
癌细胞miRNA靶基因预测及验证服务
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- 靶基因预测
- 上海
- 2025年07月13日
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- 服务名称:
miRNA靶基因预测及验证
- 提供商:
上海高校实验室
样本提供:
a. 基因名;
b. Gene ID;
c. 基因3’UTR序列;
d. miRNA名称及Accession ID;
e. miRNA的预测靶点及突变序列;
f. 待实验细胞系及转染效率;
g. 该细胞的miRNA表达丰度。
服务周期:预计30个工作日,依具体实验而定。
MicroRNA(miRNA)是一类长度约19-24nt的非编码单链RNA,通过碱基互补配对的方式与靶基因的3’-UTR区部分或完全互补,剪切靶基因的转录产物或者抑制转录产物的翻译,从而起到转录后调控靶基因表达的作用。它广泛存在于动物、植物、真菌及病毒的基因组中,调控生物体生长发育和疾病发生等过程中相关基因的表达。MiRNA的异常表达可能会导致生理状态的异常和疾病的产生,在多种癌症中,miRNA的表达水平会发生明显改变,有可能起到原癌基因和抑癌基因的作用。此外,在许多其他的病变组织和细胞中也检测到了miRNA的异常表达。因此对miRNA的表达的研究具有重要意义。
另本实验室还对外开放细胞培养技术服务,流式细胞检测,流式细胞分选,液相蛋白芯片,ChIP染色质免疫共沉淀,实时荧光定量PCR,石蜡切片,冰冻切片,免疫荧光,HE染色,Western Blot等技术服务以及医学分子生物学培训,形态学培训,细胞培养学培训。详情请来电咨询。
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文献和实验wh861017 求助:我用了三个综合性miRNA靶基因预测软件:starBase、miRecords、TarBase预测miR-155和miR-30a的靶基因,怎么每个软件预测的靶基因个数不一样,而且有的已经被证实的靶基因缺不在预测的靶基因范围内,我该相信哪个软件?急!!!!! charllu 你可以在PICTAR、MIRBASE、DIANA-MICROT或者Targetscan上再看看,一般这几个网站是比较权威的预测
DIANA2MicroT DIANA2MicroT 是Kiriakidou 等编写的一种特殊的miRNA靶基因预测软件 . 它主要针对含单一miRNA结合位点的靶基因,除了要与miRNA 5′端“种子”序列配对外,还要与miRNA的3′端配对,并要求配对序列中央最好有“囊泡”存在,即靶基因上miRNA结合位点中央未与miRNA互补序列所形成的泡状结构. 该软件在线虫中的预测结果,成功对应了多个已验证的miRNA 靶基因. PicTar PicTar
【求助】miRNA靶基因预测 “7mer-m8”是什么意思?
霍一刀hxs miRNA靶基因相关预测网站中经常出现“7mer-m8”,其中“mer”表示什么意思? 多谢高手指教。 freecell The "-mer" suffix refers to the number of bases (monomer, 7-mer, oligomer, polymer...). 霍一刀hxs 多谢版主freecell的指教,多谢。
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