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项目背景:
通过LC-MS/MS技术对样本进行非靶向扫描分析,将质谱数据与该物种理论数据库进行比对,以鉴定样本中的蛋白质及其序列。适用于IP、Co-IP的胶点、胶条或溶液等样本的蛋白鉴定以及新物种蛋白质表达鉴定。
传统的蛋白质组学定量技术分为非标记定量和标记定量蛋白质组学:非标记定量方法称为Label-free,标记定量技术包括基于标签的TMT/iTRAQ和同位素标记的SILAC。鉴于质谱技术的发展,数据非依赖采集(DIA)模式也得到广泛的应用。
案例展示:
质谱用于互作蛋白质鉴定(CoIP样本)

定量蛋白质组学技术

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文献和实验1 背景和意义从生命活动的直接执行者——蛋白质的角度研究生命现象和规律(特别是疾病防治和病理研究)已成为研究生命科学的主要手段。而这些研究往往离不开对细胞、组织或器官中含有蛋白质种类和表达量的研究。对处不同时期、不同条件下蛋白质表达水平变化的研究,识别功能模块和路径,监控疾病的生物标志物,这些研究都需要对蛋白质进行鉴定和定量。生物质谱技术的出现和不断成熟为蛋白质差异表达分析提供了更可靠、动态范围更广的研究手段。基于质谱技术,科学家们不断开发出新的定量蛋白质组学方法,来了解细胞、组织或生物
注:如同时要求外泌体抽提、鉴定及蛋白质组学,请将样本要求量进行加和。 备注:请明确提供的样本体积。细胞上清及尿液,超过 50ml,每 50mL 算作一个 1 个样本,以此计算样本数,核算抽提周期。血清、血浆、关节液、脑脊液进行超速离心,每 5mL 算作 1 个样本,以此计算样本数,核算抽提周期。
,仍依赖于直接对蛋白质的研究来解决。因此要对生命的复杂活动有全面和深入的认识,必然要在整体、动态、网络的水平上对蛋白质进行研究(钱小红,贺福初,2003)。 蛋白质组学研究中常用的技术体系 方法学上,二维凝胶电泳-质谱仍然是目前最流行和可靠的技术平台(Rabilloud et al.,2000)。其一般过程是:细胞或组织样品――样品制备――二维凝胶电泳(2D-PAGE)分离蛋白质――计算机辅助分析 2D-PAGE 图象――对感兴趣的蛋白质进行酶解――质谱分析――数据库检索――蛋白质鉴定――分析
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