minicircle DNA

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  • ¥15000
  • miniD0001,环状双链
  • 南京
  • 2025年12月19日
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      宜明生物

    • 服务名称

      minicircle DNA synthesis and purification

    一、服务概述

    minicircle DNA(微环 DNA)synthesis and purification 服务,专注于去除细菌复制原点(ori)、抗生素抗性基因等原核骨架序列,仅保留真核表达元件(如启动子、目的基因、polyA 尾)的环状 DNA 的定制合成与高纯度纯化,为基因治疗、细胞工程、疫苗研发等领域的科研机构与生物医药企业,提供从序列设计、专项制备到严格质控的一站式解决方案。
    minicircle DNA 凭借 “无原核骨架干扰、转染效率高、长期表达稳定、免疫原性低” 的核心优势,可作为非病毒基因递送载体,在体外细胞重编程、体内基因治疗(如肝脏、肌肉靶向治疗)、基因编辑工具递送等场景中替代传统质粒 DNA,解决原核序列引发的免疫反应、表达沉默等问题。本服务针对 minicircle DNA 环化效率低、易残留亲本质粒、超螺旋比例难把控等技术痛点,采用定制化环化体系与多步纯化工艺,高效合成高活性 minicircle DNA,结合多维度质控(如超螺旋率检测、体内表达验证)确保产品满足临床前研究、产业级生产等严苛需求,助力客户突破非病毒基因递送载体应用技术瓶颈。

    二、核心优势

    1. 真核元件精准设计,剔除原核骨架干扰
    针对 minicircle DNA 需去除原核序列、聚焦真核表达的特性,建立专业序列设计平台:
    • 元件优化整合:根据客户需求(如基因治疗靶点、细胞重编程因子),精准整合真核表达元件(如 CMV、EF1α 启动子,bGH polyA 尾,绝缘子序列),剔除细菌 ori、抗性基因等原核骨架(片段长度缩短 40%-60%),避免原核序列引发的 TLR9 介导的免疫反应、染色质沉默等问题,使目的基因表达水平较传统质粒提升 2-5 倍;
    • 环化位点设计:在真核元件两侧设计特异性重组位点(如 φC31 整合酶识别位点),优化位点间距与碱基组成,确保环化效率提升 50% 以上,同时避免重组过程中目的基因片段缺失、突变;
    • 安全性验证:通过碱基替换、甲基化修饰等策略降低免疫原性,同时验证目的基因与真核元件的兼容性,避免启动子泄漏、终止信号异常等问题。
    2. 高效环化与超螺旋富集,保障递送效率
    针对传统环化方法超螺旋比例低、亲本质粒残留高的痛点,研发 minicircle DNA 专属环化与富集体系:
    • 酶促环化优化:采用高活性位点特异性重组酶(如 φC31、Cre 重组酶,活性提升 80%),搭配环化促进缓冲液(含重组酶辅助因子、DNA 拓扑异构酶),使超螺旋 minicircle DNA 比例≥90%,较传统方法降低开环、线性杂质 60% 以上;
    • 亲本质粒去除:通过 “限制性酶切 ” 法去除亲本质粒(含原核骨架的环状 DNA):先用特异性限制酶切割亲本质粒的原核骨架区域(minicircle DNA 无该酶切位点),残留率<0.1%,远低于行业标准(<1%);
     
