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1年
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NEBNext® Ultra™II DNA 文库制备试剂盒 收藏
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999
- 供应商：
上海淳麦
- 规格：
1000U/10000U
NEBNext Ultra II DNA 文库制备试剂盒能够用更低起始量的 DNA 构建高质量的文库。文库制备每一个步骤中的试剂都经过优化，能够从 500 pg 至 1 μg 的起始 DNA 高效构建高质量的文库。新一代的 NEBNext 试剂采用了快速、流程化、自动化的工作流程，在降低 PCR 循环数的同时提高了 GC 覆盖度。本试剂盒与 PCR-free 的工作流程兼容，且对于难以建库的样本，如 FFPE 样本，也有很好的效果。
优势：
更高的文库产量，满足您更多需求；
即使在 DNA 样本量非常低的情况下（低至 500 pg），依旧能够产生高质量的文库；
适用于所有 DNA 样本，包括富含 GC 的区域及 FFPE-DNA 样本；
提高靶向富集等应用的产量及质量
流程化的操作过程，操作时间大大减少，与自动化建库设备兼容；试剂盒和模块提供了极大的选择灵活性。
了解更多NEBNext Ultra II 解决低起始量及难以建库样本问题的信息，请下载技术手册。
图1：NEBNext® Ultra™ II DNA 文库制备试剂盒从不同起始量 DNA 均能得到最高的文库产量及接头连接分子转化效率。
A： 以人 NA19240 基因组 DNA 为样本制备文库，起始量和 PCR 循环数如图所示。文库构建按照各生产商推荐方法进行，省略片段筛选的步骤。
B： 以人 NA19240 基因组 DNA 为样本制备文库，起始量和制备试剂盒如图所示，文库的构建按照生产商推荐的方法进行，不进行扩增步骤。接头连接的分子用 qPCR 进行定量，定量的结果以 Ultra II 的转化率为基准进行标准化处理。对于不同起始量 DNA， Ultra II 试剂盒均能产生最高的接头连接分子转化效率。
查看更多有关文库产量的数据
图2.：对于不同 GC 含量及起始量的微生物基因组 DNA，NEBNext Ultra II 能获得均一的 GC 覆盖度。
以 500 pg，1 ng 及 100 ng 的基因组 DNA 为起始样本，使用 Ultra II DNA 文库制备试剂盒进行建库后
使用 Illumina MiSeq® 测序。使用 Bowtie 2.2.4 将 Reads 进行比对并使用 Picard's Collect GC Bias
Metrics (v1.117) 计算 GC 覆盖度。预期的标准化覆盖度 1.0 以灰色的水平线表示，不同 GC% 中 100 bp 区域的数量以灰色条形图显示。不同颜色的线形图表示标准化后的文库覆盖度。
查看更多文库质量的数据
图3：NEBNext Ultra II 在 PCR-free 实验流程中可以得到非常高的产量。
以 100 ng 人 NA19240 基因组 DNA 为起始样本构建文库，文库制备试剂盒如图所示，文库的构建按照生产商推荐的方法进行，不进行扩增步骤。文库产量用 NEBNext 文库定量试剂盒进行 qPCR 定量。使用
NEBNext Ultra II 试剂盒得到的文库产量最高。
表1：使用 NEBNext Ultra II 能够在 PCR-free 实验中获得最高的测序质量。
以 100 ng 人 NA19240 基因组 DNA 为起始样本构建文库，使用的文库制备试剂盒如图所示，文库的构建按照生产商推荐的方法进行，不进行扩增步骤。文库使用 Illumina NextSeq 500 进行测序。测序得到的
Reads 使用 Bowtie 2.2.4 比对到 GRCh37 参考基因组。数据显示 NEBNext Ultra II DNA 文库制备试剂盒
在 PCR-free 实验流程中得到高质量的测序读数，即使在起始量非常低的情况下。
% Mapped: 比对到 人 GRCh37 参考基因组的百分比。
% Duplication: 比对序列中重复的百分比。
% Chimeras: 序列中超过最大插入片段或两端比对到不同染色体上的百分比。
表2：NEBNext Ultra II 能够从 FFPE DNA 样本中构建高质量文库。
以 17-30 ng 的 FFPE 组织样本中提取的 DNA 为起始样本制备文库，组织来源如上表所示，扩增循环数为 10 个循环，用Illumina MiSeq 进行测序。
测序得到的 Reads 使用 Bowtie 2.2.4 比对到 GRCh37 参考基因组
% Mapped: 比对到 人 GRCh37 参考基因组的百分比。
% Mapped in Pairs: mate pair 也能比对到参考基因组的百分比。
% Duplication: 比对序列中重复的百分比。
