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分子进化分析

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  • 2025年07月08日
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      分子进化分析

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      华因康

    分子进化分析


    比较基因组学研究不同物种间的基因结构和功能的相似性和不同点,为解释生物进化过程中的各种问题提供十分有价值的信息。同时,通过比较不同片段的基因序列,找出相似程度高的基因片段,能够推断出新的基因的结构及功能。进来,比较基因组学的一个研究重点由寻找有功能性的蛋白质转向寻找有调控功能的区域和siRNA的方向转移。调控基因片段在各种疾病中扮演着重要角色, 区域内任何突变都有可能引起所调控的基因表达异常,进而引发癌变。

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    • 分子进化树构建及数据分析的简介

      或ML.对相似度很低的序列,NJ往往出现Long-branch attraction(LBA,长枝吸引现象),有时严重干扰进化树的构建。贝叶斯的方法则太慢。对于各种方法构建分子进化树的准确性,一篇综述(Hall BG. Mol Biol Evol 2005,22(3):792-802)认为贝叶斯的方法最好,其次是ML,然后是MP.其实如果序列的相似性较高,各种方法都会得到不错的结果,模型间的差别也不大。对于NJ和ML,是需要选择模型的。对于各种模型之间的理论上的区别,这里不作深入的探讨,可以参看

    • 分子进化(molecularevolution)

             生物进化过程中生物大分子的演变现象。主要包括蛋白质分子的演变、核酸分子的演变和遗传密码的演变。(1)蛋白质分子的演变;可以肌红蛋白(Mb)和血红蛋白(Hb)的分子演变来说明。在无颌类脊椎动物(如七鳃鳗),运输O2 的球蛋白只有Mb,而在绝大多数脊椎动物中,运输O2 的球蛋白有Mb和Hb。据研究,Mb由一条多肽链组成,含有153个氨基酸残基;成人血红蛋白(Hb-A)由两条α链和两条β链组成,(即α2 β2 ),α链含141个氨

    • 分子进化速率

      分子进化速率取决于蛋白质或核酸等大分子中的氨基酸或核苷酸在一定时间内的替换率。生物大分子进化的特点之一是,每一种大分子在不同生物中的进化速度都是一样的。蛋白质分子进化速率计算公式:Kaa =(daa /Naa )/2T。daa 为两种同源蛋白质中氨基酸的差异数,Naa 为同源蛋白质中氨基酸残基数,T为2种生物的分歧进化时间。每个密码子每年的突变频率约为(0.3-9)*10-9  

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