体外细胞系处理与甲基化/表达分析
比较常规和延长剂量阿扎胞苷对AML细胞系甲基化和基因表达的影响。
三种AML细胞系(OCI-AML2、MV-4-11、SKM-1)分别接受模拟常规(HE-LD)和延长(LE-ED)剂量的阿扎胞苷处理,在第3天和第5天进行全基因组亚硫酸盐测序和RNA测序,并测量DNMT1蛋白水平。
Extended exposure to low doses of azacitidine induces differentiation of leukemic stem cells through activation of myeloperoxidase
包含体外细胞系模型、体内同系和PDX模型、LSC模型,并进行了功能验证和机制验证(MPO抑制和ROS清除)。
OCI-AML20细胞系 OCI-AML2、MV-4-11、SKM-1细胞系 C1498-Luc3-GFP同系小鼠模型 FLT3-ITD;TET2;LysM-cre嵌合小鼠模型 患者来源异种移植(PDX)模型
阿扎胞苷给药方案:常规剂量(3 mg/kg QDx5或1 mg/kg QDx20)vs 延长剂量(1 mg/kg QDx15或1 mg/kg QDx25) LSC标志物:CD34+CD38-细胞群体 MPO抑制:使用10 μM MPO-IN-28 ROS清除:使用NAC处理 检测时间点:流式细胞术在第7天进行
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较常规和延长剂量阿扎胞苷对AML细胞系甲基化和基因表达的影响。
三种AML细胞系(OCI-AML2、MV-4-11、SKM-1)分别接受模拟常规(HE-LD)和延长(LE-ED)剂量的阿扎胞苷处理,在第3天和第5天进行全基因组亚硫酸盐测序和RNA测序,并测量DNMT1蛋白水平。
比较两种剂量方案下阿扎胞苷在体内的DNA掺入量和低甲基化效果。
雄性C57BL/6小鼠接受常规剂量(3 mg/kg QDx5)或延长剂量(1 mg/kg QDx15)阿扎胞苷腹腔注射,测量PBMC中[14C]阿扎胞苷掺入DNA的AUC。
评估两种剂量方案对体内bulk AML细胞的抗肿瘤效果。
C1498-Luc3-GFP同系小鼠模型和IDH1R132H PDX模型(CTG-2227)分别接受常规或延长剂量阿扎胞苷治疗,监测肿瘤负荷(生物发光、脾重)。
评估两种剂量方案对骨髓中未成熟白血病细胞的影响。
FLT3-ITD;TET2;LysM-cre嵌合小鼠接受常规或延长剂量阿扎胞苷治疗,检测骨髓原始细胞比例。
比较两种剂量方案对LSC (CD34+CD38-) 的消除和分化效果。
OCI-AML20细胞在OP9滋养层上培养,用常规或延长剂量阿扎胞苷处理,第7天通过流式细胞术分析CD34/CD38表达,并进行单细胞RNA测序。
在体内验证延长剂量对LSC和祖细胞的作用。
患者来源的PBMC注射到NOD/SCID小鼠右股骨,用常规或延长剂量阿扎胞苷治疗,在第42天评估双侧股骨植入、分化标志物。
验证MPO和ROS在延长剂量阿扎胞苷诱导LSC分化中的作用。
在OCI-AML20细胞和患者CD34+细胞中,检测MPO表达;使用MPO抑制剂MPO-IN-28或ROS清除剂NAC处理,评估对分化的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI1640培养基 | -- | -- |
| IMDM培养基 | -- | -- | |
| α-MEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| β-巯基乙醇 | -- | -- | |
| 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | -- | -- | |
| 流式分析 | BD LSRFortessa X-20流式细胞仪 | BD | -- |
| 细胞因子阵列 | Proteome Profiler人XL细胞因子阵列试剂盒 | biotechne | ARY022B |
| IRDye 800CW链霉亲和素 | Licor | 926-32230 | |
| Odyssey CLx成像系统 | Licor | -- | |
| CD34+细胞富集 | CD34+分离试剂盒 | STEMCELL Technologies | 17856 |
| 细胞培养 | X-VIVO 10培养基 | Lonza | 04-380Q |
| BIT 9500血清替代物 | STEMCELL Technologies | 09500 | |
| 白细胞介素-6 | PeproTech | 200-06 | |
| 白细胞介素-3 | PeproTech | 200-03 | |
| 干细胞因子 | PeproTech | 300-07 | |
| FLT3配体 | PeproTech | 300-19 | |
| 粒细胞集落刺激因子 | PeproTech | 300-23 | |
| 促血小板生成素 | PeproTech | 300-18 | |
| 动物实验 | NOD.CB17-Prkdcscid/J小鼠 | -- | -- |
| C1498细胞 | ATCC | TIB-49 | |
| MPO抑制 | MPO-IN-28抑制剂 | -- | -- |
| ROS清除 | N-乙酰半胱氨酸 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外细胞处理 | 细胞系类型、培养条件(如培养基、血清浓度)、阿扎胞苷浓度(常规剂量 vs 延长剂量具体浓度)、处理时间、DNMT1检测方法 阅读提示:Methods: Human and mouse cell lines; Results 图1 |
| 体内药效学 | 小鼠品系、给药途径、剂量和给药方案(3 mg/kg QDx5 vs 1 mg/kg QDx15)、[14C]标记AUC测量方法 阅读提示:Methods: In vivo studies; Results 图1G |
| 体内疗效 | 同系模型细胞系(C1498-Luc3-GFP)、PDX模型(CTG-2227)、小鼠品系(免疫缺陷)、给药剂量(如5 mg/kg QDx4 vs 1 mg/kg QDx20)、终点指标(脾重、生存期) 阅读提示:Methods: In vivo studies; Results 图2 |
| LSC分化检测 | 细胞系(OCI-AML20)、OP9滋养层、阿扎胞苷剂量(延长 vs 常规)、处理时间(7天)、流式抗体(CD34、CD38)、LSC定义(CD34+CD38-) 阅读提示:Methods: Flow cytometry; Results 图3A |
| 机制验证 | MPO抑制剂浓度(10 μM MPO-IN-28)、NAC浓度、处理时间、MPO蛋白检测方法(Western blot等)、分化阻断评估标准 阅读提示:Methods: Myeloperoxidase inhibition; Results 图5 |