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- 详细信息
- 技术资料
- 提供商:
宜明生物
- 服务名称:
IncRNA synthesis and purification
一、服务概述
IncRNA synthesis and purification 服务专注于长链非编码 RNA(Long non-coding RNA, IncRNA)的体外定制合成与高纯度纯化,为表观遗传学、基因调控机制研究领域的科研机构、生物医药企业提供从序列设计、专项制备到严格质控的一站式解决方案。
IncRNA 作为长度≥200nt 的非编码 RNA,通过调控染色质状态、mRNA 加工、蛋白互作等参与多种生命活动,是疾病机制探索、新型 biomarker 发现及基因治疗靶点研究的核心工具。本服务针对 IncRNA 片段长、二级结构复杂、易降解的技术痛点,采用长链 RNA 专属合成体系与定制化纯化工艺,高效合成高活性 IncRNA,结合多维度质控(如完整性检测、功能活性验证)确保产品满足细胞转染、动物模型构建等实验需求,助力客户突破 IncRNA 研究技术瓶颈。
二、核心优势
1. 长链专属合成体系,攻克复杂结构合成难题
针对 IncRNA(通常 200-10000nt)易形成发卡、茎环等复杂二级结构,导致转录终止、产物降解的痛点,研发长链 RNA 专属体外合成体系:
- 高延伸性聚合酶:采用经突变优化的重组 T7/T3 RNA 聚合酶(延伸能力提升 80%),搭配含结构解旋辅助因子的缓冲液,有效抑制转录过程中的链终止现象,使长链 IncRNA(如 5000nt)完整产物比例≥85%,较传统体系合成效率提升 60% 以上;
- 抗降解保护策略:添加 RNA 稳定剂(如 RNA 伴侣蛋白、抗氧化剂)与 RNase 抑制剂,减少长链 RNA 因折叠聚集导致的降解,确保产物活性保留率≥95%;
- 复杂序列适配:针对高 GC 含量(>65%)、重复序列(如卫星 RNA)等特殊 IncRNA,通过序列预优化(调整碱基分布、引入修饰碱基)与转录温度梯度调控,解决合成效率低、产物不均一的问题。
2. 精准序列定制,适配多类 IncRNA 功能研究
基于专业生物信息学平台,提供高度个性化的 IncRNA 序列设计与合成服务:
- 功能区域定制:根据客户研究需求(如调控特定基因表达、模拟疾病相关 IncRNA),精准合成含启动子结合区、蛋白互作结构域、miRNA 海绵序列等功能片段的 IncRNA,支持全长或截短体合成;
- 修饰选项丰富:支持 5' 端帽子结构(m7GpppG、Cap 1)、3' 端 polyA 尾(50-200nt 可调)、荧光标记(FAM/Cy3/Cy5,用于亚细胞定位追踪)、生物素标记(用于 RNA - 蛋白 / DNA 互作研究)及化学修饰(2'-O - 甲基化、假尿苷,提升稳定性与降低免疫原性);
- 对照体系完善:提供阴性对照(非靶向序列、 scramble IncRNA)、阳性对照(已知功能 IncRNA,如 HOTAIR、XIST),方便客户设置实验对照,确保结果可靠性。
3. 分级纯化工艺,保障长链 RNA 高纯度与低杂质
针对 IncRNA 分子量大、易吸附杂质的特性,采用 “磁珠预纯化 - 离子交换层析 - 凝胶过滤” 三级纯化策略:
- 磁珠预纯化:通过长链 RNA 特异性结合磁珠,高效去除未反应核苷酸、短片段 RNA(<100nt)及部分蛋白杂质;
- 离子交换层析:采用弱阴离子交换柱(针对长链 RNA 电荷特性优化洗脱梯度),精准分离完整 IncRNA 与 DNA 模板、聚合酶等杂质,确保主峰纯度≥98%;
- 凝胶过滤:使用琼脂糖凝胶过滤柱,去除残留小分子杂质与盐类,同时避免长链 RNA 因反复浓缩导致的断裂。最终产品内毒素含量<0.05 EU/μg,RNase 残留<0.01 U/μg,满足原代细胞、干细胞等敏感细胞的转染需求。
