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DGGE变性梯度凝胶电泳

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  • DGGE(denaturing gradient gel electrophoresis) 即变性梯度凝胶电泳,是利用DNA在不同浓度的变性剂中解链行为的不同而导致电泳迁移率发生变化,从而将片段大小相同而碱基组成不同的DNA片段分开。
  • 北京/中国
  • 2025年07月15日
    • 详细信息
    • 询价记录
    • 文献和实验
    • 技术资料
    • 服务名称

      DGGE变性梯度凝胶电泳/DGGE

    • 提供商

      北京亿鸣复兴生物科技有限公司

    • 规格

      详询

    ★实验描述:
    DGGE变性梯度凝胶电泳:使用PCR方法扩增特定环境样品中混合细菌16S rDNA,通过变性梯度凝胶电泳分析环境样品中的细菌群落结构;将凝胶电泳条带回收后克隆测序,确定细菌种属关系,获得特定样品中的细菌多样性信息。

    DGGE作为一种成熟的分子生物学技术被广泛应用于环境科学(土壤、海洋、河流、冰川、淤泥等)、医学(各种疾病治疗前后,病变部位微生物的差异)、人体(鼻咽、口腔、黏膜、肠道)等领域进行微生物多样性分析。


    服务流程:


    数据处理展示:



    ★提交结果:
    PCR结果的胶图、PCR产物的变性梯度凝胶电泳分析图、主要电泳条带的序列测定及其序列分析、测序峰图及序列和测序结果分析报告。


    DGGE技术的优缺点
    优点:
    1. 高效,理论上可以分离开一个碱基差异的DNA片段。
    2. 方便,不用对样品进行标记
    3. 快速,对于已知DGGE条件的样品,可在短时间能获取DGGE图谱
    4. 直观,DGGE图谱可直观的反应出样品中个组分的丰富度
    5. 稳定,DGGE作为一种成熟的技术,可重复性高
    6. 可多样本同时分析,展现各样本的差异

    缺点:
    1.仅能检测样本中的主要微生物,占总量1%以上的微生物才能被检测到。
    2. DGGE只能对200-700bp的片段有效地分离,过大或者过小的片段分离效果都不是很好。
    3. 因为仪器数值有上限,对于某些某种主要菌株占比较大又要展现大部分条带的样品,通过DGGE图谱不能很好的反映出各个菌株的丰富度。
    4. 不同序列的DNA有可能发生共迁移而导致某些条带会有多种不同的DNA片段
    5. 因为某些物种的基因不同拷贝之间存在异质性,即使一个碱基的差别都会使他们分开,而导致不同的条带是相同物种。
    6. DGGE技术对微生物的分类鉴定依赖于基因数据库,若数据库中基因序列信息不够丰富,将会限制DGGE的使用。
    7. 由于某些种类的16S rDNA不同拷贝之间的多态性问题,可能导致自然群落中细菌数量的过多估计。



    送样要求
    1 、环境样品基因组DNA
    1) 请提供浓度大于10ng/uL,总量大于500ng的基因组DNA,DNA纯度较差或降解严重会影响后继的扩增实验。如果方便的话,可提供电子版DNA电泳检测照片及OD260/280比值。
    2) 样品在保存期间避免反复冻融。
    3) 送样务必标清楚样品编号,并用parafilm膜对管口进行密封。
    4)请务必填写完整的送样订单,并用自封袋密封后同样品一起送样,以便收到样品后妥善保存。


    2、 环境样品
    1)送样样品尽量保证新鲜,为了防止微生物死亡或DNA降解,采样后建议立即冰冻保存,如样本极为珍贵,建议采用液氮速冻后-80℃冰箱保存。
    2)样品在保存期间避免反复冻融。
    3)若是样品中含有大量的腐殖质酸、重金属等PCR反应抑制剂,请在送样时注明。
    4)请务必填写完整的送样订单,并用自封袋密封后同样品一起送样,以便收到样品后妥善保存。
    送样条件:
    以上两种类型的样本,送样时采用干冰保存运输;若是距离较远,建议采用干冰加冰袋,存放于冰盒中。


    3、各类未抽提基因组样品的送样量
    土壤:3-5 g(干沙土、干粘土、农田土、堆肥、底泥、泥炭土、淤泥等)
    粪便:3-5 g
    肠道内容物:3-5 g
    动物组织:3-5g(鳃、胃粘膜、肠粘膜、口腔黏膜等)
    分泌物:2-3 mL(唾液、鼻涕、汗液、泪水等)
    水样:2L以上水过滤后的滤膜,若环境中微生物丰富,可适当减少水的体积。
    植物内生菌:10-20g叶片;3-5g根系。
    血液:10mL。
    叶片:50-100g
    以上材料EP管或螺口管盛装即可。



    ★其他服务项目:



    ★项目一般流程:


     

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    • 变性梯度凝胶电泳DGGE

      法称作宽幅度变性梯度凝胶电泳( broadrange DGGE )。因此用该方法筛查患者突变将会节约一大笔花费(图 5 )。将基因组或基因片段分离后进行变性梯凝胶电泳再在另一方向上进行普通电泳同样可以在一次分析中检查更多的 DNA ( Uitterlinden 和 Vijg 1994 年)。   (c)其他改进。在 PCR 反应过程中加入“ GC 夹板”( Top1992 年)而不是应用含有“ GC 夹板”的特定引物,这一方法也有可能减少耗费。由一端进行 PCR 反应的引物有:带有 15

    • 变性梯度凝胶电泳(DGGE)

      一、实验原理 变性梯度凝胶电泳DGGE)是一种根据DNA片段的熔解性质而使之分离的凝胶系统。核酸的双螺旋结构在一定条件下可以解链,称之为变性。核酸50%发生变性时的温度称为熔解温度(Tm)。Tm值主要取决于DNA分子中GC含量的多少。DGGE将凝胶设置在双重变性条件下:温度50~60 ℃,变性剂0~100%。当一双链DNA片段通过一变性剂浓度呈梯度增加的凝胶时,此片段迁移至某一点变性剂浓度恰好相当于此段DNA的低熔点区的Tm值,此区便开始熔解,而高熔点区仍为双链。这种局部解链

    • 变性梯度凝胶电泳(DGGE)实验

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