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- 转录组测序已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。已完成包括人、昆虫、寄生虫、植物、鱼类和微生物等多个不同物种的转录组测序和分析工作。
- 上海市浦东新区
- 2025年07月15日
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- 服务名称：
转录组测序
- 提供商：
上海翰宇生物科技有限公司
适用平台：PacBio RS II、Illuminaa HiSeq2500、Miseq、454 GS-FLX Plus
研究内容
■ 根据实验目的，构建各种cDNA文库，利用Pacbio系统进行全长cDNA测序，超长reads读长，一次性得到全长转录本，不同与短reads拼接，获得最准确编码序列，有利于后期功能分析
■ 转录组测序：有参考基因组转录组测序(transcriptome resequencing)/无参考基因组转录组测序（de novo transcriptome Sequencing）。
■ 序列拼接/基因预测/功能注释/基因表达量分析/代谢途径/GO分析等基本生物信息学分析
■ 个性化生物信息学分析
翰宇优势
■ MiSeq测序可获得双向600bp reads读长，高达50×以上的覆盖率，是无参考基因组物种转录组测序的最佳选择
■ Pacbio具有超长读长优势，结合独特全长转录本建库技术，可获得更多低丰度表达的全长转录本信息；借助Illimina HiSeq平台的高覆盖度数据，可对样本转录本表达情况进行评估
■ Illimina HiSeq单次测序的数据量大，高覆盖率，检测到更低丰度的转录本，在已知基因组序列物种的转录组分析中更具有优势
■454测序的序列平均读长400-500bp，较长的读长便于拼接，从而获得更好的数据。在未知基因组序列物种的转录组分析中更占有优势
■ 根据客户要求进行不同深度测序，可检测到低丰度表达的基因
生物信息分析
结果示例
1. Congtig length分布
2. 预测蛋白的KOG分类
3. 预测蛋白的GO分类（Cellular Component、Molecular Function and Biological Process）
4. 聚类分析
成功案例
■ 已完成包括人，昆虫，寄生虫，植物，鱼类和微生物等近百种不同物种的转录组测序和分析工作
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文献和实验，可作为多种疾病的早期诊断标记物，也能作为靶向药物的载体进行疾病治疗。 外泌体 microRNA 测序/芯片：通过对外泌体 microRNA 的高通量分析，可以找到不同外泌体之间差异表达的 microRNA，为后续的功能学实验做准备。 外泌体 mRNA 测序/芯片：通过对外泌体转录组测序或表达谱芯片分析，可以找出不同外泌体之间差异表达的 mRNA，从而发现外泌体中哪些基因发生了变化。 外泌体 lncRNA 芯片：通过 lncRNA 芯片可以同时得到 lncRNA 和 mRNA 数据，为研究者提供更
Nat Methods 2020 年度技术方法：空间转录组到底是什么，怎么做，怎么用
派」—— 什么是空间转录组？ 品尝一杯果汁，我们可以通过味道判断有橙子、苹果、草莓或者其他类型水果的存在，但我们却无法得知每种水果的具体比例。正如 Nature Methods 在报道中提到的一样：传统的转录组测序就如同制作这样一杯水果冰沙，我们需要把所研究的样本研磨成匀浆。最终得到的是组织细胞中平均的 mRNA 基因表达情况，这种分析会把细胞间的差异屏蔽掉。研究人员无法分辨出某些基因的上调或下调是来自某个细胞亚群还是来自整个细胞群体。随着技术的进步，单细胞测序技术应运而生。该技术最大的革新在于把单个
三句话读懂一篇 CNS：新疗法助力治疗女性不育；能负载活细胞的冷冻微针治疗技术；发现治疗心肌梗死新靶标，...
enables higher-dimensional epigenomic reconstructions。研究报道了一种不借助特殊仪器及不需要构建转基因模型的情况下高通量、高精度地获得单细胞双组学数据的技术 ——CoTECH (combined assay of transcriptome and enriched chromatin binding)，该方法能够同时在单个细胞中捕获蛋白质 - 染色质互作和基因表达信息，并重构单细胞多维表观景图，为解析细胞命运提供有力的技术支持！ 图 10. 来源
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