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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 保存条件:
低温运输
- 保质期:
长期
- 英文名:
Endonuclease V
- 库存:
550
- 供应商:
北京百奥莱博科技有限公司
特别声明:本产品及我公司所售其他产品均为科研类试剂产品,严禁用于药物、医疗及其他非科研用途。
百奥莱博专业生产销*(代"售")核酸内切酶V 工具酶,我公司供应的分子生物学试剂品类齐全,且具有优势价格,欢迎新老客户垂询订购。
名称:核酸内切酶V 工具酶
规格:250U
品牌:百奥莱博
编号:BTN130640
核酸内切酶V是在E.coli中发现的一种DNA修复酶。它识别DNA中的脱氧次黄嘌呤核苷,即脱氧腺苷的去*基产物。核酸内切酶V,也称为脱氧次黄嘌呤核苷3´内切酶,识别含脱氧次黄嘌呤核苷(无论配对与否)的双链或单链DNA 。也可识别含脱碱基(AP)位点或尿素、碱基错配、插入/缺失错配、发夹结构、未配对loop环、折叠flaps和类 -Y型结构的DNA,但是识别后者的能力不如前者。普遍认为核酸内切酶V发挥DNA修复功能时,还需另外一种蛋白的存在,因为它不能切除 DNA上的脱氧次黄苷或受损碱基。核酸内切酶V对错配脱氧次黄嘌呤核苷3´端第二个或第三个磷酸二酯键进行切割,切割第二个磷酸二酯键的效率是95%,第三个磷酸二酯键的效率是5%,产生一个3´羟基、5´磷酸的切刻。
产品特点:
➤ 切割错配;
➤ 切割含脱氧次黄嘌呤核苷的寡核苷酸,对含错配碱基的寡核苷酸亲和力较弱。
产品组成:
| 成分 | 规格 |
| 核酸内切酶V(10000 U/mL) | 25μL |
| 10×Buffer | 1ml |
| 使用手册 | 1份 |
储存条件:低温运输,-20℃保存,有效期一年。
热失活:65℃,20分钟。
活性定义:1单位指在10μl反应体系中,37℃条件下1小时内,能够切割1pmol含单脱氧次黄嘌呤核苷位点的34bp寡核苷酸双链所需要的酶量。
脱氧次黄嘌呤核苷位点的制备:合成34bp寡核苷酸双链时,在其一条链的中间掺入脱氧次黄嘌呤核苷(dI)碱基。
除核酸内切酶V 工具酶外,我公司正在打折促销以下产品:
·一管式点突变试剂盒
编号:BTN100212
英文名称:One-Tube Mutagenesis Kit
规格:10次
基因的定点突变是重要的分子生物学技术,广泛用于载体构建、基因改造、蛋白质功能研究等领域。但传统的方法需要使用单链DNA 模板,而得到单链DNA 模板又需要先将基因克隆到类似M13 这种载体中,操作过程冗长。为了克服这些缺点,本公司将突变位点设计到一对互补的引物中,用高保真扩增质粒模板,然后用Dpn I 去除原始的甲基化模板,新合成的DNA 通过互补形成带切口的双链质粒,直接用于转化感受态细菌。
产品特点:
1. 直接使用质粒DNA作为模板,免去了制备单链DNA的步骤。
2.基于高保真PCR,对模板DNA 序列没特殊要求,可以用于突变任何序列。同时对模板的需求量很少。
3.一管式,全部在一个优化的缓冲体系中完成,非常简单。
4. 使用Dpn I 去除未突变模板,突变效率高达90%。
5.可用于制备点突变,缺失突变和插入突变。
6. 本产品A型适用于8 kb以下,B型适用于8-15 kb。
试剂盒组成:
| 成分 | 10T(A型) | 10T(B型) |
| 高保真酶A型 | 10μl | 无 |
| 高保真酶B型 | 无 | 10μl |
| 5×高保真酶Buffer A型 | 100μl | 无 |
| 5×高保真酶Buffer B型 | 无 | 100μl |
| dNTP(2.5mM each) | 50μl | 50μl |
| Dpn I酶 | 10μl | 10μl |
| 超纯水 | 1ml | 1ml |
储存条件:低温运输、-20℃保存,有效期一年。
使用方法:
一、引物设计及注意事项
用于特定基因突变的引物必须用户单独设计,请参考如下一些基本原则进行设计。
