相关产品推荐更多 >
万千商家帮你免费找货
0 人在求购买到急需产品
- 详细信息
- 询价记录
- 文献和实验
- 技术资料
- 提供商:
深圳市艾斯基因科技有限公司
- 服务名称:
全基因组甲基化测序WGBS技术服务
简化甲基化测序(Reduced Representation Bisulfite Sequencing,RRBS),
通过酶切富集启动子及CpG 岛区域,并进行Bisulfite 测序;
作为高性价比的甲基化研究方法,RRBS在大规模临床样本的研究中具有普遍的应用;
在经典RRBS基础上,艾斯基因在国内较早推出强化版 RRBS,助力全基因组甲基化测序,
可覆盖全基因组范围内超过6-9M个CpG 位点,>90%数量的CpG岛及>85%数量的基因启动子。
重点技术质控,用心服务每一个项目
艾斯团队专注表观组学10年,提供专业有价值的DNA甲基化完整解决方案;
较早开发RRBS技术团队之一, 国内较早推出强化版RRBS服务;
已经完成人、哺乳动物及鱼类等多个物种, 10000+例样本项目经验;
严格的RRBS技术质控,MSPI酶切率>95%, Bisulfite转化率>99%;
自动化样本处理、建库及分析流程,保障高效周期,40天极速交付;
低至10ng建库,满足穿刺、流式分选、微切等微量珍贵样本的研究;
重点团队在Nature、Epigenetics、DNA Res等杂志发表多篇SCI论文;
专业的生物信息分析团队, 提供更多个性化分析思路和方案。
科学方案设计
从项目方案、样本处理、建库测序,到数据分析;
每个项目需要专业、有价值的建议;及时高效的沟通,以保障高质量研究成果。

样本类型和要求
|
样本类型 |
样本要求 |
|
基因组DNA |
总量≥ 1ug; 浓度≥ 30ng/ul; 完整性好; 基于Qubit定量 |
|
细胞、全血、动物新鲜冷冻组织 |
按照送样要求准备 |
|
备注1:不推荐FFPE、cfDNA等片段化样本类型; 备注2:不适合植物物种; | |
|
备注2:用封口膜密封样品; 干冰运输 | |
数据分析
|
RRBS |
分析内容 |
备注 |
|
标准分析 |
1、测序数据质量评估 |
过滤掉低质量数据,保证数据质量 |
|
2、与参考基因组比对 |
比对率和覆盖度分析 | |
|
3、MSPI酶切及Bisulfite转化率质控 |
MSPI酶切效率>95%; Bisulfite转化率>99% | |
|
4、甲基化位点Calling |
评估胞嘧啶甲基化状态 | |
|
5、甲基化分布图谱分析 |
甲基化在基因组、功能元件上的分布 | |
|
6、组间差异甲基化DMR分析 |
寻找DMR及注释 | |
|
7、差异甲基化基因DMG分析 |
DMG富集分析GO,KEGG | |
|
8、多样本聚类分析 |
PCA分析多样本甲基化变化规律 | |
|
高级分析 |
9、多组学整合关联分析 |
例如与转录组关联分析 |
|
10、其它定制化分析 |
结合课题背景亮点挖掘 |
风险提示:丁香通仅作为第三方平台,为商家信息发布提供平台空间。用户咨询产品时请注意保护个人信息及财产安全,合理判断,谨慎选购商品,商家和用户对交易行为负责。对于医疗器械类产品,请先查证核实企业经营资质和医疗器械产品注册证情况。
- 作者
- 内容
- 询问日期
文献和实验qiangshou2010 我想问个这几天一直想不明白的事情。 现在人类基因组测序早就完成了,也开始了其它物种的测序,包括猴子---恒河猴,rhesus,这几天我查了猴子的几个基因,发现在它的序列里包括了一部分的N。这些N表示什么意思呢?是当时没有测出来?还是不能找到合适的样本,才测不出来的? 在哪里可以查到序列完全测出来的物种呢?就拿猴子来说,哪种猴子的序列是测全了的呢? zhujoker
适用于绘制单碱基分辨率的全基因组DNA甲基化图谱。但是相应的费用也是相当高的。为了能用较低的成本得到全面的基因组甲基化状况,有两种性价比非常高的测序方法不得不提,那就是MeDIP-seq(甲基化DNA免疫共沉淀测序)和RRBS(简化的表观亚硫酸氢盐测序技术(Reduced Representation Bisulfite Sequencing))。 MeDIP-seq是基于抗体富集原理进行测序的全基因组甲基化检测技术,采用甲基化DNA免疫共沉淀技术,通过5'-甲基胞嘧啶抗体特异性富集
海边海鸥 偶的题目大致是研究某一细菌产生ESBLs,其基因组中含有耐药基因,但是表型(药敏试验仍对该类抗生素敏感)阴性。可能存在某些机制使该耐药基因未表达。打算进行该两株的全基因组测序,想请教一下主要从哪几方面考虑未表达的可能性。谢谢大家:) 海边海鸥 怎么没有建议呢? zhujoker 我来胡说2句吧,不知道细菌基因组有没有甲基化修饰,自己不做细菌,所以不能确定(但是偶刚才查一下的确好像
技术资料暂无技术资料 索取技术资料










