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- 2026年01月17日
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上海吉凯基因
- 服务名称：
相对定量蛋白质组学
1.服务简介：非标记定量蛋白质组学（Label-free）技术
2.服务内容：大规模定量比较样本中的蛋白质表达水平。
3.适用范围：细胞、组织、胶、血清血浆、体液、亚细胞结构、FFPE等。
4.服务流程：蛋白质抽提、酶切、质谱分析、数据库比对、生物信息学分析以及多层次的质量控制。
上海吉凯基因医学科技股份有限公司
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文献和实验非标记定量蛋白质组学 (Label Free)近年来成为重要的质谱定量方法，按照其原理进行分类，可以分为两类。Spectrum counts类的非标记定量方法，发展比较早，也形成了多种算法进行定量，但是主要的原理都是根据MS2的鉴定结果作为定量的基础，各种方法的差别在于后期算法在大规模数据上的修正。第二种非标记定量方法的原理是以MS1为基础，计算每个肽段信号在LCMS质谱上的积分，目前Label Free主要的数据分析方法是利用Maxquant软件，根据一级质谱相关的肽段峰强度、峰面积、液相
基于MS强度或计数的数据依赖法非标记定量蛋白质组学的蛋白质互作分析（一）
本期要介绍到的是基于MS强度或计数的数据依赖法非标记定量蛋白质组学的蛋白质互作分析。 在试验中使用不同的同位素标记（某些情况下等压标记）是一种行之有效的肽和蛋白质定量方法。通常，分析之前，标记样品和未标记样品是混合在一起的，这时可以通过测量相应的峰值强度来直接确定化合物比率。标记大致可以分成这些共价附着在肽上的标记，包括同位素编码的亲和标签、ICAT或iTRAQ、通过酶反应合成（例如通过胰蛋白酶合成18O）或通过代谢合成（例如在细胞培养中用氨基酸标记稳定同位素）、SILAC等。在蛋白质互作
行串联质谱分析，可同时比较4种或8种不同样品中蛋白质的相对含量或绝对含量。 iTRAQ技术特点： 不同样本标记之后混样，统一处理上机，减少了分别上机造成的实验误差，并利用同位素标签的丰度来检测，定量更准确，重复性更好； 由于需要标记试剂标记，因此成本相对较高； 通量高，在一次实验中最多可同时比较8个样品； 利用基于同一个参考样品的办法，可以进行多于8个样品的定量比较； iTRAQ的覆盖度高、灵敏度高。 Label-Free定量蛋白质组学分析 Label-Free定量，即非标记的定量蛋白质组学