1. 共需设计两条完全互补的一对引物,它们覆盖要扩增的突变区位点,突变位点最好放在引物的中心。可以先集中设计一条,然后就可得互补的另一条引物。
2.引物的长度通常为25-45个碱基。引物中突变位点任何一侧都必需满足Tm大于45的条件,Tm 计算方式为Tm=4×(GC 碱基数)+2×(AT 碱基数)。例如引物agtcaggccaattcgAAGcagtcgaattgccaag 就达到此标准,它的突变位点AAG 所放位置使左侧Tm=46;右侧Tm=48,均大于45。
3. 尽量把引物的GC含量控制在40%-60%,结尾的1-3个碱基最好是G或C。
4. 尽量使引物不要产生非常稳定的二级结构和引物二聚体。
5. 最好使用经过PAGE 纯化的引物或更高纯度的引物。
二、待突变模板质粒的选择
1. 必需使用从dam+的大肠杆菌(这类菌中质粒可以被甲基化)中抽提得到的质粒用于基因定点突变,否则Dpn I 不能把没有酶切的质粒DNA 切除,产生大量的假阳性。常用的大部分大肠杆菌都是dam+的,包括DH5α、JM109等。不能使用JM110和SCS110以及其它dcm-菌种。
2. 待突变质粒和目的基因的GC含量应该在40-55%,没有任何GC含量超过70%、长度在50bp以上的区域。如果质粒GC含量过高,请先把目的基因克隆到其它合适的载体上,再进行基因定点突变反应。如果目的基因GC含量过高,而突变位点不在高GC含量区域,可以先把该基因的不含高GC含量的一个区域克隆出来,进行定点突变,然后再把突变后的片断克隆回原基因中。如果突变位点在高GC 区,则可以使用高GC 专用PCR反应试剂。
三、基因定点突变反应
1.在一个塑料离心管中加入下列成分:
| 待突变模板质粒 | 0.1-0.5μg |
| 5×高保真酶Buffer | 10μl |
| 引物一(10-20 uM) | 1μl |
| 引物二(10-20 uM) | 1μl |
| dNTP Mix(2.5mM each) | 4μl |
| 补水到 | 49μl |
2. 加入1μl高保真DNA聚合酶,混匀,如果PCR仪没有热盖则需要加少量石蜡油。放入PCR仪器中按下面参数进行PCR:
| 步骤 | 温度 | 时间 | 循环数 |
| 变性 | 95℃ | 1min | 1次 |
| PCR | 95℃ | 40s | 18次 |
| 60℃ | 1min | ||
| 68℃ | 1min/Kb | ||
| 延伸 | 72℃ | 10min | 1次 |
| 保存 | 4℃ | 长时间保持 |
四、Dpn I消化
PCR反应后,直接在PCR反应体系中加入1μL Dpn I内切酶(该酶在甘油保存液中会下沉到管底,故用前需要充分混匀)。DpnI可以酶切双链都被甲基化的模板质粒,也能降解一条链被甲基化的双链质粒。混匀后37℃孵育2小时后样品可以直接用于转化,或者-20℃保存备用。
五、转化、挑克隆鉴定:
每100 微升感受态细菌(转化效率必须在107/μg以上)中可以加入5-10微升经过Dpn I 消化后的突变产物,按照所使用的感受态细菌的操作方法进行操作。如果PCR 使用了石蜡油,在转化时千万别把它带入转化反应,否则会严重影响转化效率。
在涂板前通过离心浓缩的办法,把所有被转化后的细菌全部涂布到含有适当抗生素的平板上培养过夜。通常会得到50个以下的克隆,可按常规方法制备质粒并测序。
六、常见问题:
1.转化后没有克隆或克隆数极少:
(1)感受态细菌效率不够高,请检测一下感受态细胞的效率,确保转化效率在107/μg。
(2)把Dpn I 消化后的产物用常规的乙醇沉淀浓缩,这样就可以把所有的产物全部用于转化。
(3)优化基因定点突变中的PCR参数。可以把最初的95℃变性时间延长为2分钟,循环中95℃变性的时间延长至1分钟,把循环中的68℃的延伸时间改为1.5分钟/kb 至2分钟/kb,退火可以改为60-55℃或65-55℃等的touch down,退火时间也可以适当延长。
(4)引物设计有问题。通过突变反应中的PCR 没有很好地扩增出预期的突变质粒。
2.有克隆,但没有或很难检测到预期的突变克隆:
使用的待突变的模板质粒量过多,导致Dpn I 消化时不完全,可减少质粒用量。
