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- 2026年03月20日
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上海仁科生物科技有限公司
大家好，我是Chromium X，你看这细胞贼多，分群贼清楚！
10x Genomics自2016年进军单细胞领域以来，最开始以经典款仪器——Chromium Controller不断开发新应用，解锁单细胞多组学。随后，为了解放科研人员的双手，减少人为误差，又推出了单细胞捕获自动化工作站—— Chromium Connect。然而，就在最近，为了满足科研工作者对更高通量单细胞捕获的需求，10x 推出了Chromium X，即百万单细胞捕获的神器，带您探索更多可能！
为什么要用百万单细胞捕获神器——Chromium X？
但是，通过对近几年单细胞文章捕获的细胞数量的统计，我们也会发现，现在文章中所涉及到的细胞数目也越来越多了，更多的单细胞数据，有助于我们拿到更好的实验结果。
并且，在我们面对一些特定的科学问题的时候，我们确实是需要百万级别的单细胞才能解开一个真相，比如说：
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人类器官图谱构建。对于一个器官而言，其细胞的多样性绝不是几万甚至几十万个细胞就能彻底描绘的，我们需要做到百万级别的细胞数量，才能全面的描绘一个器官所有的细胞类型，这个时候，Chromium X无疑是我们更好的选择！
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CRISPR筛选。在CRISPR单细胞筛选的过程中，一般需要将一种gRNA导入到80-100个细胞中，然后看其对基因的扰动。如果我们有一个1万条gRNA的库，那么我们就需要捕获百万级别的单细胞来进行CRISPR筛选，这个时候，Chromium X将是我们研究的利器！
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T/B细胞克隆亚型分析。对于免疫研究的老师，大家都知道TCR/BCR的克隆亚型极其丰富，如果我们只测几万个细胞，是很难覆盖所有的克隆亚型的，这个时候，Chromium X将给您带来更大的帮助！
更重要的一点是，如果您使用Chromium X进行高通量单细胞捕获，还可以大大降低单个细胞的捕获成本。
Chromium X的单细胞捕获原理还是基于Next GEM的微流控捕获原理，细胞和反应试剂及Geal Beads被包裹在一个油滴里。每个油滴形成一个微反应体系，同细胞里的RNA被标记上相同的10x Barcoded。测序后，对单细胞数据进行拆分。不过，Chromium X有16个通道，每个通道最多可以捕获2万个单细胞。此外，现在10x Genomics的仪器还支持混样（CellPlex），一个通道最多可以混12个样本（混样的原理是在细胞上加脂质标签：https://pages.10xgenomics.com/rs/446-PBO-704/images/10x_LIT000106_Product_Sheet_Single_Cell_Gene_Expression_CellPlex_Letter.pdf），混样后，一个通道最多可以拿到4.6万个单个细胞，一次上机，最多可以拿到73万个单个细胞（该数字是去除双细胞拿到的最终单个细胞数量）。双细胞捕获率为0.4%/1000个细胞。上机一次运行的时间不超过18min。此外，X还加入了温控装置，确保拿到的数据质量更高。
高通量版本的Chromium X，不仅可以实现之前的Chromium Controller的单细胞3端转录组解决方案，同时还可以进行细胞表面蛋白的检测，CRISPR单细胞大规模筛选，靶向捕获，及混样（CellPlex）；还可以实现基于5端RNA捕获的单细胞免疫组解决方案，检测单细胞全长配对的VDJ序列，细胞表面蛋白检测，抗原特异性检测，靶向捕获，CRISPR筛选（2022年推出），混样（2022年推出）。此外Chromium X还可以兼容Chromium Controller 的试剂和芯片。也就是说，您可以直接将八个通道的Chromium Controller芯片用于Chromium X上，并且这个时候，我们就可以在Chromium X上实现Chromium Controlle的所有应用，如单细胞ATAC，单细胞ATAC+mRNA等。
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重量 ：18.8 kg
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体积：宽 x 深 x 高=28.6 厘米x 48.3 厘米x 27.3 厘
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电气要求：100–240 VAC, 50/60 Hz, 250 W，90–264 V 工作范围（额定值的 +/- 10%），过压类别 II（标准插座）
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工作温度：18–28°C
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湿度：30–80% R.H. 非冷凝
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海拔高度：0-2286 米
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电源线长度：2 m-包括特定国家/地区的适配器
10x内部数据测试，在Chromium X上用Chromium Controller的芯片和试剂（可以叫做标准试剂芯片）进行单细胞转录组，免疫组，ATAC及ATAC+mRNA的实验，然后与Chromium Controller仪器上获得的数据进行对比，发现二者的相关性系数很高，说明Chromium X完全兼容Chromium Controller的芯片和试剂，所以大家不必有顾虑！
此外，10x还在Chromium X上做了使用高通量试剂芯片和标准试剂芯片的数据比较。实验中使用新鲜骨髓穿刺样本，获取单细胞悬液，用130个抗体进行孵育，然后过流式筛选孵育上抗体的细胞，然后分别进行Chromium X高通量单细胞捕获和Chromium X标准通量捕获，最终标准通量捕获到8269个细胞，高通量捕获到17581个细胞，然后进行单细胞转录组，VDJ，细胞表面蛋白的检测。
根据检测结果，我们发现，高通量捕获的细胞数量多，更能检测出一些稀有的细胞类型，以及低丰度的TCR克隆亚型。
更多Chromium X信息，
请点击回顾Chromium X中文网络会议视频。
https://10xgenomics.wistia.com/medias/dej1cx90lt?mkt_tok=NDQ2LVBCTy03MDQAAAF-gQTI7pasgESYLaIRPyDs4J4Jo_Ssjrt2EL588qlBq6v7gGMYxBkh535LYh7stTIQhca7JwOXFgrKr-0krqlrjpANmxrScYSkWmkmzyCkCvKK3g
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文献和实验Clonality - X Chromosome Inactivation Assay
can utilize X chromosome inactivation (methylation) to determine the clonality status of a tumor or premalignant lesion in females. The technique is based on a methylation-sensitive restriction enzyme and analysis of a polymorphic locus on the X chromosome
Clonality - X Chromosome Inactivation Assay
Clonality - X Chromosome Inactivation Assay This method was successful in our lab using prostate tissue and for our specific objectives. Investigators must be aware that they will need to tailor the following protocol for their own research
随着单细胞测序技术的不断发展，研究者除了可以对单个细胞的多个组学层面进行信息挖掘外，也可利用自动化平台来完成细胞图谱的绘制，实现大量细胞的分群。10x Genomics Chromium™ 平台从 2018 年初开始，利用该平台研究单细胞转录组就已发表 30 余篇文章，囊括了 CNS 等各大刊。可谓是自动化完成大规模单细胞研究的一项黑科技。2018 年 10x Genomics 平台部分高分文章■ 技术原理 10x Genomics Chromium™ 平台利用微流控技术进行单个
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