% Duplication: 比对序列中重复的百分比。
% Chimeras: 序列中超过最大插入片段或两端比对到不同染色体上的百分比。
数据显示使用 NEBNext DNA 文库制备试剂盒能够获得高质量的测序结果，即使是起始量非常低的 FFPE 样本。
查看更多FFPE DNA样本的数据
图4：NEBNext Ultra II 可为靶向富集提供高产量文库。
当使用 Nimblegen 进行靶向富集时，首先以 100 ng 人 HG02922 基因组 DNA 为起始样本，分别使用
NEBNext Ultra II 及 NEBNext 接头引物，或 Kapa 文库制备试剂盒 SeqCap® 接头(Roche)。随后的靶向富集使用 NimbleGen SeqCap Human Exome v3 试剂盒完成。
当使用 Sureselect 进行靶向富集，首先以 200 ng 人 HG02922 基因组 DNA 为起始样本，分别使用
NEBNext Ultra II 及 NEBNext 接头引物，Kapa 文库制备试剂盒及 NEBNext 接头引物，和 SureSelect
Reagent Kit，Illumina (ILM) 平台配合 Herculase® II Fusion DNA 聚合酶进行建库。随后的靶向富集使用 SureSelect® Human All Exon V6 试剂盒完成。
实验均按照生产商推荐的方法进行，包括推荐的 PCR 循环数及捕获前和捕获后处理。使用 NEBNext
Ultra II 构建的文库在两种富集方法下均可获得更高的捕获后产量。
查看更多靶向富集相关数据
批间质控
本批次的试剂盒是单独管理并通过功能验证。每个组分均通过标准的酶活性检测及质控，并通过严格的额外质量控制，质控情况可在每个组分的单独页面查询。
试剂盒组分
本试剂盒提供以下组分
概述
NEBNext Ultra II DNA 文库制备试剂盒能够用更低起始量的 DNA 构建高质量的文库。文库制备每一个步骤中的试剂都经过优化，能够从 500 pg 至 1 μg 的起始 DNA 高效构建高质量的文库。新一代的 NEBNext 试剂采用了快速、流程化、自动化的工作流程，在降低 PCR 循环数的同时提高了 GC 覆盖度。本试剂盒与 PCR-free 的工作流程兼容，且对于难以建库的样本，如 FFPE 样本，也有很好的效果。
优势：
更高的文库产量，满足您更多需求；
即使在 DNA 样本量非常低的情况下（低至 500 pg），依旧能够产生高质量的文库；
适用于所有 DNA 样本，包括富含 GC 的区域及 FFPE-DNA 样本；
提高靶向富集等应用的产量及质量
流程化的操作过程，操作时间大大减少，与自动化建库设备兼容；试剂盒和模块提供了极大的选择灵活性。
了解更多NEBNext Ultra II 解决低起始量及难以建库样本问题的信息，请下载技术手册。
图1：NEBNext® Ultra™ II DNA 文库制备试剂盒从不同起始量 DNA 均能得到最高的文库产量及接头连接分子转化效率。
A： 以人 NA19240 基因组 DNA 为样本制备文库，起始量和 PCR 循环数如图所示。文库构建按照各生产商推荐方法进行，省略片段筛选的步骤。
B： 以人 NA19240 基因组 DNA 为样本制备文库，起始量和制备试剂盒如图所示，文库的构建按照生产商推荐的方法进行，不进行扩增步骤。接头连接的分子用 qPCR 进行定量，定量的结果以 Ultra II 的转化率为基准进行标准化处理。对于不同起始量 DNA， Ultra II 试剂盒均能产生最高的接头连接分子转化效率。
查看更多有关文库产量的数据
图2.：对于不同 GC 含量及起始量的微生物基因组 DNA，NEBNext Ultra II 能获得均一的 GC 覆盖度。
以 500 pg，1 ng 及 100 ng 的基因组 DNA 为起始样本，使用 Ultra II DNA 文库制备试剂盒进行建库后
使用 Illumina MiSeq® 测序。使用 Bowtie 2.2.4 将 Reads 进行比对并使用 Picard's Collect GC Bias
Metrics (v1.117) 计算 GC 覆盖度。预期的标准化覆盖度 1.0 以灰色的水平线表示，不同 GC% 中 100 bp 区域的数量以灰色条形图显示。不同颜色的线形图表示标准化后的文库覆盖度。
查看更多文库质量的数据
图3：NEBNext Ultra II 在 PCR-free 实验流程中可以得到非常高的产量。
以 100 ng 人 NA19240 基因组 DNA 为起始样本构建文库，文库制备试剂盒如图所示，文库的构建按照生产商推荐的方法进行，不进行扩增步骤。文库产量用 NEBNext 文库定量试剂盒进行 qPCR 定量。使用
NEBNext Ultra II 试剂盒得到的文库产量最高。
表1：使用 NEBNext Ultra II 能够在 PCR-free 实验中获得最高的测序质量。
