目录号: RN05
适用于快速提取各种细胞组织 miRNA 和其它各种小 RNA
本试剂盒按照指示储存 6 个月不影响使用效果。
- Wash Solution 1 和 Wash Solution 2/3 加入无水乙醇后,可常温保存一个月;如需更长时间保存,需放 4℃,但使用前应先回复到室温。
- Wash Solution 2/3 加入乙醇使用几天后可能出现沉淀晶体,不影响使用,直接不吸晶体、吸上清即可。
- 运输在常温下进行,不影响使用效果。
- 避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、PH 变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。
近年来对 RNA 干扰和调节性小 RNA 的广泛研究迫切需要一种能有效提取 15 - 30 核苷酸左右大小 RNA(包括 siRNA 和 miRNA)的试剂盒。但传统的 RNA 提取方法如硅胶膜不能有效吸附回收,酚 / 胍抽提和乙醇沉淀并不能有效沉淀回收微小分子 RNA。本试剂盒采用独特的裂解液 B - 硫基乙醇迅速裂解细胞和灭活细胞 RNA 酶,强烈有机抽提去除蛋白和 DNA,RNA 包括微小分子 RNA 吸附于离心柱内特殊硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗 — 离心的步骤,漂洗液将细胞代谢物、蛋白等杂质进一步去除,最后低盐的洗脱液将纯净 RNA 从硅基质膜上洗脱。
- 离心吸附柱内硅基质膜全部采用进口世界著名公司特吸吸附膜,柱与柱之间吸附量差异极小,可重复性好。克服了国产试剂盒膜质量不稳定的弊端。
- 也不需要乙醇沉淀等容易丢失微小分子 RNA 的步骤。
- 快速,简捷,单个样品操作一般可在 30 分钟内完成。
- 多次柱漂洗确保高纯度,OD₂₆₀/OD₂₈₀典型的比值达 1.9~2.0,基本无 DNA 残留,可用于 RNAi、RT - PCR、Northern - blot 和各种实验。
- 第一次使用前请先在 70% 乙醇、Wash Solution 1 瓶和 Wash Solution 2/3 瓶中加入指定量乙醇,加入后请及时打钩标记已加入乙醇,以免多次加入!
- 所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到 13,000 rpm 的传统台式离心机,如 Eppendorf 5415C 或者类似离心机。
- 需要自备乙醇,氯仿,一次性注射器,研钵。
- Lysis/Binding buffer 和 Wash Solution 1 含有刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。
- 预防 RNase 污染,应注意以下几方面:
- 经常更换新手套。因为皮肤经常带有细菌,可能导致 RNase 污染。
- 使用无 RNase 的塑料制品和枪头避免交叉污染。
- RNA 在裂解液中时不会被 RNase 降解。但提取后继续处理过程中应使用不含 RNase 的塑料和玻璃器皿。玻璃器皿可在 150℃烘烤 4 小时,塑料器皿可在 0.5M NaOH 中浸泡 10 分钟,然后用水彻底清洗,再灭菌,即可去除 RNase。
- 配制溶液应使用无 RNase 的水。(将水加入到干净的玻璃瓶中,加入 DEPC 至终浓度 0.1%(v/v),37℃放置过夜,高压灭菌。)
- RNA 纯度及浓度检测:
- 完整性:RNA 可用普通琼脂糖凝胶电泳(电泳条件:胶浓度 1.2%,0.5×TBE 电泳缓冲液;150v,15 分钟)检测完整性。由于细胞中 70%~80% 的 RNA 为 rRNA,电泳后 UV 下应能看到非常明显的 rRNA 条带,动物 rRNA 大小分别为 5kb 和 2kb,分别相当于 28S 和 18S rRNA,动物 RNA 样品中最大 rRNA 亮度应为次大 rRNA 亮度的 1.5 - 2.0 倍,否则表示 RNA 样品的降解。出现弥散片状或条带消失表明样品严重降解。
- 纯度:OD₂₆₀/OD₂₈₀比值是衡量蛋白质污染程度的指标。高质量的 RNA,OD₂₆₀/OD₂₈₀读数(10mMTris,pH7.5)在 1.8 - 2.1 之间。OD₂₆₀/OD₂₈₀读数受测定所用溶液的 pH 值影响。同一个 RNA 样品,假定在 10mM Tris,pH7.5 溶液中测出的 OD₂₆₀/OD₂₈₀读数 1.8 - 2.1 之间,在水溶液中所测读数则可能在 1.5 - 1.9 之间,但这并不表示 RNA 不纯。
- 浓度:取一定量的 RNA 提取物,用 RNase - free 水稀释 n 倍,用 RNase - free 水将分光光度计调零,取稀释液进行 OD₂₆₀、OD₂₈₀测定,按照以下公式进行 RNA 浓度的计算:终浓度(ng/μl)= (OD₂₆₀)×(稀释倍数 n)×40。
提示:
⚠️ 第一次使用前请先在 70% 乙醇、Wash Solution 1 瓶和 Wash Solution 2/3 瓶中加入指定量乙醇!
