤:
一、试验准备
1.在开始实验前,明确核酸的浓度及纯度至关重要,推荐DNA上样量为1ng~1μg。DNA需溶解于以下溶液中:去离子水、10mM Tris、Buffer EB或LoTE(0.1×TE)等。
注意:
?确定上样DNA浓度至关重要,尤其在上样量低于100 ng时。推荐使用Qubit、Picogreen或者其他染料法对DNA浓度进行准确定量。
?请确认DNA溶液中不含阳离子及螯合剂。如果DNA溶解于1×TE或不确定DNA溶液中的EDTA浓度,使用Agencourt AMPure XP磁珠进行纯化。
2.将各试剂置于冰上,5×Frag Enzyme Mix融化后用手指后轻弹混匀,不要涡旋。其余试剂可短暂涡旋混匀。
二、试验步骤
1.照下表设置PCR仪反应程序。开启热盖,热盖温度设置为70度。
| 操作步骤 | 温度 | 时间 |
| 1 | 4℃ | 1min |
| 2 | 32℃ | 3-22min* |
| 3 | 65℃ | 30min |
| 4 | 4℃ | 保持 |
*注:确切的片段化反应时间需要根据DNA的实际上样量进行优化。下表1中列出100ng DNA片段化所需的时间。用户可以依据此时间进行调整。调整过程中,我们推荐额外设置一个反应时间延长3min以及一个缩短3min的对照,这样有助于确定切割至所需片段大小时所需要的准确反应时间。
表1:片段化时间选择表
| 片段化时间(min)(32℃) | ||||
| DNA主峰大小 | 200bp | 300bp | 400bp | 500bp |
| 100ngDNA上样量 | 15 | 8 | 5 | 3.5 |
图1.100ng大肠杆菌基因组DNA片段化图谱(3~22 min)
2.在薄壁管中按下表配制反应体系,冰上操作,各组分加入后,请轻柔吸打混匀,注意不要涡旋。
| 成分 | 用量(μl) |
| 10×Frag Buffer | 5 |
| DNA样本 | X |
| Nuclease-Free ddH2O | (35-X)* |
| 总体积 | 40 |
*注:对于多个反应,请计算所需试剂的总体系并在此基础上增加体系10%,以避免因溶液转移过程中挂壁损失而造成分装反应数不足的问题。
3.向薄壁管中加入10μl 5×Frag Enzyme Mix,轻柔吹打6~8次,不要涡旋。
注:此过程需一直处于冰浴中进行。
4.将薄壁管短暂离心,收集溶液至管底后,立即转移至4℃预冷的PCR仪中,启动步骤1中的反应程序。
5.当反应程序结束,PCR仪温度降至4℃后,将薄壁管从PCR仪中取出并置冰上。立即进行下一步实验操作。
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