
MicroRNA芯片分析
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- 2025年07月10日
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MicroRNA芯片分析
生数据标准化 (Raw data normalization) 对原始数据进行处理,通过特定的统计分析,达到消除背景噪音,过滤脏数据,去除同一实验不同block之间、不同芯片之间的实验误差,使不同芯片的数据具有可比性。
差异表达分析 (DEG analysis) 差异表达分析是芯片数据的基本分析手段之一,不同方法适用于不同的数据,常用的方法有limma,SAM,T-test ,Fisher’s exact test等。
miRNA靶标基因的预测(miRNA target prediction) 选取在十多种预测方法中至少有5种预测算法预测一致的靶基因
miRNA-mRNA调控网络(miRNA regulation network) 基于MicroRNA的负调控属性,选取显著负相关的miRNA和gene进行网络分析
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文献和实验无痕风 求助基因芯片如何分析 各位大虾谁有经验 或知道哪里可以做相关的培训 请告诉小妹啊 呵呵谢了 freecell http://www.instrument.com.cn/bbs/shtml/20060905/544223/ wangke80 看你是坐哪方面的芯片了,表达谱?CNV?microRNA?还是其它?不同的芯片有自己一些特殊的分析方法。 基础了解的话一方面是看文献
由于血液中的红细胞没有细胞核,用于基因表达分析时,往往是分析血液中白细胞的基因表达情况。因此首先需要把血液中的白细胞进行分离。下面方法是我们实验室摸索的适合基因芯片技术白细胞分离的过程。一、实验材料:淋巴细胞分离液(天津TBD生物技术发展中心);灭菌生理盐水(普通0.9%生理盐水灭菌即可);Trizol试剂(Invitrogen公司)各种取样器具高温灭菌即可;仪器设备:带水平转头的离心机,具体过程:以2 ml全血为例1、将2 mL抗凝血(肝素或者EDTA盐抗凝都可),以3,500 转/分,离心
gzlaotouzi 我想知道,经过芯片或者其它手段确认了的,与某一类肿瘤或者某一特定疾病相关的所有差异表达有意义的microRNA群,我可以借助哪些手段得知? shilei5794749 http://www.mir2disease.org/ —— “search by disease name” 路得自己走 shilei5794749 wrote:
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