
高通量测序——宏基因组学研究
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- 宏基因组测序技术不依赖传统的微生物分离培养过程,以高质量的环境样品总DNA为研究材料,以DNA深度测序和功能基因筛选为研究手段,高通量识别复杂环境样品中微生物的结构组成及功能。
- 上海市浦东新区
- 2025年07月16日
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- 技术资料
- 服务名称:
宏基因组学研究
- 提供商:
上海翰宇生物科技有限公司
宏基因组(Metagenome)即特定小生境(如土壤,海洋,肠道等)中全部微小生物遗传物质的总和,目前主要指环境样品中细菌和真菌的基因组总和。
宏基因组测序技术不依赖传统的微生物分离培养过程,以高质量的环境样品总DNA为研究材料,以DNA深度测序和功能基因筛选为研究手段,高通量识别复杂环境样品中微生物的结构组成及功能。
研究内容
■宏基因组DNA深度测序
■系统的基因识别和功能分析
技术特点
■每条序列可以代表样本中的几个基因
■进行不可培养微生物的功能研究
■可构建不同细菌之间协同的代谢网络
技术路线
生物信息学分析
结果示例
采用Megan软件,物种分类(18s,16s)
Pathway解析
不同样品之间比较(功能基因)
基本元素循环分析(C、N)
成功案例
■纤维素/木质纤维素利用:牦牛瘤胃,白蚁肠道
■甲烷生产:生物反应器(沼气池)
■海洋宏基因组:海洋共生微生物等
宏基因组测序技术不依赖传统的微生物分离培养过程,以高质量的环境样品总DNA为研究材料,以DNA深度测序和功能基因筛选为研究手段,高通量识别复杂环境样品中微生物的结构组成及功能。
研究内容
■宏基因组DNA深度测序
■系统的基因识别和功能分析
技术特点
■每条序列可以代表样本中的几个基因
■进行不可培养微生物的功能研究
■可构建不同细菌之间协同的代谢网络
技术路线
生物信息学分析
结果示例
采用Megan软件,物种分类(18s,16s)
Pathway解析
不同样品之间比较(功能基因)
基本元素循环分析(C、N)
成功案例
■纤维素/木质纤维素利用:牦牛瘤胃,白蚁肠道
■甲烷生产:生物反应器(沼气池)
■海洋宏基因组:海洋共生微生物等
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