4. 全流程质控,聚焦 IncRNA 功能有效性
建立针对 IncRNA 的专项质控体系,覆盖 “合成 - 纯化 - 功能验证” 全流程:
- 结构完整性检测:采用 Agilent Bioanalyzer(RNA 6000 Pico Kit)与 1% 琼脂糖凝胶电泳,确保 IncRNA 无明显降解(完整片段比例≥85%),分子量与理论值偏差<2%;
- 浓度与纯度检测:通过 Qubit 荧光定量仪(RNA 高灵敏度试剂盒)与 Nanodrop 检测,确保 A260/A280 比值 1.8-2.1,A260/A230 比值≥2.0(无盐类与有机物污染);
- 功能活性验证:根据 IncRNA 功能类型(如 miRNA 海绵、转录调控因子),提供针对性活性检测:如通过双荧光素酶报告基因实验验证 miRNA 结合能力,通过 ChIRP-seq(RNA 亲和纯化测序)验证 DNA 结合区域,确保 IncRNA 功能活性达标;
- 稳定性检测:通过 zeta 电位检测评估 IncRNA 胶体稳定性(电位绝对值≥15mV,避免储存中聚集),并提供 4℃、-20℃、-80℃储存条件下的稳定性数据(监测 2 个月内的完整性与活性变化)。每批次产品提供详尽质检报告,批次间性能差异<5%,为实验结果的可重复性提供保障。
5. 灵活交付与增值服务,适配 IncRNA 研究节奏
配备 IncRNA 专项生产与质控团队,标准订单 7-10 个工作日内完成交付(超长链 IncRNA>5000nt 需额外 2-3 个工作日),加急订单最快 5 个工作日出具产物;支持从 μg 级(科研小试,如细胞系功能验证)到 mg 级(中试生产,如动物体内实验)的产量定制,可根据客户需求分批次交付(避免反复冻融影响长链 RNA 活性)。针对高通量 IncRNA 筛选项目,提供批量合成服务,并可提供混样、分装(按实验需求分至 96 孔 / 384 孔板)及与转染试剂的预混合服务,大幅提升实验效率。
三、服务规格与交付内容
1. 服务规格
| 服务项目 | 服务详情 |
| 合成类型 | 全长 IncRNA、截短体 IncRNA、功能区域片段、对照 IncRNA |
| 合成长度 | 200-10000nt(常规),支持>10000nt 超长链 IncRNA 定制(需提前评估可行性) |
| 修饰选项 | 5' 端:帽子结构、磷酸化、荧光标记、生物素;3' 端:polyA 尾、荧光标记、生物素;全链修饰:2'-O - 甲基化、假尿苷、m6A |
| 产量范围 | 1μg-50mg(可根据需求定制更大规模) |
| 适配场景 | 细胞水平 IncRNA 功能研究、动物体内 IncRNA 干预实验、RNA - 蛋白 / DNA 互作研究、疾病 biomarker 验证 |
2. 检测项目
| 检测内容 | 周期 |
| Total Potein Residue | 一周 |
| Plasmid DNA Residue | 一周 |
| dsRNA residue | 一周 |
| Endotoxin assay | 一周 |
| BioBurden | 两周 |
3. 交付内容
- 高纯度 IncRNA 样本:无菌无酶低吸附离心管分装(避免长链 RNA 吸附管壁,50-500μL / 管),干冰运输,-80℃储存可稳定保存 12 个月以上(建议分装后避免反复冻融);
- 完整质检报告:根据客户需求可提供包含浓度 / 纯度数据、电泳图谱(Bioanalyzer 与琼脂糖凝胶)、功能活性验证报告(如双荧光素酶数据、ChIRP-seq 结果摘要)、修饰效率检测(如适用)、内毒素与 RNase 残留检测报告;
