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- 提供商:
上海中科新生命生物科技有限公司
- 服务名称:
奥斯卡DIA乳酸化蛋白质组
- 规格:
样
· 产品定义
蛋白乳酸化修饰(Lactylation)是2019年发现的一种新的蛋白质翻译后修饰,发生在赖氨酸(K)上。最初的乳酸化是在组蛋白上被发现,且被证明参与受细菌感染的M1巨噬细胞的稳态调控[1]。随后,越来越多的研究表明,非组蛋白上也广泛分布着乳酸化。目前认为,组蛋白上的乳酸化通过改变染色体结构、调控转录因子结合以及调节基因启动子区域的可及性影响基因表达;非组蛋白上的乳酸化通过空间位阻、构象改变和电荷中和调节蛋白质功能,如通过影响分子互作、酶活性、亚细胞定位等影响蛋白质的功能,发挥调控功能。奥斯卡DIA乳酸化蛋白质组采用高特异性乳酸化抗体树脂富集乳酸化修饰肽段,同时使用赛默飞Astral高分辨质谱仪进行DIA全扫描数据采集。高特异性乳酸化肽段富集方法+Astral质谱仪优越的性能+DIA全扫描数据采集模式成就高深度乳酸化蛋白质组检测。
· 技术路线
修饰肽段使用乳酸化抗体树脂进行富集,富集后的肽段使用Astral高端质谱仪进行DIA模式的检测。由于发生乳酸化修饰的赖氨酸共价连接乳酸分子,分子质量会相应增加72.021Da,数据库搜索时,根据分子质量偏移,锁定乳酸化修饰肽段及位点。

· 数据分析
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标准数据分析内容 | |
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鉴定分析 |
鉴定与定量结果统计;单个样本蛋白质鉴定结果统计;韦恩图 |
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表达差异分析 |
差异结果统计;差异结果柱状图;火山图;聚类分析图; |
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功能分析 |
亚细胞定位、结构域分析;GO功能分析、KEGG通路分析;互作网络分析、转录因子分析、激酶分析、WGCNA分析 |
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· 推荐组合产品
- 奥斯卡DIA蛋白质组+奥斯卡DIA磷酸化蛋白质组
- 奥斯卡DIA乳酸化蛋白质组+奥斯卡DIA乙酰化
· 推荐应用领域
- 生理病理过程中的乳酸化分子特征分析
- 疾病分子机制挖掘
- 临床大队列样本分析,如肿瘤、心血管等重大疾病精准分型
· 送样建议
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样品类型 |
推荐送样量 | |
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动物组织类 |
常规动物组织(脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉、皮肤等) |
≥100mg |
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植物组织类 |
柔软组织(木本植物的叶、花等,草本科植物,藻类,蕨类植物,大型真菌等) |
≥1g |
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细胞样品 |
悬浮/贴壁培养细胞 |
≥2×10^7 |
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微生物类 |
细菌类 |
≥200mg |
· 参考文献
1. Zhang D, Tang Z, Huang H, et al. Metabolic regulation of gene expression by histone lactylation. Nature. 2019;574(7779):575-580
2. Yang Z, Zheng Y, Gao Q. Lysine lactylation in the regulation of tumor biology. Trends Endocrinol Metab. Published online February 22, 2024.
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文献和实验1. Zhang D, Tang Z, Huang H, et al. Metabolic regulation of gene expression by histone lactylation. Nature. 2019;574(7779):575-580
2. Yang Z, Zheng Y, Gao Q. Lysine lactylation in the regulation of tumor biology. Trends Endocrinol Metab. Published online February 22, 2024.
超微量外泌体蛋白质组突破用量极限和检测上限-低至200μL血浆!高达4000+ EV蛋白!
变性以及MS/MS谱图的质量(信息含量)的可变性。最终结果是,来自不同生物样本的数据集没有识别和量化同一组蛋白质;或者换句话说,DDA模式的lable-free定量蛋白质组学数据集将包含很多缺失值,并且这主要影响较低丰度的蛋白质。近年来,数据非依赖性采集(data-independent acquisition,DIA)技术出现,指定m/z范围内的所有前体离子都同时进行MS碎片化,复杂的MS2谱图与包含碎片离子谱图、前体离子精确质量及其归一化保留时间的谱图库搜库比对。DIA在增加已鉴定肽的数量、提高定量精度和增加
恩泽康泰进军家畜外泌体研究领域——全面解锁猪/牛/羊/鸡外泌体研究
/靶向肽修饰/细胞上清浓缩等工程化改造试剂盒,从最初的血浆等体液外泌体研究到时下最新的组织外泌体研究,从最初的外泌体电镜/粒径/WB三项基本表征到十余项外泌体质量检测体系,从最初的外泌体RNA组学/全转录组学到如今的集外泌体RNA全转录组/外泌体蛋白质组/外泌体代谢组学的Exoomics®外泌体多组学服务平台,从最初的thermo Q-E HFX平台普通外泌体lable-free蛋白质组学到集普通外泌体lable-free蛋白质组/4D lable-free蛋白质组/普通direct-DIA蛋白质组
及对比度而言将更客观、准确。为了避免曲解实验结果,两个样品的蛋白上样量要尽可能接近。由微小蛋白质的溶解性不同而不是电泳参数的原因造成的漂移,使用者至少要重复实验结果。有人试图通过 DNA 表达情况结合蛋白质组学数据及另一种标准运算法则 [14] 来克服这些问题。对不同胶上的样品进行更加准确的量化可以通过在一个更加复杂的方案中使用 3 种蓝色染料包括内标的使用来实现 [ 15 ] 。 2D-DIGE 在不同的生物学领域得到大量的运用,如食道 [10]、胃、结肠「 17 」、乳腺癌[18] 、白血
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