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| Catalog# | Size, concentration | Supplied with: | Certificate of Analysis | MSDS | |
| 10X Buffer SacI | 10X Buffer Tango™ | ||||
| ER1132 | 5 x 1200 u (10 u/µl) | 2 x 1.00 ml | 1.00 ml | ER1132 | |
| ER1135 | 2000 u (10 u/µl) | 1.00 ml | 1.00 ml | ER1135 | |
| ER1137 | 500 u (10 u/µl) | 1.00 ml | 1.00 ml | ER1137 | |
| Recommended buffer for 100% activity | Optimal temperature | Enzyme activity in Fermentas buffers, % | Tango™ buffer for double digestion | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| B (blue) 1X |
G (green) 1X |
O (orange) 1X |
R (red) 1X |
Tango™ (yellow) 1X / 2X |
||||
| SacI | 37°C | 50-100 | 20-50 | 0-20 | 0-20 | 50-100 | 20-50 | 1X or 2X |
Lambda DNA
0.7%琼脂糖
2 切割位点
10 mM Bis-Tris Propane-HCl (pH 6.5, 37°C), 10 mM MgCl2 , 0.1 mg/ml BSA。
37°C酶切。
10 mM Tris-HCl (pH 7.4, 25°C), 100 mM KCl, 1 mM DTT, 1 mM EDTA, 0.2 mg/ml BSA和50% (v/v)甘油。
备注
- SacI对GAGmCTC识别序列中的C碱基甲基化敏感(而不是GAGCTmC序列)。SacI对GmAGCTC识别序列中的A碱基甲基化不敏感。AluI甲基化酶(AGmCT)可用于阻止SacI酶切。
- 超螺旋质粒DNA切割所需的SacI酶量是线性质粒DNA的5倍。
- 抗凝剂处理的外周血和骨髓样本纯化时,样本DNA中残留的临床抗凝剂会抑制SacI酶活性。常规样本纯化时添加的EDTA和ACD(citricacid-sodiumcitrate- dextrose)浓度会抑制SacI酶切;而hearin(肝素)需要相当于三倍常规浓度时才能抑制SacI酶切(Coad,J.e., et al., Inhibition of restriction endonucleases by common clinical anticoagulants, Anal. Biochem., 205, 368-369,1992)。
Dcm: 无重叠 – 不影响。
CpG: 可能重叠 – 不影响。
EcoKI: 无重叠 – 不影响。
EcoBI: 可能重叠 – 不影响。
| Methylation type | Sequence | Cleavage effect |
|---|---|---|
| CpG | 5'...m5C G AGCTm5C G ...3' |
不阻止酶切 |
| EcoBI (TGA(N)8 TGCT) | 5'...TGm6AGCTC(N)4 TGCT...3' |
不阻止酶切 |
| bp from the recognition site to fragment end | ||||
|---|---|---|---|---|
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 |
| 50-100 | ||||
| Lambda | ΦX174 | M13mp18/19 | pBR322 | puc18/19 | pUC57 |
|---|---|---|---|---|---|
| 2 | 0 | 1 | 0 | 1 | 1 |
| pTZ19R/U | pTZ57R | pBluescriptIIKS(-/+) | pBluescriptIISK(-/+) | pACYC177 | pACYC184 |
| 1 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 |
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文献和实验实验试剂 高保真聚合酶(pfu ultra),限制性内切酶(XhoI、SpeI、BamHI、SpeI、SacI),金粉,无水乙醇,2.5MCaCl2 ,20ul 0.1M亚精胺 实验设备 PCR扩增仪,PDS-1000/He型基因枪,激光共聚焦显微镜(Carl Zeiss LSM 510 ) 实验材料 洋葱 实验
时配制: SED:19mlSE 加1ml 1M DTT PEG/CaT:1:1混合40%PEG及CaT 实验材料 GS115中,用SalI,StuI或SacI线性化的DNA可分离His Mut 重组子 KM71中,用SalI,StuI或SacI线性化的DNA可分离His Muts重组子 亲代载体用相同酶线性化 对照包括无DNA,线性化PBR322DNA及质粒(无细胞)涂板来检测是否有污染
【小常识】Ethanol Precipitation of DNA
有人提议利用高浓度醋酸铵对DNA制品中的蛋白进行盐析,代替经典的酚氯仿抽提,但是这种方法制备的DNA中盐浓度很高,影响某些酶的切割,如KpnI和SacI等使用低盐反应条件的酶。所以,我们后来放弃了该方法。这也提示我们,企图从原理上改动“分子克隆”这本圣经很困难。
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