3. 有突变克隆,但突变位点不是预期的位点:
(1)引物设计不佳,退火温度过低,导致引物退火到错误的地方。
(2)引物质量较差,没有经过PAGE 纯化。这样引物中通常会含有比设计的引物要短的特异性较差的引物,容易导致非预期的突变。
核酸内切酶V 工具酶关键词:核酸内切酶V,Endonuclease V,BTN130640
·凝胶法内毒素半定量试剂盒
编号:BTN130504
英文名称:Endotoxin semi-quantitative kit(Gel Method)
规格:10×0.1mL
本试剂盒又称鲎试剂,为鲎科动物东方鲎的血液变形细胞溶解物的冷冻干燥品。鲎试剂中含有C因子、B因子、凝固酶原、凝固蛋白原等。在适宜的条件下(温度,pH值及无干扰物质),细菌内毒素激活C因子,引起一系列酶促反应,使鲎试剂产生凝集反应形成凝胶。
试剂盒组成:
| 成分 | 规格 |
| 鲎试剂,灵敏度0.06 EU/mL | 0.1ml×10支 |
| 说明书 | 1份 |
储存条件:常温运输,阴凉处避光保存,有效期两年。
使用方法:
一、样品溶液的制备
样品的pH值应在6.0–8.0 之间,若超出此范围,需用无热原缓冲液或0.1N*氧化*、0.1N 盐*(代"酸")调节。若样品中可能存在鲎实验的干扰物质,见本说明书4.2“样品的干扰实验”。若样品中可能含有导致鲎试剂中G 因子旁路反应的(1,3)β-D-葡聚糖,需选用不会对(1,3)β-D-葡聚糖起反应的特异性鲎试剂。
二:细菌内毒素标准溶液及对照液的准备
2.1细菌内毒素标准溶液(本试剂盒不提供)
取细菌内毒素工作标准品1支,按《细菌内毒素工作标准品使用说明书》配制2λ ,1λ ,0.5λ,及0.25λ的一系列内毒素标准溶液(λ为鲎试剂灵敏度标示值)。备用。
注:鲎试剂灵敏度复核实验见本手册其他常用实验方案。
2.2 阴性对照液:即无内毒素水。
2.3 阳性对照液:即浓度为2λ的内毒素标准溶液。
2.4样品阳性对照液:即添加浓度为2λ内毒素标准的样品溶液。
三:内毒素检测
3.1 鲎试剂的溶解:按标示量(本试剂盒为0.1mL/支)加无内毒素水于鲎试剂中,轻轻振摇使鲎试剂完全溶解。注意不要引起气泡,溶解后的试剂应在10 min内使用(即配即用)。
3.2样品溶液的制备
样品最大有效稀释倍数(MVD)的计算:
MVD= C•L/λ
λ:测试用鲎试剂灵敏度标示值(EU/mL);L:样品细菌内毒素限值;C:样品浓度或样品复溶后所得样品浓度。当L 单位为EU/mL(溶液)时,C的单位为1mL/mL;当L单位为EU/mg或者EU/U时,C的单位为mg/mL或者U/mL。按照计算所得体积,加无内毒素水制备样品溶液。
3.3 各反应管中分别加入0.1mL 阴性对照液,阳性对照液,样品,或样品阳性对照液。
封闭管口,轻轻摇匀,垂直放入37℃的恒温器中温育60分钟±2分钟,温育期间避免振动。
3.4 结果判断
3.4.1 将试管从恒温器中轻轻取出,缓慢倒转180°。若管内的内容物呈坚实凝胶,不变形,不从管壁滑脱为阳性,记录为(+);不呈凝胶或虽生成凝胶但不能保持完整并从管壁滑脱为阴性,记录为(-)。
3.4.2 只有当阴性对照管结果均为阴性,阳性对照管、样品阳性对照管结果均为阳性,实验方有效,否则无效。若阴性对照管为阳性,提示鲎试剂、无内毒素水或实验器具可能受到污染。若阳性对照管为阴性,提示鲎试剂活性减失、内毒素标准溶液效价降低,鲎试剂的灵敏度或内毒素的效价标示不准确,或内毒素标准溶液的稀释不正确。若样品阳性对照管为阴性,提示反应体系内有干扰因素存在。
四:其他常用实验方案
4.1 鲎试剂灵敏度复核实验
当使用新批号的鲎试剂或实验条件发生了任何可能影响检验结果的改变时,应按《中华人民共和国药典》2010 版中《细菌内毒素检查法》的“鲎试剂灵敏度复核实验”进行实验。按照下式复核灵敏度:λ=lg-1(ΣX/4),当0. 5λ≤λ ≤2.0λ时,鲎试剂灵敏度复核合格,检测时仍以标示灵敏度λ为准。
4.2样品的干扰实验
