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- 6mA免疫沉淀测序(6mA-IP Seq)通过特异性抗体富集6mA甲基化的DNA片段，结合NGS测序技术在全基因组水平上分析6mA修饰信息。
- 深圳市光明区
- 2026年04月23日
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深圳市艾斯基因科技有限公司
- 服务名称：
DNA 6mA免疫沉淀测序 (6mA-IP Seq)
DNA 6mA免疫沉淀测序(6mA-IP Seq)
N6-甲基脱氧腺苷(6mA)是原核生物和真核生物的DNA修饰类型之一，
在细菌、藻类及植物基因组中普遍存在，在DNA错配修复、染色体分离和毒力调节中发挥作用。
6mA免疫沉淀测序(6mA-IP Seq)通过特异性抗体富集6mA甲基化的DNA片段，结合NGS测序技术在全基因组水平上分析6mA修饰信息。
用心服务每一个项目
专注表观组学10年，提供专业有价值的DNA甲基化完整解决方案;
国内较早开发6mA-seq技术团队之一, 严格的内参质控;
已经完成藻类及动植物及人等多个物种6mA-seq项目经验;
专业的生物信息分析团队, 提供更多个性化分析思路和方案。
科学方案设计
从项目方案、样本处理、建库测序，到数据分析;
每个项目需要专业、有价值的建议;及时高效的沟通，以保障高质量研究成果。
样本类型和要求
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样本类型 |
样本要求 |
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基因组DNA |
总量≥ 5ug; 浓度≥ 50ng/ul; 基于Qubit定量 |
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动植物、藻类、低等生物等 |
按照送样要求准备 |
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备注：用封口膜密封样品; 干冰运输 | |
数据分析
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6mA-IP Seq |
分析内容 |
备注 |
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标准分析 |
1、测序数据质量评估 |
过滤掉低质量数据，保证数据质量 |
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2、与参考基因组比对 |
测序Reads 在基因组上的分布 | |
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3、6mAPeak峰Calling |
6mADNA富集区域鉴定 | |
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4、6mAPeak图谱分析 |
6mAPeak在基因组，染色体，功能元件上的分布 | |
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6、组间差异6mAPeak分析 |
寻找6mADMR及注释 | |
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7、差异6mAPeak基因分析 |
相关基因GO，KEGG富集分析 | |
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高级分析 |
8、多组学整合关联分析 |
例如与转录组关联分析 |
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9、其它定制化分析 |
结合课题背景亮点挖掘 |
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文献和实验干货 | CUT and Tag 让 ChIP-Seq更简单高效！
&Tag 技术的实验流程简单，可一步实现 DNA 的片段化和接头连接，仅需 9h 即可实现从细胞到二代测序文库的转化。 实验流程主要包括：①收集细胞；②分别孵育一抗和二抗；③孵育 pA/pG-Tn5 转座子（Hyperactive pA/pG-Tn5 Transposon）；④激活转座子，进行 DNA 片段化；⑤DNA 提取；⑥文库扩增与纯化。 1. 细胞起始量低 投入不同起始量的 HEK293 细胞（ 100 或 10,000 个细胞），按照 Vazyme #TD901
多样性也是把“蛋糕”做大的关键。 首先 TCR/BCR 的本质是细胞膜表面蛋白受体，其生成过程都要走过 DNA 转录成 RNA 进而翻译生成蛋白质。 在组成结构上，两种抗原识别受体均由两条不同链连接而成，TCR（1 条 α 链+1 条 β链），BCR（2 条重链+2 条轻链）。其中 α 链和轻链受基因片段 VJC 区域编码，组合形式相对简单，β 链和重链受基因片段 V(D)JC 区域编码。 基因片段 V(D)J (Variable-可变区; Diversity-多样区; joining
—— co-IP 检测 Hsp90 与 Cdc37 结合情况1、实验材料SKBR3 细胞，PMSF（Amresco，cat:329-98-6），cocktail（上海晶莱生物），脱脂奶粉（cat:66196131T），β-actin（上海晶莱生物）。Anti-Hsp90(santa,cat:sc-69703)、Anti-Cdc37(santa,cat:sc-13129)、Protein A+G agrose(Beyotime)，细胞刮，4 度离心机（eppendorf，centrifuge
技术资料暂无技术资料 索取技术资料
