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北京百泰派克生物科技有限公司
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wb蛋白磷酸化的出不来的原因
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Western Blot检测蛋白磷酸化失败的常见原因分析
蛋白磷酸化作为重要的翻译后修饰,在细胞信号转导中发挥关键作用,而Western Blot(WB)是检测磷酸化蛋白的经典方法。然而,实验过程中常遇到wb蛋白磷酸化的出不来的情况,这往往涉及样本处理、抗体选择、实验条件等多方面因素。磷酸化蛋白的不稳定性是首要挑战,磷酸酶在裂解过程中可能持续作用,导致磷酸化信号丢失。研究表明,即使使用常规磷酸酶抑制剂混合物,某些组织样本(如脑组织)中蛋白磷酸化状态的降解仍可能在10分钟内完成。其次,磷酸化表位的遮蔽效应不容忽视,某些蛋白的磷酸化位点可能因空间构象变化或结合蛋白的遮挡而无法被抗体识别。此外,磷酸化蛋白在总蛋白中占比通常不足1%,低丰度特性要求实验必须优化上样量和检测灵敏度。
技术层面,wb蛋白磷酸化的出不来的原因还可能源于电泳条件不当。磷酸化会导致蛋白迁移率改变,使用常规的SDS-PAGE条件可能使目标条带偏离预期位置。例如,ERK1/2蛋白在磷酸化后迁移率会增加约5kDa,若未调整分离胶浓度可能导致条带识别错误。转膜环节同样关键,磷酸化蛋白通常分子量较小(如p21约21kDa),需要优化转膜时间(建议半干转<30min)避免过度转印造成的信号损失。抗体选择更直接影响结果,市售磷酸化抗体中约30%存在特异性问题,需通过肽段竞争实验验证。具体费用需要根据实验需求和样品情况来确定,但建议优先选择经文献验证的抗体克隆号。
实验设计缺陷也是wb蛋白磷酸化的出不来的重要诱因。未设置适当的阳性对照(如用冈田酸处理的细胞)会导致无法判断技术失败还是真实生物学现象。时间动力学实验若取样点设置不当(如生长因子刺激后仅检测15分钟时间点),可能错过瞬时磷酸化峰值。近期研究发现,某些激酶(如AKT)的磷酸化存在亚细胞区室化特征,全细胞裂解可能稀释信号。此外,磷酸化抗体与非磷酸化抗体的检测信号比例失衡(如总蛋白信号过强)也会掩盖磷酸化变化,建议两者上样量相差5-10倍。
常见问题:
Q1. 为何使用磷酸酶抑制剂后仍检测不到磷酸化信号?
A:可能涉及抑制剂组合不全(需同时加入NaF、β-甘油磷酸酯和钒酸盐),或样本处理温度过高(建议全程4℃操作)。某些组织(如肝脏)含有特殊磷酸酶(如PP2A),需补充抑制剂如Calyculin A。
Q2. 磷酸化抗体出现非特异性条带如何鉴别?
A:可通过肽段封闭实验验证:用合成磷酸化肽段预孵育抗体后,特异性条带应消失。另建议运行Phos-tag凝胶,磷酸化蛋白会出现迁移滞后,此现象可辅助确认目标条带。
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文献和实验【专题讨论】多种WB条带问题,时好时坏,找不到原因,大家帮忙来!
以前做的很好看的条带现在怎么做也做不出来原来的效果了,所有的液体和buffer都换了,尝试了很多次,都没见改善,大家来帮忙看看问题出在哪里?1,做的好的内参:不管齐不齐,但至少条带是一根一根的,边界很清楚,没有糊,没有影子,干净,即使中间空一个泳道,也不会出现串孔的现象。2,做的好的目的蛋白:可能拍照的原因出现了很多格子,但是不影响,目的条带是两条带,同样每跟都很清晰,没有串孔,没有拖带,边缘没有发毛发糊。以上两条是同一时期做出来的,那时基本怎么做怎么出来,都很漂亮。可是下面的就有很多问题
WB 是检测和定量磷酸化蛋白质的重要实验方法,然而大家一直都说磷酸化蛋白 WB 不好做!这是因为处于不同的细胞生长状况和 / 或特定的细胞周期时,磷酸化蛋白可能仅占细胞总蛋白中的一小部分,处理不得当时,还会快速的去磷酸化。磷酸化蛋白质 WB 做不好的原因有许多,比如封闭问题,抗体问题,或所需的磷酸化蛋白可能不存在于样品中或者低于 WB 检测的量。然而,有一个常被大家忽视的重要原因就是蛋白样品制备所用的方法是否适合于磷酸化蛋白的提取?其实蛋白质提取的方法不仅影响提取效率,还会影响蛋白的质量
【求助】矛盾的实验结果:IKb alpha和NFKB同时升高
吴佰霖 我的基因过表达,结合文献,推理应该是IKb alpha下降,而NFKB升高 (IKb可磷酸化NFKB,使后者降低) 但现在我的结果是两者同时升高,请问可能的原因有哪些呢? 谢谢 woxingwosu 可否检测一下NFKB的磷酸化情况? erik NFKB是检测核内的吗?检测p65还是p50/ 吴佰霖 检测总蛋白
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