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SmaI

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  • Thermo scientific -fermentas
  • ER0661
  • 2025年10月06日
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    • - FastDigest®限制酶
    • - 推荐的缓冲液 : Tango™
    • - 孵育温度30°C
    • - 连接效率90%
    • - CpG甲基化可能影响DNA切割
    • - 热失活65°C, 20 min
    • - 基因组级别
    • - 重组酶
    • - 蓝/白鉴定
    • - LO合格
    • - HC: 提供高浓度酶
    Catalog# Size, concentration Supplied with: Certificate of Analysis MSDS
    10X Buffer Tango™
    ER0661 1200 u (10 u/µl) 1.00 ml ER0661
    ER0662 5 x 1200 u (10 u/µl) 2 x 1.00 ml ER0662
    ER0663 HC, 6000 u (50 u/µl) 2 x 1.00 ml ER0663
    ER0667 500 u (10 u/µl) 1.00 ml
    Reaction conditions
    Recommended buffer for 100% activity Optimal temperature Enzyme activity in Fermentas buffers, % Tango™ buffer for double digestion
    B (blue)
    1X
    G (green)
    1X
    O (orange)
    1X
    R (red)
    1X
    Tango™ (yellow)
    1X / 2X
    Tango™ 30°C 50-100 0-20 0-20 0-20 100 0-20 1X

    Lambda DNA
    0.7%琼脂糖
    3 切割位点

    100%酶活性的反应条件
    1X 缓冲液Tango™:
    33 mM Tris-acetate (pH 7.9, 37°C), 10 mM Mg-acetate, 66 mM K-acetate, 0.1 mg/ml BSA。
    30°C酶切。

    保存缓冲液
    SmaI保存在:
    10 mM Tris-HCl (pH 7.4, 25°C), 100 mM KCl, 1 mM DTT, 1 mM EDTA, 0.2 mg/ml BSA和50% (v/v)甘油。

    连接和重新酶切
    50倍SmaI过量酶切后,超过90%的 pUC19 DNA酶切产物可以连接和重新酶切。

    琼脂糖包埋DNA酶切
    至少需要5 unit限制酶才能在16小时内完全切割1 µg琼脂糖包埋的λ DNA。

    备注
    • 37°C酶切时只有50%的酶活性。 37°C的半衰期只有15分钟。
    • 25°C酶切时只有100%的酶活性。
    • SmaI酶切需K+ 离子存在。

    商业化同裂酶
    采用REsearch™软件寻找同功酶。

    双酶切
    采用DoubleDigest™软件确定双酶切的最佳条件。

    甲基化影响
    Dam: 无重叠 – 不影响。
    Dcm: 无重叠 – 不影响。
    CpG: 完全重叠 – 阻止酶切。
    EcoKI: 无重叠 – 不影响。
    EcoBI: 无重叠 – 不影响。

    Methylation type Sequence Cleavage effect
    CpG

    CCCGGG

    阻止酶切
    Cleavage efficiency close to the termini of PCR fragments
    bp from the recognition site to fragment end
    1 2 3 4 5
    50-100
    Number of recognition sites in DNA molecules
    Lambda ΦX174 M13mp18/19 pBR322 puc18/19 pUC57
    3 0 1 0 1 1
    pTZ19R/U pTZ57R pBluescriptIIKS(-/+) pBluescriptIISK(-/+) pACYC177 pACYC184
    1 1 1 1 1 0

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    图标文献和实验
    相关实验
    • SmaI digestions

      The Minion Lab, College of Veterinary Medicine at Iowa State University http://mycoplasmas.vm.iastate.edu/lab_site/methods/DNA/SmaIvector.html

    • Methylation analyis using restriction enzyme digestion

      . Since in eukaryotic DNA (or actually in mammalian DNA) only cytosine in CG context can be methylated, the restriction enzymes with CG sequences within their restriction sites come in question. Two classical enzyme pairs are HpaII - MspI (CCGG) and SmaI - XmaI (CCCGGG

    • DNA连接酶对所连接的DNA两端碱基序列有专一性要求么

      。 由此题我发现,目的基因由两种限制酶切割,一端由EcoRI切出黏性末端,另一端由AluI切出平末端;载体质粒由两种限制酶切开,一端由EcoRI切出黏性末端,另一端由SmaI切出平末端。在构成重组 质粒时,两个黏性末端碱基互补,由DNA连接酶可以连接上磷酸二酯键,这没有疑议。但是另一端两个平末端也能由DNA连接酶连接上,并且原题中第(3)问“图1步骤③所用的DNA连接酶对所连接的DNA两端碱基序列是否有专一性要求? 。”答案为“否”。 也就是由此题我们可以得出一个结论:DNA连接

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