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项目背景:
通过LC-MS/MS技术对样本进行非靶向扫描分析,将质谱数据与该物种理论数据库进行比对,以鉴定样本中的蛋白质及其序列。适用于IP、Co-IP的胶点、胶条或溶液等样本的蛋白鉴定以及新物种蛋白质表达鉴定。
传统的蛋白质组学定量技术分为非标记定量和标记定量蛋白质组学:非标记定量方法称为Label-free,标记定量技术包括基于标签的TMT/iTRAQ和同位素标记的SILAC。鉴于质谱技术的发展,数据非依赖采集(DIA)模式也得到广泛的应用。
案例展示:
质谱用于互作蛋白质鉴定(CoIP样本)

定量蛋白质组学技术

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文献和实验注:如同时要求外泌体抽提、鉴定及蛋白质组学,请将样本要求量进行加和。 备注:请明确提供的样本体积。细胞上清及尿液,超过 50ml,每 50mL 算作一个 1 个样本,以此计算样本数,核算抽提周期。血清、血浆、关节液、脑脊液进行超速离心,每 5mL 算作 1 个样本,以此计算样本数,核算抽提周期。
breast epithelial MCF-10A cells. 科学问题:双酚 S (BPS) 与双酚 A (BPA) 具有相似的雌激素效应。考虑到 BPS 的内分泌干扰效应,本研究采用基于质谱的代谢组学和定量蛋白质组学方法,研究了 BPS 对正常人乳腺上皮细胞株 MCF-10A 的影响。 研究内容 表型实验:暴露于 BPS 达 24 小时后,MCF-10A 细胞的增殖以一种刺激的方式发生改变,在剂量为 1μM 时增殖率最高。 蛋白质组分析:总共有 200 种蛋白质被鉴定为在暴露于 BPS
University, Research Dr., C118 LSRC, Durham, NC 27710. Phone: (919) 613-8606. Fax: (919) 668-0977. E-mail: hayst001@mc.duke.edu . REFERENCES 蛋白质组相关设备及试剂: 液相HPLC系统 | 毛细管LC系统 | 气相色谱系统 | 自动固相萃取系统 | 联用色谱系统 | 更多... (a) Triple quadrupole. Triple
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