    3. 分级纯化工艺,严控杂质与污染物
    针对 minicircle DNA 易混杂亲本质粒、酶切片段、内毒素的特性,采用 “酶切 - 纯化 - 脱盐 - 内毒素去除” 四级纯化策略:
    • 酶切消化:通过限制性酶切线性化亲本质粒后,去除线性片段、酶蛋白等杂质,初步纯化纯度达 92% 以上;​​
    • 超滤脱盐与内毒素去除:使用 30kDa 截留分子量的超滤膜去除盐类、小分子杂质,同时采用内毒素特异性吸附树脂(如 polymyxin B 树脂)去除内毒素,最终产品内毒素含量、核酸酶残留量低,满足动物体内注射、临床前细胞治疗等高标准需求。
    4. 全流程质控,聚焦安全性与表达活性
    建立覆盖 “合成 - 环化 - 纯化 - 应用” 全流程的专项质控体系,确保产品质量与功能:
    • 结构完整性检测:通过琼脂糖凝胶电泳(1% 碱性胶)与高效液相色谱(HPLC,采用超螺旋 DNA 专用柱)检测超螺旋率(≥95%)、亲本质粒残留(<0.1%);通过 Sanger 测序或 NGS 验证目的基因序列准确性(错配率<1×10⁻⁶);
    • 功能活性验证:体外转染 HEK293T、原代细胞(如肝细胞),通过 qPCR、Western blot 检测目的基因表达水平(较传统质粒提升 2 倍以上)
    • 安全性检测:通过显色法测定试剂盒验证内毒素含量;通过加速稳定性实验(37℃储存 7 天、-20℃储存 6 个月)监测超螺旋率变化(下降<5%),确保产品长期储存稳定性。每批次产品提供详尽质检报告,批次间性能差异<3%,为实验结果的可重复性提供保障。
    5. 灵活交付与快速支持
    配备 minicircle DNA 专项生产与质控团队,标准订单20个工作日内完成交付(超长链 minicircle DNA>10kb 需额外10个工作日),加急订单最快15个工作日内出具产物

    三、服务规格与交付内容

    1. 服务规格
    服务项目 服务详情
    合成类型 基因治疗载体型 minicircle DNA、细胞重编程型 minicircle DNA、疫苗抗原表达型 minicircle DNA、基因编辑工具递送型 minicircle DNA
    合成长度 1-15kb(常规),支持>15kb 超长链 minicircle DNA 定制(需提前评估可行性)
    修饰选项 5' 端:生物素标记、荧光标记(FAM/Cy3);链内修饰:CpG 甲基化(降低免疫原性)、锁核酸(LNA,增强稳定性);元件修饰:绝缘子序列添加(增强表达稳定性)
    产量范围 1μg-10g(可根据需求定制 GMP 级公斤级生产)
    适配场景 临床前基因治疗(肝脏、肌肉、肺部靶向)、iPSC 重编程、CAR-T 细胞基因编辑、DNA 疫苗研发、体外细胞功能研究
    2. 检测项目
     
    检测内容 周期
    Endotoxin  assay 一周
    BioBurden 两周
    ​​
    3. 交付内容
    • 高纯度 minicircle DNA 样本:无菌无酶低吸附离心管 / 试剂瓶分装(50-1000μL / 管,产业订单可提供 10-50mL GMP 级试剂瓶包装),干冰运输,-20℃储存可稳定保存 6 个月,-80℃储存可稳定保存 24 个月以上(建议分装后避免反复冻融);
    • 完整质检报告:根据客户需求可提供包含浓度 / 纯度数据(Nanodrop 与 Qubit 检测结果)、超螺旋率检测图谱(HPLC 与凝胶电泳图)、亲本质粒残留检测报告(qPCR 定量数据)、内毒素与核酸酶残留检测报告、体外 / 体内表达验证数据(qPCR Ct 值、Western blot 灰度分析、动物体内荧光成像图);
    • 使用指南:涵盖 minicircle DNA 溶解方法(推荐使用无酶 TE 缓冲液或生理盐水,温和混匀)、转染 / 注射条件建议(如脂质体转染比例、尾静脉注射剂量)、储存与稳定性说明、常见问题解决方案(如超螺旋解旋应对、表达量异常恢复方法);
    • 合规性文件针对临床前 / 产业客户,根据客户需求可提供包含原料溯源报告、生产工艺流程图、质量体系文件(如 ISO 9001、GMP 相关记录),方便客户用于项目申报、成果转化。

