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北京百泰派克生物科技有限公司
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组蛋白上都存在哪些修饰其作用是什么
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组蛋白修饰的类型及其生物学功能
组蛋白是染色质的基本结构蛋白,其翻译后修饰(Post-translational modifications, PTMs)在基因表达调控、DNA损伤修复、染色体组装等关键生物学过程中发挥核心作用。目前已鉴定的组蛋白修饰类型超过20种,主要包括甲基化、乙酰化、磷酸化、泛素化、SUMO化、ADP-核糖基化等。这些修饰通过改变染色质结构或招募效应蛋白(如“阅读器”结构域蛋白)来动态调控基因组功能。
组蛋白甲基化是zuì常见的修饰之一,主要发生在赖氨酸(K)和jīngānsuān(R)残基上。例如,H3K4me3(组蛋白H3第4位赖氨酸三甲基化)与基因启动子区的转录激活密切相关,而H3K27me3则介导转录抑制,是Polycomb抑制复合物(PRC2)的标志性修饰。组蛋白乙酰化(如H3K27ac)通过中和赖氨酸正电荷降低组蛋白与DNA的亲和力,促进染色质开放和转录激活。磷酸化修饰(如H3S10ph)在细胞有丝分裂和应激响应中起关键作用。泛素化(如H2AK119ub)和SUMO化则参与DNA损伤修复途径。此外,新型修饰如巴豆酰化(crotonylation)和丙二酰化(malonylation)近年来被证实与代谢调控和精子发生等过程相关。
组蛋白修饰的组合模式构成“组蛋白密码”,其动态调控由“写入酶”(如甲基转移酶)、“擦除酶”(如去甲基化酶)和“阅读器”蛋白(如含Bromo或Chromo结构域的蛋白)协同完成。例如,H3K4me3与H3K27ac的共定位标志活跃的增强子,而H3K9me3与DNA甲基化的组合则形成稳定的异染色质。技术层面,染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)是研究组蛋白修饰的主流方法,具体费用需要根据实验需求和样品情况来确定。
组蛋白修饰的异常与癌症、神经退行性疾病等密切相关。例如,H3K27M突变在儿童脑胶质瘤中导致全局H3K27me3水平下降,而组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂已用于白血病治疗。此外,环境因素(如缺氧)可通过调控组蛋白去甲基化酶KDM6A影响细胞命运决定。
常见问题:
Q1. 组蛋白修饰如何实现位点特异性调控?
A:位点特异性由修饰酶与DNA序列特征(如CpG岛)、转录因子或非编码RNA(如lncRNA)的协同作用决定。例如,DNA结合蛋白CTCF可招募组蛋白乙酰转移酶p300至绝缘子区域。
Q2. 组蛋白修饰的跨代遗传机制是什么?
A:通过DNA复制时亲本组蛋白的定向分配(如H3-H4四聚体的保守传递)及子代链修饰的快速重建实现。PRC2复合物可识别预存的H3K27me3并催化新合成组蛋白的甲基化。
Q3. 组蛋白巴豆酰化的生物学意义是什么?
A:该修饰由巴豆酰fǔméiA驱动,在减数分裂和精子发生中富集,其动力学受去巴豆酰化酶SIRT3调控,可能通过影响染色质压缩程度参与生殖细胞特异性基因表达。
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文献和实验&Tag 技术混淆,CUT&Tag 技术在异染色质位点上有很好的结果,Henikoff 推荐的阳性对照就是存在于异染色质区域的 H3K27me3,且我们的客户在 H3K27me3 以及 H3K27AC 上都有很好的结果。 4. ConA beads 的作用是什么?如果没有 ConA beads ,能否用离心法代替? ConA beads 是经过 Concanavalin A(刀豆蛋白A,ConA)包被的磁珠。ConA 是一种从刀豆和豌豆等籽粒中提取出来的植物
并拮抗聚梳基因 polycomb 沉默,另外磷酸化不仅是某些信号转导通路的重要中间步骤,而且常与其他类型的修饰相互作用,共同参与细胞分裂、影响细胞周期。 1.组蛋白乙酰化和去乙酰化 染色质是由 DNA 双链缠绕组蛋白和非组蛋白形成。基因表达的中心问题之一是,各种转录因子与 RNA 聚合酶是如何接近紧密包裹在染色质中 DNA 的。组蛋白乙酰化后,染色体处于开放状态而利于转录,并上调基因的表达。 乙酰化修饰是一个在细胞核或细胞质的亚细胞器内广泛存在的翻译后修饰调控机制,组蛋白乙酰化与基因活化以及 DNA
Angew. Chem:刘涛 / 罗小舟 / 刘小云团队在组蛋白表观遗传学研究中取得进展
随着蛋白质谱技术的发展,许多组蛋白赖氨酸残基的酰化修饰被鉴定出来,其中巴豆酰化修饰是一类在酵母、哺乳动物等真核生物中保守存在的组蛋白酰化修饰。自 2011 年被发现以来,巴豆酰化修饰俨然成为了领域内的研究热点。这是因为该修饰是一种重要的表观遗传机制调节基因转录的翻译后修饰。尽管巴豆酰化和乙酰化基团的化学结构类似,却可能存在不同于乙酰化修饰的生物学功能。因此,揭示不同酰化修饰在组蛋白同一位点的生物学功能差异是研究组蛋白酰化修饰的难点问题。 北京时间 5 月 30 日,北京大学药学院刘涛课题
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