10x Genomics Chromium 系统

10x Genomics Chromium 系统全面出击，提供基因组、转录组、免疫组、表观组解决方案。

图注：单个T细胞和编码凝胶微珠及反应试剂被油滴包裹封装形成的乳浊液滴，在Chromium系统内形成一个微反应体系。

Chromium系统可在几分钟之内将样本封装到数百至数万个微反应体系，每个微反应体系中含有可唯一识别的编码DNA用于后续数据拆分及分析。
每个凝胶珠（Gel Bead），注入数百万独特的寡核苷酸序列，与样品混合，样品可以是高分子量（HMW）DNA，单个细胞，使用特征编码技术（Feature Barcoding Technology）标记的细胞，用转座酶处理的细胞核，或细胞珠（Cell Beads）。接下来凝胶珠和样品被油-表面活性剂溶液包裹，形成GEMs，其作为单独的反应囊泡，随后凝胶珠溶解并且样品被编码DNA所标记（如图1）。然后将每个液滴中含有10x barcode信息的产物混合，构建标准测序文库。待测序后，根据10x barcode序列进行HMW DNA，单细胞，单细胞核数据拆分，并利用10x Genomics提供的可特异性解析10x barcode的分析软件进行数据分析及可视化展示。

特点/优势

该系统每次运行提供8个通道，每个通道可以收集100-10000个细胞；

针对不同应用，每次细胞分装运行时间从4.5min-20min不等；

细胞捕获效率可高达65%；

测序结果中 doublet比例为0.9%/1000个细胞；

提供至少300万种序列标签，确保每个细胞均可获得唯一的标记；

针对V（D）J分析，可检出单个细胞的配对的TCR/BCR双链V(D)J全长序列；

针对单细胞CNV分析，单细胞CNV事件检出分辨率为2Mb，细胞亚群CNV事件分辨率可达百Kb级别；

针对单细胞ATAC分析，线粒体污染率低于2%；

提供试剂，设备及分析软件的完整解决方案；

*该系统可以提供基于Linked-Reads技术的长片段测序文库；

* 提供大于100万个独立反应体系；

*提供大于400万种标签序列，确保每个液体体系均可以获得唯一的标记；

*提供包含试剂，设备及分析软件Supernova，Long Ranger和Loupe Genome Browser的完整解决方案。