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文献和实验芯空一号快讯|GeoMx DSP 570蛋白联合PCF空间蛋白解析肿瘤微环境
面对高度异质的肿瘤微环境,仅检测少量靶标往往难以发现新的分子线索,而单一技术也难以同时兼顾检测通量与细胞分辨率。GeoMx DSP依托570 IPA及1200+ DPA等高通量空间蛋白panel,可在特定组织区域内系统筛选疾病相关蛋白、异常通路及候选标志物。其中,1200+ DPA是目前商业化空间蛋白检测中通量最高的方案。进一步联合PCF单细胞空间蛋白技术,可将高通量筛选出的候选分子定位至具体细胞群体,解析其空间分布及微环境组成,形成区域高通量发现到单细胞精细验证的完整研究路径
针对传统技术难以解析T细胞发育连续动态的瓶颈,德国汉堡大学团队推出了14色流式方案(OMIP-073)。该方案通过精准圈门与抗体优化,完整描绘了从早期祖细胞到成熟T细胞的14个关键发育阶段,并利用CD1a、CD28等标志物清晰界定了β选择及外迁等核心检查点。流式细胞术作为一套标准化的高分辨率分析工具,它能有效识别健康及疾病状态下的胸腺发育异常,为免疫疾病的机制研究提供了强有力的支持。 Panel方案该14色流式检测方案(OMIP-073)通过组合多种荧光标记抗体,实现了对人类胸腺细胞发育全过程
芯空一号快讯 | CosMx SMI揭示肿瘤内细菌重塑癌细胞状态并推动结直肠癌化疗抵抗
转录组技术,对人结直肠癌组织中Fusobacterium富集微生态位进行原位解析。研究通过PanCK、CD45和ATP1B3进行细胞分割,并结合自定义细菌探针和约1000个人类基因panel,在单细胞水平同时定位细菌信号和宿主细胞转录状态。 空间邻域分析显示,细菌信号最高的区域富集巨噬细胞、中性粒细胞、单核细胞和树突状细胞等髓系免疫细胞,同时仅包含少量癌上皮细胞。位于细菌富集生态位中的癌上皮细胞表现出明显低转录特征,包括总转录本数量减少、检测到的基因数降低,以及转录、翻译、核糖体、组蛋白和热休克
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