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天根生化科技(北京)
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20 ul
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文献和实验了一下,小提了质粒,做了酶切。(Kpn I和EcoR I是我的引物上带的位点) 酶切鉴定完了之后,从6号和7号克隆菌液中各取了1 ml送测序。结果6号有两个位点突变,还少了一小段,7号正确,算是运气比较好吧。接下来的操作,论坛上已经有很多大佬说过了,到了这一步之后,可能后面遇到的主要问题就是连接。Takara的T4连接酶说明书上说,载体与目的片段分别是0.03 pmol和0.3 pmol,也就是1:10。我一般就是按照说明书做的,效果也还行。但是,我做的片段都比较短,可能大片段的话要调整比例
DNA连接酶是1967年在三个实验室同时发现的。它是一种封闭DNA链上缺口酶,借助ATP或NAD水解提供的能量催化DNA链的5'-PO4与另一DNA链的3'-OH生成磷酸二酯键。但这两条链必须是与同一条互补链配对结合的(T4DNA连接酶除外),而且必须是两条紧邻DNA链才能被DNA连接酶催化成磷酸二酯键。常用的DNA连接酶有两种:来自大肠杆菌的DNA连接酶和来自噬菌体的T4DNA连接酶。二者的作用机理类似。T4连接酶作用分三步:(1) T4DNA连接酶与辅助因子ATP形成酶-AMP复合
的线状DNA。 T4DNA连接酶连接要求和结果 外源DNA末端性质 连接要求 连接结果 不对称粘性末端 两种限制酶消化后,需纯化载体以提高连接效率 载体与外源DNA连接处的限制酶切位点常可保留;非重组克隆的背景较低;外源DNA可以定向插入到载体中。 对称性粘性末端 线形载体DNA常需磷酸酶脱磷处理 载体与外源DNA连接处的限制酶切位点常可保留;重组质粒会带有外源DNA的串联拷贝;外源DNA会以两个方向插入到载体中。 平端 要求高浓度的DNA和连接酶 载体与外源DNA连接处的限制
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