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简化基因组甲基化测序 (RRBS)

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  • 简化基因组甲基化测序 (RRBS)通过酶切富集启动子及CpG 岛区域,并进行Bisulfite 测序
  • 深圳市光明区
  • 2026年04月28日
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      深圳市艾斯基因科技有限公司

    • 服务名称

      全基因组甲基化测序WGBS技术服务

    简化甲基化测序(Reduced Representation Bisulfite Sequencing,RRBS),

    通过酶切富集启动子及CpG 岛区域,并进行Bisulfite 测序;

    作为高性价比的甲基化研究方法,RRBS在大规模临床样本的研究中具有普遍的应用;

    在经典RRBS基础上,艾斯基因在国内较早推出强化版 RRBS,助力全基因组甲基化测序,

    可覆盖全基因组范围内超过6-9M个CpG 位点,>90%数量的CpG岛及>85%数量的基因启动子。

     

    重点技术质控,用心服务每一个项目

    艾斯团队专注表观组学10年,提供专业有价值的DNA甲基化完整解决方案;

    较早开发RRBS技术团队之一, 国内较早推出强化版RRBS服务;

    已经完成人、哺乳动物及鱼类等多个物种, 10000+例样本项目经验;

    严格的RRBS技术质控,MSPI酶切率>95%, Bisulfite转化率>99%;

    自动化样本处理、建库及分析流程,保障高效周期,40天极速交付;

    低至10ng建库,满足穿刺、流式分选、微切等微量珍贵样本的研究;

    重点团队在Nature、Epigenetics、DNA Res等杂志发表多篇SCI论文;

    专业的生物信息分析团队, 提供更多个性化分析思路和方案。

     

    科学方案设计

    从项目方案、样本处理、建库测序,到数据分析;

    每个项目需要专业、有价值的建议;及时高效的沟通,以保障高质量研究成果。

    产品细节图片1

     

    样本类型和要求

    样本类型

    样本要求

    基因组DNA

    总量≥ 1ug; 浓度≥ 30ng/ul; 完整性好; 基于Qubit定量

    细胞、全血、动物新鲜冷冻组织

    按照送样要求准备

    备注1:不推荐FFPE、cfDNA等片段化样本类型;

    备注2:不适合植物物种;

    备注2用封口膜密封样品; 干冰运输

    数据分析

    RRBS

    分析内容

    备注

    标准分析

    1、测序数据质量评估

    过滤掉低质量数据,保证数据质量

    2、与参考基因组比对

    比对率和覆盖度分析

    3、MSPI酶切及Bisulfite转化率质控

    MSPI酶切效率>95%; Bisulfite转化率>99%

    4、甲基化位点Calling

    评估胞嘧啶甲基化状态

    5、甲基化分布图谱分析

    甲基化在基因组、功能元件上的分布

    6、组间差异甲基化DMR分析

    寻找DMR及注释

    7、差异甲基化基因DMG分析

    DMG富集分析GO,KEGG

    8、多样本聚类分析

    PCA分析多样本甲基化变化规律

    高级分析

    9、多组学整合关联分析

    例如与转录组关联分析

    10、其它定制化分析

    结合课题背景亮点挖掘

     

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    • 【求助】关于基因组测序

      qiangshou2010 我想问个这几天一直想不明白的事情。 现在人类基因组测序早就完成了,也开始了其它物种的测序,包括猴子---恒河猴,rhesus,这几天我查了猴子的几个基因,发现在它的序列里包括了一部分的N。这些N表示什么意思呢?是当时没有测出来?还是不能找到合适的样本,才测不出来的? 在哪里可以查到序列完全测出来的物种呢?就拿猴子来说,哪种猴子的序列是测全了的呢? zhujoker

    • 基因组甲基化研究技术小结

      适用于绘制单碱基分辨率的全基因组DNA甲基化图谱。但是相应的费用也是相当高的。为了能用较低的成本得到全面的基因组甲基化状况,有两种性价比非常高的测序方法不得不提,那就是MeDIP-seq(甲基化DNA免疫共沉淀测序)和RRBS(简化的表观亚硫酸氢盐测序技术(Reduced Representation Bisulfite Sequencing))。 MeDIP-seq是基于抗体富集原理进行测序的全基因组甲基化检测技术,采用甲基化DNA免疫共沉淀技术,通过5'-甲基胞嘧啶抗体特异性富集

    • 【求助】全基因组测序的分析

      海边海鸥 偶的题目大致是研究某一细菌产生ESBLs,其基因组中含有耐药基因,但是表型(药敏试验仍对该类抗生素敏感)阴性。可能存在某些机制使该耐药基因未表达。打算进行该两株的全基因组测序,想请教一下主要从哪几方面考虑未表达的可能性。谢谢大家:) 海边海鸥 怎么没有建议呢? zhujoker 我来胡说2句吧,不知道细菌基因组有没有甲基化修饰,自己不做细菌,所以不能确定(但是偶刚才查一下的确好像

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