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| Catalog# | Size, concentration | Supplied with: | Certificate of Analysis | MSDS |
| 10X Buffer SduI | ||||
| ER0651 | 500 u (10 u/µl) | 1.00 ml | ER0651 |
Reaction conditions
| Recommended buffer for 100% activity | Optimal temperature | Enzyme activity in Fermentas buffers, % | Tango™ buffer for double digestion | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| B (blue) 1X |
G (green) 1X |
O (orange) 1X |
R (red) 1X |
Tango™ (yellow) 1X / 2X |
||||
| SduI | 37°C | NR | 50-100* | 0-20 | 0-20 | NR | NR | NR |
* –星活性比5倍过量酶切(5 units x 1 hour)还强。
Lambda DNA
0.7%琼脂糖
38 切割位点
100%酶活性的反应条件
1X 缓冲液SduI:
10 mM Tris-HCl (pH 7.2, 37°C), 3 mM MgCl2 , 150 mM NaCl, 0.1 mg/ml BSA。
37°C酶切。
10 mM Tris-HCl (pH 7.2, 37°C), 3 mM MgCl2 , 150 mM NaCl, 0.1 mg/ml BSA。
37°C酶切。
保存缓冲液
SduI保存在:
10 mM Tris-HCl (pH 7.4, 25°C), 100 mM KCl, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.2 mg/ml BSA和50% (v/v)甘油。
10 mM Tris-HCl (pH 7.4, 25°C), 100 mM KCl, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.2 mg/ml BSA和50% (v/v)甘油。
连接和重新酶切
50倍SduI过量酶切后,超过95%的酶切产物可以连接和重新酶切。
备注
低盐、pH> 8.0、高浓度甘油(>5%)或过量酶切都会导致星活性。
商业化同裂酶
采用REsearch™软件寻找同功酶。
双酶切
采用DoubleDigest™软件确定双酶切的最佳条件。
兼容性末端
Alw21I, ApaI, BseSI, Eco24I, Mph1103I, PstI, SacI, SdaI。
甲基化影响
Dam: 无重叠 – 不影响。
Dcm: 可能重叠 – 不影响。
CpG: 可能重叠 – 不影响。
EcoKI: 可能重叠 – 影响不确定。
EcoBI: 可能重叠 – 影响不确定。
Dcm: 可能重叠 – 不影响。
CpG: 可能重叠 – 不影响。
EcoKI: 可能重叠 – 影响不确定。
EcoBI: 可能重叠 – 影响不确定。
| Methylation type | Sequence | Cleavage effect |
|---|---|---|
| Dcm (CCWGG) | 5'...Cm5CW GG GCCm5CW GG ...3' |
不阻止酶切 |
| CpG | 5'...m5C G DGCHm5C G ...3' |
不阻止酶切 |
| bp from the recognition site to fragment end | ||||
|---|---|---|---|---|
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 |
| 50-100 | ||||
| Lambda | ΦX174 | M13mp18/19 | pBR322 | puc18/19 | pUC57 |
|---|---|---|---|---|---|
| 38 | 3 | 5 | 10 | 5 | 6 |
| pTZ19R/U | pTZ57R | pBluescriptIIKS(-/+) | pBluescriptIISK(-/+) | pACYC177 | pACYC184 |
| 5 | 6 | 6 | 6 | 4 | 8 |
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SduI (Bsp1286I)
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