Magna MeRIP m6A Assay

我被这篇关于 m6A 修饰的文章折服了……

结论：m6A 参与了 EMT 的过程，并且非常重要！！2.EMT 过程中 m6A 调控的核心基因的鉴定；既然确认 m6A 在 EMT 中存在调控功能，因此下一步就是对被调控的基因进行鉴定了。作者使用 meRIP-seq 实验，对 EMT 前后细胞中 RNA 的 m6A 修饰状况进行了研究。发现 EMT 前后 m6A 的 motif、RNA 功能区的分布和基因组上的分布都没有显著区别，但鉴定出了 128 个 m6A 修饰水平存在显著差异（1.5Fold）的基因，这些基因的功能进行分析发现与癌细胞中的粘附

Nat Commun：肖东/孙妍课题组合作揭示 m6A 修饰调节细胞自噬的新机制

27a 与 METTL3 结合减弱显著抑制 METTL3 泛素化降解，是导致饥饿时 METTL3 蛋白稳定性和丰度增加的主要原因。 图 2 YTHDF3 需要 METTL3 介导的 m6A 修饰来促进自噬 （图源：Hao WC, et al., Nat Commun, 2022） 为探究 YTHDF3 识别 mRNA m6A 修饰诱导自噬的具体机制，研究者运用饥饿诱导的 MEFs 细胞模型通过 RIP 和 MeRIP 测序（图 3a-f），并运用 RNA EMSA 等实验（图 3 g-k），证实 METTL3

听说大家都准备做 m6A 了，你想好要怎么做了吗？

作用：Mammosphere Assay；（2） ALKBH5介导了缺氧对ALDH阳性乳腺癌细胞的促进作用：流式细胞学分析；5. 过表达ALKBH5进行回复实验以及稳定干扰ALKBH5后进行体内实验至此，整篇文章便结束了，由简图可以看出，铁打的缺氧和ALKBH5，流水的下游，每一个部分的逻辑大致均为“缺氧—现象”、“缺氧—ALKBH5—现象”，最后形成了这个逻辑链这篇文章要解决的关键问题很简单，就是将ALKBH5与m6A NANOG构成因果关系，然后串联上下游形成完整逻辑链，使用的研究m6A的方法也十分简单