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北京百泰派克生物科技有限公司
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细胞表面蛋白质和相互作用
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细胞表面dànbáizhì和相互作用:分子识别与信号传导的界面
细胞表面dànbáizhì是镶嵌在细胞膜上的功能性大分子,其胞外结构域直接参与细胞与微环境的动态交流。这类dànbáizhì约占人类dànbáizhì组的30%,包括受体、黏附分子、转运体和酶等,通过特异性相互作用介导免疫应答、细胞间通讯、物质转运等关键生理过程。从结构特征来看,细胞表面dànbáizhì通常具有跨膜α螺旋结构域,其N端位于胞外区并经常发生糖基化修饰,这种翻译后修饰显著影响dànbáizhì稳定性及相互作用特异性。例如,免疫检查点蛋白PD-L1通过糖基化修饰逃避免疫系统识别,而整合素家族依赖糖链结构调控细胞-基质黏附强度。
在相互作用机制层面,细胞表面dànbáizhì遵循"锁钥模型"和"诱导契合模型"实现分子识别。Notch受体与Delta配体的结合展示了典型的机械力激活特性:当配体-受体复合物受到细胞骨架产生的牵引力时,Notch的负调节区发生构象变化,暴露出ADAM蛋白酶切割位点。这种力敏感相互作用在胚胎发育中jīngquè调控细胞命运决定。近年来,冷冻电镜技术解析了GPCR与G蛋白复合物的三维结构,揭示了跨膜信号转导中"构象波"的传递路径——β2shènshàngxiànsù受体激活时,其跨膜螺旋的扭转运动通过变构效应传递至胞内G蛋白结合界面。
研究细胞表面dànbáizhì和相互作用的技术体系主要包括表面等离子共振(SPR)、生物膜层干涉术(BLI)和单分子力谱。SPR通过检测金膜表面折射率变化实时量化结合动力学,实验费用根据样品通量和分析模式而异。BLI则利用光纤生物传感器记录分子结合引起的干涉光位移,特别适合膜蛋白-脂质相互作用研究。2018年开发的DNA-PAINT超分辨成像技术将定位精度提升至5nm,实现了突触间隙中神经细胞表面dànbáizhì和相互作用的纳米级图谱绘制。
在转化医学领域,针对细胞表面dànbáizhì和相互作用的干预策略已催生多个重磅药物。抗CD20单抗利妥昔单抗通过交联B细胞表面CD20分子诱导补体依赖的细胞毒作用,而双特异性抗体Blinatumomab则同时结合T细胞CD3ε和肿瘤细胞CD19,人工构建免疫突触。值得注意的是,CAR-T疗法中设计的嵌合抗原受体本质上是对T细胞表面dànbáizhì和相互作用网络的工程化改造,其共刺激域选择(CD28或4-1BB)直接影响T细胞增殖持久性。
常见问题:
Q1. 如何区分细胞表面dànbáizhì的顺式(cis)和反式(trans)相互作用?
A:顺式相互作用指同一细胞膜上相邻分子的结合,可通过FRET效率定量或交联质谱鉴定;反式相互作用涉及两个细胞的表面蛋白结合,需使用双细胞共培养系统配合显微操作技术。关键区分指标是相互作用对细胞间距的敏感性。
Q2. 细胞表面dànbáizhì糖基化修饰如何调控相互作用亲和力?
A:糖链通过三种机制调控结合:1)空间位阻效应,如CD44的唾液酸化抑制透明质酸结合;2)构象稳定作用,如EGFR的N-糖基化维持配体结合口袋的开放状态;3)直接参与结合界面,如选择素与唾液酸-Lewis X的特异性识别。质谱糖型分析结合分子动力学模拟是研究该问题的金标准。
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文献和实验一、引言 在许多的细胞生命活动中,例如 DNA 复制、mRNA 转录与修饰以及病毒的感染等都涉及到 DNA 与蛋白质之间的相互作用的问题。 重组 DNA 技术的发展,人们已分离到了许多重要的基因。现在的关键问题是需要揭示环境因子及发育信号究竟是如何控制基因的转录活性。为此需要: 1. 鉴定分析参与基因表达调控的 DNA 元件。 2. 分离并鉴定这些顺式元件特异性结合的蛋白质因子。 这些问题的研究都涉及到 DNA 与蛋白质之间的相互作用。 研究 DNA-蛋白质相互作用的实验方法主要包括
研究应用|使用 NanoBiT 技术进行的蛋白质相互作用细胞内定位成像
NanoBiT 是一种结构互补报告分子系统,可用于 PPI 的细胞内检测。它已成功应用于药物筛选、信号传导分析和病毒感染机制分析等一系列研究领域。该系统由一个大型 BiT(LgBiT;17.6 kDa)和一个小型 BiT(SmBiT;11 个氨基酸)亚基组成,它们将与目标蛋白质融合。这些亚基随后在细胞中表达,因此只有靶向 PPI 才能使这些亚基形成功能酶,从而产生明亮的发光信号(图 1)。 图 1. NanoBiT 蛋白质相互作用系统概览(图像 Promega 提供) 1.
相当多的蛋白质行使功能的时候并不是单打独斗的,蛋白质们通过蛋白质相互作用形成复合体然后进行工作,在工作的过程中,蛋白质们也可以通过更换相互作用的伙伴从而改变蛋白质复合体的功能。因此,研究蛋白质的相互作用成为研究蛋白质功能和作用机制的最为重要的环节之一。另外,蛋白质相互作用的本质其实是三种力,氢键,分子间作用力(范德华力)和疏水力,因为这三种力的作用距离都非常的短,所以相互作用的蛋白我们通常认为它们必定相互接近,尽管这是个充分非必要命题,但是我们常常使用这个命题的逆命题来进行实验检测
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