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北京百泰派克生物科技有限公司
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4ddia定量蛋白组学
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4ddia定量蛋白组学:新一代dànbáizhì组定量分析技术革新
在现代dànbáizhì组学研究中,高精度、高通量的定量分析技术对揭示生物标志物、信号通路调控机制及疾病机理具有决定性作用。4ddia定量蛋白组学作为数据非依赖采集(DIA)技术的重要演进,通过四维分离(保留时间、离子迁移率、质荷比和离子强度)结合深度学习算法,实现了对复杂生物样本中低丰度dànbáizhì的深度覆盖和jīngzhǔn定量。其核心突破在于将传统DIA的二维分离扩展至四维空间,显著提高了谱图解析度与定量重复性。实验流程中,4ddia定量蛋白组学首先通过高效液相色谱(HPLC)分离肽段,再结合离子淌度质谱(IMS)区分共洗脱离子,zuì后利用高分辨率质谱采集碎片离子信息。相较于传统DIA或数据依赖采集(DDA),该技术将dànbáizhì鉴定数量提升30%以上,尤其擅长检测动态范围超过5个数量级的样本。
4ddia定量蛋白组学的数据处理依赖于新一代算法平台,如Spectronaut 15或DIA-NN,这些工具通过迁移学习模型优化了谱库构建流程,即使在没有先验谱库的情况下,也能通过“无库分析”模式实现可靠定量。在肿瘤微环境研究案例中,4ddia定量蛋白组学成功鉴定了乳腺癌组织样本中浓度低至attomole级的磷酸化修饰蛋白,其定量变异系数(CV)控制在6%以内。技术成本方面,具体费用需要根据实验需求和样品情况来确定,但核心价值在于其解决了传统技术对低丰度蛋白和翻译后修饰的检测瓶颈。
在临床应用层面,4ddia定量蛋白组学已证明对阿尔茨海默症脑脊液标志物的发现效率优于传统ELISA,其多组学整合能力可同时量化数千种dànbáizhì及其异构体。一项针对xīnguān病毒宿主因子的大规模研究中,该技术仅需单次进样即可完成对1,892种宿主蛋白的juéduì定量,数据完整度达85%。值得注意的是,4ddia定量蛋白组学对仪器平台的要求较高,需配备如timsTOF Pro 2等具备捕集离子淌度功能的质谱设备,以确保四维分离的数据质量。
常见问题:
Q1. 4ddia定量蛋白组学如何解决传统DIA技术中谱图干扰导致的定量偏差?
A:通过离子淌度分离增加第三维分离度,结合四维数据空间的动态去卷积算法,可有效区分共洗脱肽段的同量异序离子,将定量干扰降低至传统DIA的1/3以下。
Q2. 该技术对翻译后修饰(PTM)分析的灵敏度为何显著优于DDA?
A:四维分离使修饰肽段的离子信号在淌度维度形成特征性漂移时间分布,配合深度学习驱动的修饰位点定位算法,可将磷酸化肽段的检测限提升至zeptomole级。
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文献和实验本节课程介绍了label-free定量蛋白质组学技术的原理及应用。主要包括:(1)以MS数据为例,系统介绍label-free技术进行蛋白质定量的技术流程和原理。(2)介绍免费的label-free分析套件—Maxquant和Perseus。(3)以免疫沉淀(IP)数据为例,展示label-free进行蛋白质互作定量的应用。(4)以数据为例,展示label-free在外泌体蛋白定量分析中的应用。
定量蛋白质组学分析 定量蛋白质组学分析(Quantitative Proteomics)是对一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂混合体系内所有蛋白质进行精确鉴定和定量。可用于筛选和寻找任何因素引起的样本之间的差异表达蛋白,结合生物信息学揭示细胞生理病理等功能,同时也可对某些关键蛋白进行定性和定量分析。目前定量蛋白质组学技术常见标记(Label)和非标记的(Label Free)定量策略。 定量蛋白质组学技术常见的几类主要包括:Label Free定量蛋白组分析、SILAC与免疫
定量蛋白质组学 在分析正常组织或病理组织变化过程中(如在生长、分化、药物暴露或肿瘤发作期间)蛋白质的表达谱时,能够定量分析变化是非常重要的,明确地探测这些多肽经历的上调或下调过程也是很重要的。这些蛋白质有可能是药物作用的关键靶标,因此检测这些蛋白质对药物研发和医学处理至为重要。最早达到这个目标的方法是正确应用一些计算机程序(如Melanie或PDQuest)来分析比较这些组织(如正常组织和病理组织)的标准图。为了能够获得符合统计学要求的标准图,最少需要
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