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SNP检测
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无锡菩禾生物医药技术有限公司
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小样本量
SNP检测
单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性,是人类可遗传变异中最常见的一种,是研究人类家族和动植物品系遗传变异的重要依据。
实验步骤
根据基因的序列设计扩增片段引物并合成,将PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳检测,将目的条带进行切胶回收纯化测序,将测序结果与NCBI库进行比对,找出各个样本目的基因突变的位置和形式,对结果进行汇总分析,计算某一种突变所占的百分比,根据结果找出关联性很强的几个突变位点,即为标签突变位点。将这些突变位点与NCBI中SNP库进行比对分析,找出新发现的突变位点,可用于后续的验证和研究。
结果展示:
实验完成周期及交付标准:
1.实验周期: 1周
2.交付标准:
①详细实验报告一份,含所需试剂耗材、仪器设备及操作过程等;
②依据所选方法提供对应的测序图谱;
需确认的信息(客户提供):
客户提供血液或组织样本,干冰运输
六、实验服务流程
无锡菩禾生物是一家专业提供生物医药技术服务和细胞整体解决方案的高科技企业。拥有CMA 质量体系认证的实验室,5大技术平台(细胞平台、分子平台、免疫平台、病理平台、动物平台),以专业、严谨、求真、高效服务理念,为全国科研工作者提供一站式技术检测服务。
公司地址:江苏省江阴市砂山路85号
单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性,是人类可遗传变异中最常见的一种,是研究人类家族和动植物品系遗传变异的重要依据。
实验步骤
根据基因的序列设计扩增片段引物并合成,将PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳检测,将目的条带进行切胶回收纯化测序,将测序结果与NCBI库进行比对,找出各个样本目的基因突变的位置和形式,对结果进行汇总分析,计算某一种突变所占的百分比,根据结果找出关联性很强的几个突变位点,即为标签突变位点。将这些突变位点与NCBI中SNP库进行比对分析,找出新发现的突变位点,可用于后续的验证和研究。
结果展示:
实验完成周期及交付标准:
1.实验周期: 1周
2.交付标准:
①详细实验报告一份,含所需试剂耗材、仪器设备及操作过程等;
②依据所选方法提供对应的测序图谱;
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客户提供血液或组织样本,干冰运输
| 细胞平台 | 行为学检测 | 动物模型 |
| 原代细胞制备与培养 | 水迷宫检测 | 慢性胰腺炎模型 |
| 细胞培养、传代 | 十字架 | 肝纤维化模型 |
| 原代细胞传代培养 | 非酒精性脂肪肝 | |
| 细胞系STR鉴定服务 | 动物模型 | 骨质疏松模型 |
| 细胞转染 | 小/大鼠饲养 | 糖尿病模型 |
| MTT细胞增殖、活性、毒性检测 | 小/大鼠灌胃 | 眼外伤模型 |
| CCK8细胞增殖、活性、毒性检测 | 兔子饲养费 | 青光眼模型 |
| 流式细胞凋亡检测 | 大鼠灌胃 | 烧烫伤模型 |
| 流式细胞周期检测 | 小鼠灌胃 | 短肠模型 |
| 血管形成实验(非钙染/钙染) | 兔子灌胃 | 肾衰模型 |
| ROS检测 | 腹腔/肌肉给药(大小鼠) | 肾炎模型 |
| 划痕实验 | 腹腔/肌肉给药(兔子) | 尿路结石 |
| 克隆形成实验 | 尿液/粪便采集 | 高氧/低氧损伤模型 |
| 粘附实验 | 血液采集 | |
| transwell实验(迁移) | TTC染色 | 病理平台 |
| transwell实验(侵袭) | 超声检测 | 组织包埋 |
| 贴壁/悬浮细胞转细胞株构建 | 血常规检测 | 冰冻/石蜡切片 |
| 耐药细胞株筛选构建 | DR检测 | HE染色 |
| 骨组织切片 | 其他特殊染色 | |
| 分子平台 | microCT | 全扫描拍照 |
| 载体构建 | 皮下瘤模型 | 扫描电镜 |
| 细胞/组织/血液RNA提取 | 移植瘤模型 | 透射电镜 |
| mRNA/miRNA等引物设计 | 原位瘤模型 | 共聚焦拍照 |
| RT-qPCR检测 | 心肌缺血再灌注模型 | |
| CHIP检测 | 门静脉高压动物模型 | |
| EMSA检测 | 高血压动物模型 | |
| 双荧光素酶实验 | 心肌梗死动物模型 | |
| 原位杂交 | 动脉粥样硬化动物模型 | |
| 脑缺血再灌注 | ||
| 免疫平台 | 肾性高血压模型 | |
| 蛋白(核/膜/总)提取 | 主动脉弓狭窄模型 | |
| 蛋白含量测定 | 脊髓损伤模型 | |
| Western Blot检测 | 背根神经节损伤模型 | |
| COIP | 脑瘫模型 | |
| 免疫组化/荧光 | 癫痫模型 | |
| 抑郁症模型 | ||
| 行为学检测 | 肾脏缺血再灌注模型 | |
| 水迷宫检测 | 关节炎 | |
| 十字架 | 肺气肿模型 |
六、实验服务流程
无锡菩禾生物是一家专业提供生物医药技术服务和细胞整体解决方案的高科技企业。拥有CMA 质量体系认证的实验室,5大技术平台(细胞平台、分子平台、免疫平台、病理平台、动物平台),以专业、严谨、求真、高效服务理念,为全国科研工作者提供一站式技术检测服务。
公司地址:江苏省江阴市砂山路85号
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Taq Talk 荧光定量 PCR 系列课程之【如何为 qPCR SNP 基因分型检测设计选择序列】在将目标序列提交给设计工具之前,我们需要对其做些什么?
荧光定量同时存在成为可能,解决了TaqMan-MGB探针最大的不足。 价格相对便宜 上海辉睿生物生物化学部自行开发完成DQ探针,打破国外荧光探针技术垄断,大大降低科研、服务原料成本。 DQ探针应用: 病原体检测 ◆ 使用方法和TaqMan探针一致 ◆ 可以完全替换TaqMan-MGB探针 荧光定量 ◆ 使用方法和TaqMan探针一致 ◆ 可以提高荧光定量的灵敏度 ◆ 可以完全替换TaqMan-MGB探针 多重荧光定量 SNP分型——
假设样本数为35:1、采用测序方案:测序一类的公司都可以,生工,英骏,奥科等,你提供PCR产物,他们进行测序。2、采用TAQMAN或MGB探针方案:基康,复旦悦达,联合基因等,强烈建议不要采用这种方案,特贵。3、采用微测序方案:翼和生物。就是应用LDR连接酶的反应,发射荧光的进行检测的。效果和价钱比较:测序要你自己做PCR,但测序的好坏要看你PCR产物的质量和测序公司的能力,价格大概在50元左右,总花费大约:50*35*12+前期的PCR费用=2万多。TAQMAN和MGB探针方案只需要你提供
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