专业微生态、微生物多样性分析服务：宏基因组/16S/18S/

专业微生态、微生物多样性分析服务
——宏基因组/16S/18S/ITS/功能基因

关于微基生物

微基生物致力于协助科研人员探索微生态与健康、生产、环境之间隐藏的奥秘，更好地利用微生物资源。

微基生物是同时开展Illumina Miseq、Ion PGM及454二代高通量测序分析，PacBio第三代高通量测序分析，PCR-DGGE变性梯度凝胶分析，克隆文库等多种微生态分析方法的公司。公司拥有经验丰富的技术团队，涉及分子生物学、医学、生物信息学、统计生态学方面，核心成员具有10余年一线科研工作经验。

微基生物已完成300余项微生物多样性分析项目，分析样本6000余例。研究对象涉及粪菌、土壤、水体、发酵物、肠道、人体微生物等各类样本。

微基生物，将继续专注微生态研究，紧跟国际分子生物学技术、生物信息学、统计分析技术发展，以更好的服务质量，协助研究者解码微生物世界的奥秘！

分析类型及靶基因

常见分析项目列表

分析平台及特点

分析案例

案例分析案例：某类细菌在相关疾病爆发过程中与其他细菌/真菌的相关性。

分析方法：相关性分析是用于分析微生物间相互作用关系的经典方法，可甄别出微生 物群落间（包括细菌、真菌、古细菌等各类检测目标）具有显著相关性、强相关、正相关、负相关的各项。

分析案例： 丁酸盐产生菌的减少和一些致病微生物的增加使得CRC患者肠道微生物菌落的失衡

Tingting Wang等采用高通量测序技术研究结直肠癌（CRC）患者与正常人群肠道微生物的菌落组成差异。并结合real-time PCR对相关基因进行分析，最终确定丁酸盐产生菌的减少和一些致病微生物的增加使得CRC患者肠道微生物菌落的失衡。实验对象的数目：CRC患者46人，健康志愿者56人。

Structural segregation of gut microbiota between colorectal cancer patients and healthy volunteers. 2012. The ISME Journal

相关分析方法： LEfSe分析，用于寻找两组样本中丰度呈显著性差异的微生物

LefSe

分析案例：服用某中草药改变肠道菌群，进而缓解二型糖尿病

肠道菌群对新陈代谢疾病（如二型糖尿病T2D）有重要的作用，传统的中草药葛根芩连汤（GQD）对二型糖尿病有缓和作用。
为了研究GQD对T2D的调节作用是否通过改变肠道菌群的组成，Jia Xu等对187名T2D患者给予不同剂量的GQD（44名给予高剂量，52名给予中剂量，50名给予低剂量，41名给予安慰剂），对肠道微生物进行研究。高剂量和中剂量处理的样本较低剂量和安慰剂处理的样本中空腹血糖（FBG）和糖化的血红蛋白（HbA1c）显著降低，通过RDA分析，鉴定出47个丰富的种，其中17个与FBG负相关，9个与HbA1c负相关。
实验结果显示，中草药GOD处理可以增加有益微生物的种类，如Faecalibacterium spp。

Structural modulation of gut microbiota during alleviation of type 2 diabetes with a Chinese herbal formula. 2015. The ISME Journal


相关分析方法：采用网络分布图展示不同个体或人群的肠道微生物分布，可以形象的展示不同个体或人群之间的相同物种或是OTU的相似、分布情况。

网络图

相关分析方法： 利用冗余分析（RDA）反映在某微生物分类级别上（如属）不同个体肠道菌群差异与健康、药物、饮食之间关系。

RDA