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吉奥蓝图
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CRISPR/Cas9基因编辑的工具细胞
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株
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单向导RNA(single guide RNA, sgRNA),被用来引导酶Cas9结合到靶DNA序列上并进行切割,其中Cas9与sgRNA一起被称作Cas9-sgRNA系统。单向导RNA(single guide RNA, sgRNA)能特异性识别靶基因序列,并引导Cas9核酸内切酶在靶定位点剪切双链DNA,随后,细胞的非同源末端连接修复机制(NHEJ)重新连接断裂处的基因组DNA,并引入插入或缺失突变。我们也可以提供一个外源双链供体DNA片段(Donor)通过同源重组(HR)整合进断裂处的基因组。从而达到对基因组DNA进行修饰的目的。
在CRISPR/Cas9基因编辑中,质粒转进细胞的效率和细胞单克隆生长的能力是影响基因编辑成功的主要因素。目前质粒转进细胞的方法主要有两种,一种是电转,一种是质粒的常规转染;电转需要电转仪,而大部分实验室是没有这种仪器的,因为成本很高,所以质粒的常规转染是目前最常用的方法,质粒转进细胞的效率是为了扩大突变筛选的基数, 使基因编辑成功的概率提高。细胞单克隆生长的能力是指细胞由单个细胞生长到细胞系的能力,有些细胞有很高的浓度依赖,单个细胞生长时,增殖的能力很低或没有。
如果只是为了研究某一信号通路或药物与靶基因的相互作用时,可以优先选用293T细胞和HeLa细胞这两种工具细胞进行CRISPR/Cas9基因编辑。293T和HeLa两个细胞的转染效率都比较高,单克隆生长的能力都比较强,作为CRISPR/Cas9基因编辑的工具细胞,它们的优势明显,可以为科研带来更多便捷。
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文献和实验【原创】基因组编辑三大工具ZFN、TALEN、CRISPR/Cas9筛选基因敲除细胞系阳性克隆Protocol
基因组编辑三大工具ZFN、TALEN、CRISPR/Cas9 筛选基因敲除细胞系阳性克隆Protocol 上海南方模式生物研究中心 技术顾问 周效华 从2011年科学家实现TALEN技术,2013年科学家实现CRISPR/Cas9技术,这些技术的迅速成熟都给基础生物学研究、临床医学研究提供了更为方便和快捷的分子生物学工具。技术进步必将在未来给科学研究及基因治疗研究带来更为广泛的发力!这在2014年以来的频频出现的Cas9技术在各个领域的应用进展中可以清晰看到。欢迎感兴趣的朋友联系我交流
诺奖得主 Science 发文:基因编辑诞生 10 年,未来将如何改变世界?
前言 簇状规则间隔短回文重复(CRISPR)基因组编辑的出现,以及计算和成像能力的进步,使得编辑细胞和生物体中的 DNA 片段或特定的碱基对成为可能。从遗传病到农业实践和产品,CRISPR 工具箱及其应用深刻地影响了生物学研究。 通过 CRISPR-Cas9,我们不仅可以诊断人类疾病,甚至可以根据个人遗传学预测个体易感性,还可以根据这些信息设计治疗策略。同样,我们既可以识别并快速改变负责植物性状的基因,又可以优化农业研究和植物育种。 2012 年 6 月,Jennifer
)。这些结果表明:虽然瞬时表达的 IDLV-CRISPR/Cas9 也能诱导脱靶突变,但其脱靶率显著低于 LV-CRISPR/Cas9。如果想实现高精准度的基因编辑,IDLV-CRISPR/Cas9 是一个不错的选择。 IDLV 介导基因组无痕编辑 改变生物体的遗传密码以产生某些理想的结果是基因工程的目标,基因编辑包含三大技术:锌指核酸酶(ZFN)、转录激活因子样效应核酸酶(TALEN)、CRISPR/Cas9;使用 IDLV 递送这些组分可以实现无编辑工具基因组的痕迹残留,从而减少对原始细胞表型和活力
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