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基因敲除/敲入动物建模
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艾柏森(北京)生物科技有限公司
一种来源是细菌获得性免疫的由RNA指导Cas蛋白对靶向基因进行修饰的技术。细菌利用该系统可抵御噬菌体入侵。CRISPR/Cas系统可以识别出外源DNA,并将它们切断,沉默外源基因的表达。在自然界中,CRISPR/Cas系统拥有多种类别,其中CRISPR/Cas9系统是研究最深入,应用最成熟的一种类别。具有成本低廉,操作方便,效率高等优点。

其基本作用原理为:当噬菌体病毒首次入侵宿主细菌,病毒的双链DNA被注入细胞内部。CRISPR/Cas系统会从这段外源DNA中截取一段序列作为外源DNA的“身份证”,然后将其作为新的间隔序列被整合到基因组的CRISPR序列之中。因此,这段与间隔序列对应的“身份证”被称为原间隔序列(protospacer),原间隔序列向两端延伸的几个碱基都十分保守,被称为原间隔序列临近基序(protospacer adjacent motif,PAM)。Cas9 蛋白含有两个核酸酶结构域,可以分别切割与crRNA 杂交的DNA单链(类HNH蛋白功能区)和解旋的游离单链(类RuvC蛋白功能区)。Cas9 首先与crRNA 及 tracrRNA 结合成复合物,然后通过 PAM 序列结合并侵入 DNA,形成 RNA-DNA 复合结构,进而对目的DNA 双链进行切割,使 DNA 双链断裂。
流程:
1. 在把基因序列中寻找NGG序列获得其附近20多个碱基的系列,与tracrRNA序列融合,设计出sgRNA(small-guide RNA)并合成该序列
2. 将该序列以及cas9基因连入载体
3. 转化感受态,质粒小提,测序验证
4. 细胞培养与转染
5. 建立稳定的敲除细胞株
网址:
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文献和实验选育新方法。而 CRISPR-Cas9 技术的出现,更是极大推动了微生物基因组编辑准确性和效率的提高。【背景】泓迅科技利用 CRISPR-Cas9 技术编辑酵母菌中的一个 920bp 的 ADE1 基因。ADE1 是腺嘌呤合成相关基因,如果 ADE1 失活,则细胞将会积累红色色素,呈现红色菌落。【方法】1、质粒构建2、sgRNA 活性检测3、挑选活性较高的 sgRNA 进行基因组定点编辑4、利用基因功能变化、表性变化和测序等方法检测基因定点修饰结果。【结论】1、从颜色表型变化得知,酵母菌落变成红色菌落,可知 ADE
最近,随着基因编辑技术不断曝光,这项技术也越来越火,越来越受到关注,但大部分媒体都只是浅尝辄止进行宣传而已,实质性的怎么操作,具体的步骤却很少涉及。鉴于此,师兄就把张峰的手稿扒拉出来,分享给大家。同时也欢迎大家与我探讨,我的微信号;shixiongcoming,向我申请的时候注意,写上你的理由哦,最近加我的人太多,不注明来由的读者,别怪师兄拒绝你呦。 Genome Engineering Using CRISPR-Cas9 System Le Cong
CRISPR/Cas 是进行基因编辑的强大工具,可以对基因进行定点的精确编辑。在向导 RNA(guide RNA, gRNA)和 Cas9 蛋白的参与下,待编辑的细胞基因组 DNA 将被看作病毒或外源 DNA,被精确剪切。一、寻找目的基因的靶标使用在线设计网站 CRISPR direct,如需直接复制网址,可在生物学霸后台对话框回复 direct即可。靶点挑选要点:基因敲除靶点应设计在起始密码子附近(包括起始密码子)或者起始密码子下游的外显子范围内。不同 Cas9/gRNA 靶点在基因敲除效率
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