以 100 ng 人 NA19240 基因组 DNA 为起始样本构建文库，使用的文库制备试剂盒如图所示，文库的构建按照生产商推荐的方法进行，不进行扩增步骤。文库使用 Illumina NextSeq 500 进行测序。测序得到的
Reads 使用 Bowtie 2.2.4 比对到 GRCh37 参考基因组。数据显示 NEBNext Ultra II DNA 文库制备试剂盒
在 PCR-free 实验流程中得到高质量的测序读数，即使在起始量非常低的情况下。
% Mapped: 比对到 人 GRCh37 参考基因组的百分比。
% Duplication: 比对序列中重复的百分比。
% Chimeras: 序列中超过最大插入片段或两端比对到不同染色体上的百分比。
表2：NEBNext Ultra II 能够从 FFPE DNA 样本中构建高质量文库。
以 17-30 ng 的 FFPE 组织样本中提取的 DNA 为起始样本制备文库，组织来源如上表所示，扩增循环数为 10 个循环，用Illumina MiSeq 进行测序。
测序得到的 Reads 使用 Bowtie 2.2.4 比对到 GRCh37 参考基因组
% Mapped: 比对到 人 GRCh37 参考基因组的百分比。
% Mapped in Pairs: mate pair 也能比对到参考基因组的百分比。
% Duplication: 比对序列中重复的百分比。
% Duplication: 比对序列中重复的百分比。
% Chimeras: 序列中超过最大插入片段或两端比对到不同染色体上的百分比。
数据显示使用 NEBNext DNA 文库制备试剂盒能够获得高质量的测序结果，即使是起始量非常低的 FFPE 样本。
查看更多FFPE DNA样本的数据
图4：NEBNext Ultra II 可为靶向富集提供高产量文库。
当使用 Nimblegen 进行靶向富集时，首先以 100 ng 人 HG02922 基因组 DNA 为起始样本，分别使用
NEBNext Ultra II 及 NEBNext 接头引物，或 Kapa 文库制备试剂盒 SeqCap® 接头(Roche)。随后的靶向富集使用 NimbleGen SeqCap Human Exome v3 试剂盒完成。
当使用 Sureselect 进行靶向富集，首先以 200 ng 人 HG02922 基因组 DNA 为起始样本，分别使用
NEBNext Ultra II 及 NEBNext 接头引物，Kapa 文库制备试剂盒及 NEBNext 接头引物，和 SureSelect
Reagent Kit，Illumina (ILM) 平台配合 Herculase® II Fusion DNA 聚合酶进行建库。随后的靶向富集使用 SureSelect® Human All Exon V6 试剂盒完成。
实验均按照生产商推荐的方法进行，包括推荐的 PCR 循环数及捕获前和捕获后处理。使用 NEBNext
Ultra II 构建的文库在两种富集方法下均可获得更高的捕获后产量。
查看更多靶向富集相关数据
批间质控
本批次的试剂盒是单独管理并通过功能验证。每个组分均通过标准的酶活性检测及质控，并通过严格的额外质量控制，质控情况可在每个组分的单独页面查询。
试剂盒组分
本试剂盒提供以下组分
优势及特点
特点
更高的文库产量，满足您更多需求
即使在 DNA 样本量非常低的情况下（低至 500 pg），依旧能够产生高质量的文库
适用于所有 DNA 样本，包括富含 GC 的区域及 FFPE-DNA 样本
提高靶向富集等应用的产量及质量
流程化的操作过程，操作时间大大减少，与自动化建库设备兼容；试剂盒和模块提供了极大的选择灵活性
性能和使用
需要但试剂盒中不提供的试剂及材料：
1. 80% Ethanol (新鲜制备)
2. Nuclease-free Water
3. 0.1X TE (1 mM Tris-HCl, pH 8.0, 0.1 mM EDTA)
4. DNA LoBind Tubes (Eppendorf #022431021)
5. SPRIselect® Reagent Kit (Beckman Coulter, Inc. #B23317) 或
6. AMPure® XP Beads (Beckman Coulter, Inc. #A63881)
8. 磁力架
9. PCR仪
可选试剂：
1. 10 mM Tris-HCl, pH 8.0 或
2. 10 mM Tris-HCl, pH 8.0 with 10 mM NaCl (用于起始量 ≤ 100 ng 时接头稀释)
贮存温度：
-20°C
上海淳麦生物科技有限公司专注于感受态细胞、质粒、载体、农杆菌、酵母等生命科学领域的产品研发和技术服务支持。
上海淳麦生物科技有限公司在感受态细胞的研发方面，实力雄厚，拥有了克隆、表达、酵母和农杆菌4大类，共计百余种感受态细胞。在电击感受态方面，拥有了大肠杆菌和农杆菌电击感受态种类，极大提高了客户在转基因以及文库构建方面的成功率。
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