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高通量测序——宏基因组学研究

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  • 宏基因组测序技术不依赖传统的微生物分离培养过程,以高质量的环境样品总DNA为研究材料,以DNA深度测序和功能基因筛选为研究手段,高通量识别复杂环境样品中微生物的结构组成及功能。
  • 上海市浦东新区
  • 2025年07月16日
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    • 技术资料
    • 服务名称

      宏基因组学研究

    • 提供商

      上海翰宇生物科技有限公司

    宏基因组(Metagenome)即特定小生境(如土壤,海洋,肠道等)中全部微小生物遗传物质的总和,目前主要指环境样品中细菌和真菌的基因组总和。
    宏基因组测序技术不依赖传统的微生物分离培养过程,以高质量的环境样品总DNA为研究材料,以DNA深度测序和功能基因筛选为研究手段,高通量识别复杂环境样品中微生物的结构组成及功能。

    研究内容
    ■宏基因组DNA深度测序
    ■系统的基因识别和功能分析

    技术特点
    ■每条序列可以代表样本中的几个基因
    ■进行不可培养微生物的功能研究
    ■可构建不同细菌之间协同的代谢网络


    技术路线


    生物信息学分析



    结果示例
    采用Megan软件,物种分类(18s,16s)

    Pathway解析

    不同样品之间比较(功能基因)

    基本元素循环分析(C、N)



    成功案例
    ■纤维素/木质纤维素利用:牦牛瘤胃,白蚁肠道
    ■甲烷生产:生物反应器(沼气池)
    ■海洋宏基因组:海洋共生微生物等

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