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组织培养细胞
a. 收集 < 10⁷悬浮细胞到一个 1.5ml 离心管。(对于贴壁细胞,孔板培养和细胞培养可以直接裂解,尽可能吸干所有培养液残留后直接加入 1ml 的 Lysis/Binding buffer,迅速轻摇使 Lysis/Binding buffer 充分和细胞底所有细胞接触裂解细胞并灭活 RNA 酶,轻轻用移液器反复吹打混匀按操作步骤下 3。)
b. 13,000rpm 离心 10 秒(或者 300g 离心 5 分钟),使细胞沉淀下来。完全弃去上清,留下细胞,注意不完全弃去上清会稀释裂解液导致产量纯度降低。
c. 轻弹管壁将细胞沉淀完全松散重悬,加入 1ml Lysis/Binding buffer,涡旋或者吹打,充分裂解混匀。
d. 按操作步骤下 3。
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动物组织(例如肝脑)
a. 新鲜组织用解剖刀迅速切成小碎块。根据处理组织的质量,按照 50 - 100mg 加入 1ml 的比例加入 Lysis/Binding buffer 后电动或者手动彻底匀浆。或者在液氮中研磨组织成细粉后,取适量组织细粉(约 50 - 100mg)转入装有 1ml Lysis/Binding buffer 的 1.5ml 离心管中,剧烈吹打涡旋混匀。
b. 可选,一般不需要:如果处理量大有明显颗粒或者不溶物,非常粘稠或者裂解不充分,可立即用带针头的一次性 5ml 的(0.9mm 针头)注射器抽提裂解物 10 次或直到得到满意匀浆结果(或者电动匀浆 30 秒);可以剪切 DNA,降低粘稠度和提高产量。
c. 按操作步骤下 3。
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室温放置 5 分钟以充分分离核酸蛋白复合物。
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加入 200μl 氯仿,剧烈振荡 15 秒。
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室温放置 2 - 3 分钟,13,000rpm 离心 10 分钟。
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小心取上清(约 600μl)转入到新的离心管,加入 1.5 倍体积的无水乙醇(必须是室温的,通常 900μl),涡旋混匀。此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心,立刻接下步。
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将混合物(每次小于 700μl,多可以分两次加入)加入一个吸附柱 RA 中,(吸附柱放入收集管中)12,000rpm 离心 30 - 60 秒,弃掉废液。
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加 700μl 70% 乙醇(请先检查是否已加入无水乙醇),12,000rpm 离心 30 秒,弃掉废液。
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加入 500μl Wash Solution 2/3(请先检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm 离心 30 秒,弃掉废液。加入 500μl Wash Solution 2/3,重复一遍。
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将吸附柱 RA 放回空收集管中,13,000 rpm 离心 2 分钟,尽量除去漂洗液,以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。
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取出吸附柱 RA,放入一个 RNase free 离心管中,根据预期 RNA 产量在吸附膜的中间部位加 30 - 50μl RNase free 水(事先在 100℃水浴中预热效果更好),室温放置 1 分钟,12,000 rpm 离心 1 分钟。
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如果预期 RNA 产量 > 30μg,加 30 - 50μl RNase free water 重复步骤 11,合并两次洗脱液;或者使用第一次的洗脱液加回到吸附柱重复步骤一遍(如果需要 RNA 浓度高)。
洗脱两道的 RNA 洗脱液浓度高,分两次洗脱合并洗脱液的 RNA 产量比前者高 15 - 30%,但是浓度要低,用户根据需要选择。
- 按照前面标准操作步骤 1 - 5 操作,直到得到上清。
- 较精确估计上清体积(约 600μl),加入等体积 70% 乙醇(请先检查是否已加入无水乙醇)(必须是室温的),涡旋或者吹打充分混匀,不要离心。
- 将混合物加入一个吸附柱 RA 中,(吸附柱放入收集管中)12,000 rpm 离心 30 - 60 秒,收集滤过物。将滤过物从收集管转移到一个新的离心管后,把吸附柱子放回空的收集管内,再加入剩下的混合物,离心,收集滤过物。合并两次滤过物,计算体积。
此时,滤过物含有 microRNA,吸附柱子上面是除去了 microRNA 的总 RNA(不包含 microRNA),如果需要,可以按照前面标准操作步骤 8 - 11 操作漂洗,洗脱回收得到去除了 microRNA 的总 RNA。
- 较精确估计滤过物体积,加入 0.65 倍体积无水乙醇(必须是室温的),涡旋或者吹打充分混匀,不要离心。
- 取一套新的 microRNA 吸附柱 MA,将上一步骤混合物(每次小于 700μl, 多可以分两次加入)加入 microRNA 吸附柱 MA 中,(吸附柱放入收集管中)12,000 rpm 离心 30 秒,弃掉废液。
- 按照前面标准操作步骤 8 - 11 操作漂洗,洗脱得到富集的 microRNA。
注意:不同的实验可以选择不同的方法,例如 NorthernBlot 或者表达芯片谱分析可以选择提取包括 microRNA 的总 RNA。富集方法提取的 microRNA 因为去除了较大片段的 mRNA 和 rRNA 等,可能减少某些下游试验的扩增背景,当背景较高或者非特异扩增较多时,可以尝试使用富集方法提取的 microRNA。
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