    四、应用场景

    1. 临床前基因治疗研究
    作为非病毒基因递送载体,minicircle DNA 可用于单基因遗传病、慢性疾病的临床前治疗研究。例如,在血友病 B 治疗中,携带人凝血因子 IX(hFIX)基因的 minicircle DNA,通过尾静脉注射小鼠后,肝脏靶向表达 hFIX,表达持续时间>4 周,凝血功能恢复率达 80% 以上,且无明显免疫反应;在肌肉萎缩症治疗中,携带抗肌萎缩蛋白(DMD)基因的 minicircle DNA,通过肌肉局部注射可实现长期表达,改善肌肉功能。
    2. 细胞工程与重编程
    用于 iPSC 重编程、CAR-T 细胞基因编辑等细胞工程场景。例如,在 iPSC 重编程中,携带 Oct4、Sox2、Klf4、c-Myc 四因子的 minicircle DNA,转染成纤维细胞后重编程效率较传统质粒提升 3 倍,且无原核序列整合风险,重编程细胞核型正常率≥98%;在 CAR-T 细胞制备中,携带 CAR 基因的 minicircle DNA,通过电穿孔递送可实现 CAR 稳定表达,T 细胞杀伤活性较病毒载体递送提升 20%,且避免病毒整合导致的致癌风险。
    3. DNA 疫苗研发
    作为 DNA 疫苗载体,minicircle DNA 可携带病毒抗原基因(如新冠 S 蛋白、流感 HA 蛋白),通过肌肉注射或皮内注射诱导免疫应答。例如,在新冠 DNA 疫苗研发中,minicircle DNA 携带 S 蛋白三聚体基因,免疫小鼠后产生的中和抗体滴度较传统质粒提升 3-5 倍,且细胞免疫应答(IFN-γ 分泌 T 细胞比例)显著增强,同时无原核序列引发的免疫副反应。
    4. 体外细胞功能研究
    用于体外细胞基因过表达、信号通路调控等研究。例如,在肿瘤细胞功能研究中,携带抑癌基因(如 p53)的 minicircle DNA,转染肿瘤细胞后可高效恢复 p53 表达,诱导肿瘤细胞凋亡率提升 40%,且无原核序列干扰,实验结果更接近体内真实生理状态;在神经细胞研究中,携带神经营养因子(如 BDNF)的 minicircle DNA,转染神经元后可长期促进神经突起生长,支持神经修复机制研究。

    五、服务流程与技术支持

    1. 服务流程
    • 需求沟通:客户提供 minicircle DNA 的功能需求(如基因治疗靶点、细胞类型)、目的基因序列、表达元件偏好及产量要求,技术团队提供序列设计方案(含元件选择、环化位点设计)、安全性评估报告及方案报价;
    • 序列确认与制备:客户确认序列后,构建含真核元件与原核骨架的亲本质粒,通过酶促环化生成 minicircle DNA,同步优化环化与纯化条件;
    • 纯化与质控:完成环化后进行四级纯化,开展全流程质控检测(含体外 / 体内活性验证);
    • 交付与售后:质检合格后,产品与报告同步交付,提供后续实验技术支持。
    2. 技术支持
    • 专业咨询:提供 minicircle DNA 序列设计(如启动子选择、元件兼容性分析)、实验方案设计(如转染方法选择、动物注射剂量确定)、数据分析建议(如体内表达定量方法、免疫应答检测),协助解决环化效率低、表达量不达预期等问题;
    • 问题解决:针对产品超螺旋率下降、体内表达不稳定等问题,提供 troubleshooting 方案(如调整储存条件、优化环化酶用量、添加绝缘子序列);
    • 定制化培训:为客户团队提供 minicircle DNA 合成与应用相关培训,包括环化技术原理、纯化工艺、体内外活性验证实验(如动物注射操作、流式细胞术检测)等,提升客户自主实验能力。
    minicircle DNA synthesis and purification 服务以 “高安全性、高表达效率、高稳定性” 为核心,通过专项技术优化与严格质控,为非病毒基因递送领域提供高质量产品与专业服务,助力科研人员与企业突破 minicircle DNA 合成及应用技术瓶颈,加速基因治疗、细胞工程与疫苗研发的临床转化进程。

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