- 使用指南:涵盖 IncRNA 溶解方法(推荐使用无酶水,温和混匀)、转染条件优化建议(如转染试剂选择、IncRNA 浓度梯度设置)、储存与稳定性说明、功能检测方法参考(如 RNA-FISH、RIP 实验操作要点);
- 原始数据文件:根据客户需求可提供包含电泳原始图谱、荧光定量数据、功能验证实验原始数据(如测序原始数据、灰度分析结果),方便客户追溯与发表需求。
四、应用场景
1. 基因调控机制研究
用于细胞系中 IncRNA 功能验证,如通过过表达 / 沉默特定 IncRNA,检测其对靶基因转录(qPCR)、蛋白表达(Western blot)及染色质状态(ChIP-seq)的影响,解析 IncRNA 在细胞分化、周期调控、信号通路中的作用机制(如探索 IncRNA 在胚胎干细胞干性维持中的调控网络)。
2. 疾病机制探索与 biomarker 验证
在疾病模型(如肿瘤细胞系、动物疾病模型)中,通过合成疾病相关 IncRNA(如致癌 IncRNA H19、抑癌 IncRNA MEG3),研究其在疾病发生发展中的作用(如促进肿瘤增殖、转移);同时可将合成的 IncRNA 作为标准品,用于临床样本中 IncRNA 表达水平的定量检测(如 qPCR 校准),验证其作为疾病诊断 / 预后 biomarker 的可行性。
3. RNA - 蛋白 / DNA 互作研究
通过合成生物素标记的 IncRNA,结合 RNA 免疫沉淀(RIP)、染色质分离 RNA 纯化(ChIRP)、RNA pull-down 等技术,筛选与 IncRNA 相互作用的蛋白(如转录因子、组蛋白修饰酶)或 DNA 区域(如启动子、增强子),揭示 IncRNA 发挥功能的分子伴侣与作用靶点,为后续机制解析提供关键线索。
4. 药物研发与靶点验证
在药物研发早期,通过合成 IncRNA 模拟其在疾病状态下的异常表达,评估候选药物对 IncRNA 功能的调控效果(如抑制致癌 IncRNA 的表达或活性);同时可将 IncRNA 作为潜在治疗靶点,通过设计靶向 IncRNA 的小分子药物或核酸药物(如 siRNA、ASO),验证其对疾病模型的干预效果,加速药物研发进程。
五、服务流程与技术支持
1. 服务流程
- 需求沟通:客户提供 IncRNA 序列(或靶基因 / 功能需求)、修饰需求、产量要求及功能验证方向,技术团队提供序列设计方案(含二级结构预测与优化建议)、对照 IncRNA 推荐及方案报价;
- 序列确认与合成:客户确认序列后,启动长链 RNA 专属合成流程,全程监控转录过程(通过实时电泳监测产物完整性);
- 纯化与质控:完成合成后进行分级纯化,同步开展专项质控检测(含功能活性验证);
- 交付与售后:质检合格后,产品与报告同步交付,提供后续实验技术支持。
2. 技术支持
- 专业咨询:提供 IncRNA 序列设计(如二级结构优化、功能区域保留)、实验方案设计(如转染方法选择、互作实验技术路线)、数据分析建议(如高通量测序数据解读),协助解决 IncRNA 转染效率低、功能验证结果不稳定等问题;
- 问题解决:针对 IncRNA 降解、活性不达预期等问题,提供 troubleshooting 方案(如调整储存条件、优化修饰类型、更换合成片段);
- 定制化培训:为客户团队提供 IncRNA 合成与应用相关培训,包括长链 RNA 体外转录原理、纯化技术、功能验证实验操作(如 RIP、ChIRP)等,提升客户自主实验能力。
IncRNA synthesis and purification 服务以 “长链适配、功能导向、稳定可靠” 为核心,通过专项技术优化与严格质控,为 IncRNA 研究领域提供高质量产品与专业服务,助力科研人员与企业突破长链非编码 RNA 研究技术瓶颈,加速表观遗传学与疾病机制研究的创新发展。
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