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文献和实验文献速递:全面液体分析循环肿瘤DNA和蛋白质生物标志物为评估预后带来新的可能
治疗过程中,血浆样本中体细胞SNV和CNV的定量水平以及相应的MRI成像结果。 该研究中用到的QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit可从含低浓度DNA和RNA碎片的原始样本(人血浆中常规游离DNA的浓度为1–100 ng/ml)中纯化和浓缩游离的DNA、RNA、miRNA,包括病毒核酸。并且大大简化了从血浆或血清中浓缩和纯化游离DNA和RNA的过程,仅仅包括4步(裂解、结合、洗涤和洗脱),使用QIAamp Mini离心柱在真空装置上处理。简单的操作适用于同时处理多个样品
常见的建树方法有:贝叶斯法(Bayesian),最大似然法(Maximum likelihood,ML),最大简约法(Maximum parsimony,MP),邻接法(Neighbor-Joining,NJ),最小进化法(Minimum Evolution,ME),类平均法(UPGMA)。一般来讲,如果模型合适,最大似然法的效果较好。对于近缘序列,最大简约法用的假设最少,各种方法结果相似。而对于远缘序列,一般使用最大似然法或邻接法。对相似度很低的序列,邻接法往往出现 Long-branch
研究应用|使用 NanoBiT 技术进行的蛋白质相互作用细胞内定位成像
NanoBiT 是一种结构互补报告分子系统,可用于 PPI 的细胞内检测。它已成功应用于药物筛选、信号传导分析和病毒感染机制分析等一系列研究领域。该系统由一个大型 BiT(LgBiT;17.6 kDa)和一个小型 BiT(SmBiT;11 个氨基酸)亚基组成,它们将与目标蛋白质融合。这些亚基随后在细胞中表达,因此只有靶向 PPI 才能使这些亚基形成功能酶,从而产生明亮的发光信号(图 1)。 图 1. NanoBiT 蛋白质相互作用系统概览(图像 Promega 提供) 1.
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