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- 2026年02月08日
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上海仁科生物科技有限公司
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NA
10x Genomics Chromium 系统全面出击，提供基因组、转录组、免疫组、表观组解决方案。
Chromium系统可在几分钟之内将样本封装到数百至数万个微反应体系，每个微反应体系中含有可唯一识别的编码DNA用于后续数据拆分及分析。
每个凝胶珠（Gel Bead），注入数百万独特的寡核苷酸序列，与样品混合，样品可以是高分子量（HMW）DNA，单个细胞，使用特征编码技术（Feature Barcoding Technology）标记的细胞，用转座酶处理的细胞核，或细胞珠（Cell Beads）。接下来凝胶珠和样品被油-表面活性剂溶液包裹，形成GEMs，其作为单独的反应囊泡，随后凝胶珠溶解并且样品被编码DNA所标记（如图1）。然后将每个液滴中含有10x barcode信息的产物混合，构建标准测序文库。待测序后，根据10x barcode序列进行HMW DNA，单细胞，单细胞核数据拆分，并利用10x Genomics提供的可特异性解析10x barcode的分析软件进行数据分析及可视化展示。
特点/优势
该系统每次运行提供8个通道，每个通道可以收集100-10000个细胞；
针对不同应用，每次细胞分装运行时间从4.5min-20min不等；
细胞捕获效率可高达65%；
测序结果中 doublet比例为0.9%/1000个细胞；
提供至少300万种序列标签，确保每个细胞均可获得唯一的标记；
针对V（D）J分析，可检出单个细胞的配对的TCR/BCR双链V(D)J全长序列；
针对单细胞CNV分析，单细胞CNV事件检出分辨率为2Mb，细胞亚群CNV事件分辨率可达百Kb级别；
针对单细胞ATAC分析，线粒体污染率低于2%；
提供试剂，设备及分析软件的完整解决方案；
*该系统可以提供基于Linked-Reads技术的长片段测序文库；
* 提供大于100万个独立反应体系；
*提供大于400万种标签序列，确保每个液体体系均可以获得唯一的标记；
*提供包含试剂，设备及分析软件Supernova，Long Ranger和Loupe Genome Browser的完整解决方案。
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文献和实验随着单细胞测序技术的不断发展，研究者除了可以对单个细胞的多个组学层面进行信息挖掘外，也可利用自动化平台来完成细胞图谱的绘制，实现大量细胞的分群。10x Genomics Chromium™ 平台从 2018 年初开始，利用该平台研究单细胞转录组就已发表 30 余篇文章，囊括了 CNS 等各大刊。可谓是自动化完成大规模单细胞研究的一项黑科技。2018 年 10x Genomics 平台部分高分文章■ 技术原理 10x Genomics Chromium™ 平台利用微流控技术进行单个
我们在学习westgard质控规则时，对于“10X”规则会看到类似于这样的描述：“1个水平的质控连续10次结果落在平均值（靶值线）的一侧或2个水平的质控同时各有连续5次的结果落在平均值（靶值线）的一侧，就判断为失控，该规则提示存在系统误差”。通过以上对10X描述的理解，我们就会很自然地将图1中的质控数据判定为失控： 图1 那我们再看一组在控的质控数据，如图2：
等方面的特性和差异。异质性存在于生殖细胞、胚胎细胞、神经细胞、免疫细胞、干细胞、肿瘤细胞等细胞中，这一特征使得单细胞测序研究具有重要意义，所谓的单细胞测序（single cell sequencing，SCS）是指对单个细胞进行 DNA 或 RNA 测序，在此我们主要介绍 10x Genomics Chromium™ 平台单细胞 3’端转录组测序的研究应用。10x 单细胞转录组的技术优势10x Genomics 的技术核心是利用微流控芯片对细胞进行精确区分，保证每个小反应体系（Gel Bead
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