当鲎试剂、样品的来源、配方、生产工艺或实验环境中发生了任何有可能影响实验结果的变化时,须按《中华人民共和国药典》2010 版中《细菌内毒素检查法》的“干扰实验”进行干扰实验。以样品代替无内毒素水为溶剂,配制2λ,λ,0.5λ,及0.25λ的内毒素系列标准溶液进行灵敏度复核。若灵敏度复核值在0.5λ 到2λ之间(包含0.5 λ及2 λ),则认为在此实验条件下样品无干扰。若灵敏度复核值在0.5λ 到2λ之外,则认为在此实验条件下样品有干扰,需对样品进行稀释(稀释倍数不得超过最大有效稀释倍数MVD)或进行其它处理消除干扰。
4.3凝胶限度实验
凝胶限度实验用于判断样品的内毒素含量是否超过药典所规定的细菌内毒素限值。按《中华人民共和国药典》2010 版中《细菌内毒素检查法》的“凝胶限度实验”进行实验。在实验有效的情况下,如果样品管的两个平行管均为阴性,判定样品的内毒素含量小于药典规定限值。如果样品管的两个平行管均为阳性,判定样品的内毒素含量不符合药典规定。如果样品管的两个平行管一管为阳性,另一管为阴性,需进行复试。复试时,样品需做4个平行管,若所有平行管均为阴性,判定样品符合规定,否则判定样品不符合规定。
4.4凝胶半定量实验
本方法系通过确定反应终点浓度来量化样品中内毒素含量。详见《中华人民共和国药典》2010 版中《细菌内毒素检查法》的“凝胶半定量实验”。
核酸内切酶V 工具酶关键词:核酸内切酶V,Endonuclease V,BTN130640
·一步式RT-PCR Mix
编号:BTN130609
英文名称:One-Step RT-PCR Mix
规格:1mL
本产品是基于Tth DNA聚合酶的单酶一管式RT-PCR试剂盒。Tth DNA聚合酶通过其逆转录酶活性合成cDNA,再通过其DNA聚合酶活性进行PCR扩增。它跟常规MMLV和AMV的最大区别是逆转录过程可以在高温进行,能有效打开RNA的二级结构,其示意图如下:
同时操作简单一步完成,其操作流程图如下:
产品特点:
1.中途添加试剂,省去反复打开和关闭反应管盖的麻烦,便于同时处理多个检测样品。
2.样品之间的交叉感染和纵向感染的危险性比较低,可以避免假阳性。
3. 改良了酶的品质,实现了优良的检测敏感度。
4. 即开即用,非常方便。
储存条件:低温运输,-20℃保存,有效期一年。
北京百莱博科技有限公司是工具酶产品的专业生产供应销*(代"售")商,恭候您的咨询选购核酸内切酶V 工具酶。
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文献和实验相关专题 重组DNA技术工具酶 DNA重组 技术中对核酸的“精雕细刻”主要用酶作为工具。分子生物学研究过程中发现的酶,许多都用作工具,表20-列出最常用的几种工具酶。限制性核酸内切酶(restriction endonuclease)在重组DNA技术中有重要地位,在此较详细介绍。 一、限制性核酸内切酶的概念 核酸酶可分为两类:核酸外切酶(exonuclease)是从核酸的一端开始,一个接一个把核苷
在核酸水解酶中,为可水解分子链内部磷酸二酯键生成寡核苷酸的酶,与核酸外切酶相对应。从对底物的特异性来看,可分为 DNaseⅠ、 DNaseⅡ等仅分解 DNA的酶;脾脏 RNase、 RNaseT1 等仅分解 RNA的酶。如链孢霉( Neurospora)的核酸酶就是既分解 DNA又分解 RNA的酶。一般来说,大都不具碱基特异性,但也有诸如脾脏 RNase、 RNaseT1 等或限制性内切酶那种能够识别并切断特定的碱基或碱基序列的酶。
体的繁殖,把这类酶称为限制性核酸内切酶。 限制性核酸内切酶的分类 根据其识别和切割序列的特性、催化条件及修饰活性等,一般将限制酶分为I,Ⅱ,Ⅲ 三大类。 I 类:不适用于基因工程。只在肠道菌中发现。 Ⅱ类:基因工程的工具酶。Ⅲ类:切割位点不在识别位点,一般离识别位点25 bp~27 bp,对分子克隆操作亦无实用意义。 限制性核酸内切酶的命名原则 限制酶的命名是采用Smith和Athens提议的方案,即名称的第个1字母取自它来源细菌属名的第1个字母,大写;第2,3二个字母取自它来源细菌
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