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深圳市拓普生物科技有限公司
拓普生物可为circRNA研究提供“高通量测序+生物信息学分析+下游功能验证”一站式服务！
CircRNA简介
circRNAs(Circular RNAs，环状RNA)是一类不具有5' 末端帽子和3' 末端poly(A)尾巴，并以共价键形成环形结构的非编码RNA分子。circRNA主要由pre-mRNA通过可变剪切加工产生，广泛存在于各种生物细胞中，具有结构稳定、丰度高、物种间保守性高，表达具有组织及时空特异性等特征。
近年研究发现，circRNA可能具有重要的调控功能，circRNA可以作为“sponge”海绵吸附miRNA ，阻断miRNA对其靶基因的抑制作用； circRNA通过碱基互补配对直接调控其他RNA水平；circRNA还能与蛋白质结合,调控蛋白的活性。由于circRNA对核酸酶不敏感，所以比线性RNA更为稳定，这些特点使得circRNA 在新型疾病诊断与治疗方法的开发应用上具有明显优势。但目前对circRNA的研究刚刚起步，其生物学功能和调控机制有待挖掘，是一个值得深入的研究方向。
CircRNA的功能
circRNA研究方案
技术路线：
1.筛选cirRNA（寻找差异表达的circRNA）：RNA-seq、芯片、生物信息学分析。
2.circRNA鉴定及定位：RT-PCR、Sanger测序、Northern blot分析、RNA-Fish。
3.circRNA 表达分析：细胞水平、组织水平、临床样本验证。
4.circRNA体外功能验证：circRNA过表达或干扰、细胞转染、细胞划痕实验、transwell迁移和侵袭实验等。
5.circRNA体内功能验证：circRNA过表达或干扰、或构建异种移植模型、免疫组织化学、RT-QPCR、WB等。
6.机制研究：序列预测比对、设计microRNA探针和circRNA探针、 RNA pulldown、RT-QPCR、 双荧光素酶报告系统确定结合位点。
CircRNA简介
circRNAs(Circular RNAs，环状RNA)是一类不具有5' 末端帽子和3' 末端poly(A)尾巴，并以共价键形成环形结构的非编码RNA分子。circRNA主要由pre-mRNA通过可变剪切加工产生，广泛存在于各种生物细胞中，具有结构稳定、丰度高、物种间保守性高，表达具有组织及时空特异性等特征。
近年研究发现，circRNA可能具有重要的调控功能，circRNA可以作为“sponge”海绵吸附miRNA ，阻断miRNA对其靶基因的抑制作用； circRNA通过碱基互补配对直接调控其他RNA水平；circRNA还能与蛋白质结合,调控蛋白的活性。由于circRNA对核酸酶不敏感，所以比线性RNA更为稳定，这些特点使得circRNA 在新型疾病诊断与治疗方法的开发应用上具有明显优势。但目前对circRNA的研究刚刚起步，其生物学功能和调控机制有待挖掘，是一个值得深入的研究方向。
CircRNA的功能
circRNA研究方案
技术路线：
1.筛选cirRNA（寻找差异表达的circRNA）：RNA-seq、芯片、生物信息学分析。
2.circRNA鉴定及定位：RT-PCR、Sanger测序、Northern blot分析、RNA-Fish。
3.circRNA 表达分析：细胞水平、组织水平、临床样本验证。
4.circRNA体外功能验证：circRNA过表达或干扰、细胞转染、细胞划痕实验、transwell迁移和侵袭实验等。
5.circRNA体内功能验证：circRNA过表达或干扰、或构建异种移植模型、免疫组织化学、RT-QPCR、WB等。
6.机制研究：序列预测比对、设计microRNA探针和circRNA探针、 RNA pulldown、RT-QPCR、 双荧光素酶报告系统确定结合位点。
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文献和实验相关实验
和元生物
proteins are visualized in the pellet fraction （P） after centrifugation of the reaction. 由于膜蛋白的过表达可能对细胞有毒性，并且在纯化时很难选择合适的溶解试剂，再加上目前对膜蛋白晶体培养缺少有效方法和模型，所以要想顺利地获得膜蛋白的三维数据更是难上加难。幸亏技术总在进步，创新的产品也不断涌现。QIAGEN在2009年推出了膜蛋白的整体解决方案
Western Blot（Tian Su et al., ACS Nano. 2019） 外泌体高通量检测 外泌体内含有与细胞来源相关的蛋白质和核酸，可以运输蛋白质、mRNA、miRNA、lncRNA、circRNA等进入受体细胞，参与细胞间通讯。不同细胞来源的外泌体所含有的蛋白成分和RNA不太相同，可作为多种疾病的早期诊断标记物，也能作为靶向药物的载体进行疾病治疗。 miRNA高通量测序 mRNA高通量测序 lncRNA芯片（人、小鼠） ceRNA芯片（人、小鼠） 蛋白
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