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XagI (EcoNI)

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  • Thermo scientific -fermentas
  • ER1301
  • 2025年10月09日
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      大量

    • - FastDigest®限制酶
    • - 推荐的缓冲液 : R
    • - 孵育温度37°C
    • - 连接效率80%
    • - 热失活65°C, 20 min
    • - 基因组级别
    • - 蓝/白鉴定
    • - LO合格
    Catalog# Size, concentration Supplied with: Certificate of Analysis MSDS
    10X Buffer R 10X Buffer Tango™
    ER1301 1000 u (10 u/µl) 1.00 ml 1.00 ml ER1301
    Reaction conditions
    Recommended buffer for 100% activity Optimal temperature Enzyme activity in Fermentas buffers, % Tango™ buffer for double digestion
    B (blue)
    1X
    G (green)
    1X
    O (orange)
    1X
    R (red)
    1X
    Tango™ (yellow)
    1X / 2X
    R 37°C 0-20 20-50 50-100 100 20-50 50-100 1X or 2X

    Lambda DNA
    0.7%琼脂糖
    9 切割位点

    100%酶活性的反应条件
    1X 缓冲液R:
    10 mM Tris-HCl (pH 8.5, 37°C), 10 mM MgCl2 , 100 mM KCl, 0.1 mg/ml BSA。
    37°C酶切。

    保存缓冲液
    XagI保存在:
    10 mM Tris-HCl (pH 7.4, 25°C), 100 mM KCl, 1 mM DTT, 1 mM EDTA, 0.2 mg/ml BSA和50% (v/v)甘油。

    连接和重新酶切
    50倍XagI过量酶切后,大约80%的酶切产物可连接(20-40 u T4 DNA连接酶/1 μg酶切DNA),超过95%的连接产物可以重新酶切。

    琼脂糖包埋DNA酶切
    至少需要5 unit限制酶才能在16小时内完全切割1 µg琼脂糖包埋的λ DNA。

    商业化同裂酶
    采用REsearch™软件寻找同功酶。

    双酶切
    采用DoubleDigest™软件确定双酶切的最佳条件。

    甲基化影响
    Dam: 无重叠 – 不影响。
    Dcm: 可能重叠 – 不影响。
    CpG: 无重叠 – 不影响。
    EcoKI: 无重叠 – 不影响。
    EcoBI: 可能重叠 – 影响不确定。

    Methylation type Sequence Cleavage effect
    Dcm (CCWGG)

    5'...Cm5CT GG (N)3 AGG...3'
    3'...G GAm5CC (N)3 TCC...5'

    不阻止酶切
    Dcm (CCWGG)

    5'...Cm5CT GG NCm5CA GG ...3'
    3'...G GAm5CC NG GTm5CC ...5'

    不阻止酶切
    Cleavage efficiency close to the termini of PCR fragments
    bp from the recognition site to fragment end
    1 2 3 4 5
    20-50 50-100
    Number of recognition sites in DNA molecules
    Lambda ΦX174 M13mp18/19 pBR322 puc18/19 pUC57
    9 0 0 1 0 0
    pTZ19R/U pTZ57R pBluescriptIIKS(-/+) pBluescriptIISK(-/+) pACYC177 pACYC184
    0 0 0 0 1 1

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