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组蛋白甲基化有什么用
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组蛋白甲基化在表观遗传调控中的核心作用
组蛋白甲基化是表观遗传修饰的重要形式之一,通过将甲基基团共价结合到组蛋白尾部特定氨基酸残基上(如赖氨酸或jīngānsuān),直接调控染色质结构和基因表达活性。这一修饰由组蛋白甲基转移酶(HMTs)催化,其动态可逆性则由去甲基化酶(HDMs)调控。组蛋白甲基化有什么用?其核心功能体现在三个方面:一是作为基因表达的“分子开关”,例如H3K4me3标记活跃启动子,而H3K27me3与基因沉默相关;二是参与细胞命运决定,如在胚胎干细胞分化中,H3K27me3和H3K4me3的双价结构维持发育相关基因的“待激活”状态;三是与疾病机制密切相关,癌症中H3K27me3异常导致抑癌基因沉默,而H3K9me3的失调与神经退行性疾病相关。
从技术层面看,研究组蛋白甲基化有什么用通常依赖ChIP-seq(染色质免疫共沉淀测序)或质谱分析。具体费用需要根据实验需求和样品情况来确定。ChIP-seq通过抗体特异性富集甲基化组蛋白结合的DNA片段,结合高通量测序可绘制全基因组修饰图谱;而质谱技术能jīngquè定量修饰位点的甲基化程度。此外,CRISPR-dCas9系统与甲基转移酶的融合工具(如dCas9-DNMT3A)可实现位点特异性甲基化编辑,为功能研究提供jīngzhǔn干预手段。
在临床应用上,组蛋白甲基化有什么用已成为药物开发靶点。例如EZH2抑制剂(如Tazemetostat)通过阻断H3K27me3生成治疗淋巴瘤,而LSD1抑制剂靶向H3K4me2/H3K9me2去甲基化过程用于白血病治疗。这些进展凸显了组蛋白甲基化在jīngzhǔn医学中的潜力。
常见问题:
Q1. 组蛋白甲基化修饰在不同细胞类型中是否具有保守性?
A:组蛋白甲基化模式具有显著细胞特异性。例如,H3K4me3在活跃基因启动子的分布相对保守,但增强子区域的H3K4me1/me2修饰会随细胞类型动态变化。此外,谱系特异性基因的沉默常伴随H3K27me3的差异沉积。
Q2. 组蛋白甲基化如何与非编码RNA协同调控基因表达?
A:组蛋白甲基化与lncRNA(如XIST)形成反馈环路。XIST通过招募PRC2复合体催化H3K27me3沉积,实现X染色体沉默;反之,某些miRNA(如miR-101)可直接靶向EZH2 mRNA,调控H3K27me3水平。这种交叉调控网络在发育和癌症中至关重要。
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文献和实验信息非常全面了,但实际上我们并用不到这么多,有下面这些就够了方法三:从 ChAMP 包中提取这个方法严格来说其实是从 ChAMP 依赖的两个注释包中提取的,但是我又懒又笨,懒得看原始的包里数据藏在哪里了,ChAMP 包在做甲基化分析的时候也很方便,而其中 champ.filter 函数直接就提取好了850k 和 450k 本质上没有什么区别,所以方法都是通用的。
xthua Cell, Nature 都出版过拟南芥的甲基化图谱的文章,但是细菌的甲基化图谱未见报道,如果单从基因组的大小考虑,细菌的更加容易测序。 各位以为细菌的甲基化图谱有其表观遗传学的意义么? Fasta921 xthua wrote: Cell, Nature 都出版过拟南芥的甲基化图谱的文章,但是细菌的甲基化图谱未见报道,如果单从基因组的大小考虑,细菌的更加容易
Nat Chem Biol:精氨酸甲基化转移酶调控三阴性乳腺癌的内源免疫新机制
inhibition triggers the viral mimicry response in Triple Negative Breast Cancer 的研究论文,揭示了精氨酸甲基化转移酶调控内源免疫的新机制,为三阴性乳腺癌的免疫治疗提供了新的策略。 作者首先利用表观遗传小分子抑制剂对三阴性乳腺癌进行了系统筛选,鉴定出精氨酸甲基化转移酶可能是新的治疗靶点。并结合化学生物学、细胞生物学和生物信息学的方法对其作用机制进行了深入探讨,发现靶向精氨酸甲基化转移酶可调控细胞内的可变剪接,造成大量内含子滞留,滞留
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