影响因子高达 40.14,这是如何做到的?
丁香园
1660
随着单细胞测序技术的不断发展,研究者除了可以对单个细胞的多个组学层面进行信息挖掘外,也可利用自动化平台来完成细胞图谱的绘制,实现大量细胞的分群。
10x Genomics Chromium™ 平台从 2018 年初开始,利用该平台研究单细胞转录组就已发表 30 余篇文章,囊括了 CNS 等各大刊。可谓是自动化完成大规模单细胞研究的一项黑科技。
2018 年 10x Genomics 平台部分高分文章
■ 技术原理
10x Genomics Chromium™ 平台利用微流控技术进行单个细胞分选,其技术核心是含有 75 万种 Barcode 的油滴包裹的凝胶珠(GEM)。
1. 在 10 分钟内自动完成多至 80 000 个细胞的捕获;
2. GEM 形成后,细胞裂解,凝胶珠释放 Barcode 序列,此时每个细胞都被打上了独一无二的标记;
3. mRNA 逆转录产生带有 Barcode 和 UMI 信息的 cDNA;
4. 以 cDNA 为模板进行 PCR 扩增,建库、测序;
5. 数据分析,此时 Barcode 标记细胞,UMI 标记转录本并用于后续定量。
10x Genomics Chromium™ Single Cell 3' Solution 平台实验流程