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单细胞实时定量PCR技服务

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  • 单细胞qRT-PCR是在单细胞水平上对基因的表达进行实时定量分析的技术。常规的qRT-PCR所得结果是数以百万计的细胞的平均水平,只能说明基因在一个细胞群中大致的表达情况。
  • 2026年01月14日
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      单细胞实时定量PCR技服务

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      上海英拜生物科技有限公司

    单细胞实时定量PCR技服务
    单细胞qRT-PCR是在单细胞水平上对基因的表达进行实时定量分析的技术。常规的qRT-PCR所得结果是数以百万计的细胞的平均水平,只能说明基因在一个细胞群中大致的表达情况。由于细胞的异质性,相同组织的单个细胞实际上可能彼此不同,并扮演不同的角色。单细胞qRT-PCR技术不仅避免了组织水平分析时造成的异质细胞干扰,使得基因表达研究更加精细、准确,而且还能够检测导致细胞分型甚至细胞间惟一差别的表达特征,因而获得了极大关注。
    单细胞qRT-PCR技术为从单核苷酸水平深入研究癌症发生、发展机制及其诊断、治疗提供了新的研究思路并开辟了新的研究方向。近年来,该方法还被广泛应用于组织器官内细胞基因组的异质性研究、干细胞的异质性研究、以及临床指导的病理研究等各个方面。

    产品细节图片1
    实验流程:
    由于单个细胞中的mRNA数量很少,大约只有1 pg左右,因而与常规的RT-PCR相比,单细胞RT-PCR在各个环节上都有着显著差异。常规RT-PCR首先要将组织中的mRNA或总RNA抽提出来之后才能进行后续步骤,单细胞RT-PCR显然无法进行抽提步骤,因而在获取单个细胞后,在适当体积的裂解液中将细胞裂解,然后直接以裂解产物为模板进行RT-PCR。由于没有抽提,裂解产物中含有蛋白质、RNA以及基因组DNA等各种成分,蛋白质因其量极其稀少,可以忽略对单细胞RT-PCR的影响,但裂解产物中的基因组DNA相对于mRNA却有可能造成极大的干扰。避免这一影响有两种处理,一是在进行逆转录之前先用DNAaseⅠ消化基因组DNA,另一种方法就是在设计PCR引物时尽量使引物结合序列跨越相邻外显子的结合处。
    产品细节图片2
    参考文献:
    Kiyomi T, Tomoharu K, Hideki K(2009) Quantitative analysis of gene expression in a single cell by qPCR.Nat Methods. 6(7):503-6.
    Honsa P, et al. (2016) Generation of reactive astrocytes from NG2 cells is regulated by sonic hedgehog. Glia.
    Andrew MD, et al. (2013) Data exploration, quality control and testing in single-cell qPCR-based gene expression experiments. Bioinformatics. 29 (4): 461-467.
    White AK, et al. (2011) High-throughput microfluidic single-cell RT-qPCR.Proc Natl Acad Sci USA.108(34):13999-4004.

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    • 专家解惑:如何开展单细胞qPCR分析(二)

      。然而,生物学重复之间的误差就难以确定,因为无完美的对照存在。为了尽量减少单细胞之间的误差,我们一般平行运行全部单细胞qPCR分析(包括RNA分离、cDNA合成和实时定量PCR),并在一块PCR加热板中(如ABI 48孔、96孔或384孔板)。 (未完,待续)

    • 【原创】实时定量PCR中参照基因的选择

      就小量RNA的检测而言,与传统的RNA定量检测手段(如RNA印迹分析)相比,逆转录实时定量PCR(qRT-PCR)更为灵敏。实际上,这一技术足以定量单细胞的RNA水平。qRT-PCR应用的主要限制因素是结果的高不稳定性,这源于实验所用生物系统的不同,RNA提取方式的多样化以及逆转录反应和PCR效率的差异。 所有这些变量都使得实时定量PCR结果难以进行标准化处理。用于量化qRT-PCR结果的策略不止一种。其中的一种方法是使用标准曲线来推断靶基因的浓度。 最常用的方法是比较阈值法

    • 实时定量PCR应用中的问题

      一个拷贝目的基因的样本,也的确有人报导在特定的反应条件下,实时定量PCR 可以检测出单细胞水平的基因组DNA[11],但是在大多数情况下,对基因组DNA而言,它的最低检出限一般在pg到fg级,对于病毒、质粒而言,其检出限一般在102-103拷贝数以上[8]。影响实时定量PCR 敏感性的因素众多,除了对一般PCR反应均存在的影响因素如反应体系、Taq酶的活性之外,实时定量PCR还有其特殊的影响因素,包括: (1)反应体系中形成的引物二聚体的影响:引物二聚体是非特异性退火和延伸的产物,它的形成

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