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简单重复序列检测技术服务

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  • LMAI Bio
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  • 2025年09月27日
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      SSR Detection Service

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    • 供应商

      联迈生物

    • 规格

      30个

    简单重复序列检测技术服务
    简单重复序列检测技术服务
    服务介绍
    SSR,简单重复序列,又叫微卫星DNA(Simple Sequence Repeat),是指基因组中由1-6个核苷酸组成的基本单位重复多次构成的一段DNA,广泛分布于基因组的不同位置,长度一般在200 bp以下。SSR标记又称为序列标签微卫星位点(sequence tagged microsatellite site),简写为STMS,是目前最常用的微卫星标记之一。SSR多态性检测原理图如下:

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      ,所以它们又被称为自私基因。CENSOR 通过比对数据库 Repbase 识别标注基因组重复序列,还可以进行简单重复的从头检测(denovo detection,包括由几个序列基序组成的简单重复)。RepeatMasker 可以通过比对 Repbase 及 Dfam 数据库检测 DNA 序列中的间隔重复序列和低复杂度序列。HTT 数据库可以根据关键词检索不同物种转座子横向转移事件,而垂直和水平遗传一致性分析 (VHICA) 可以检测上传的目标基因组内的转座子横向转移事件。

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