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微生物多样性
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Bionovogene
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微生物多样性研究是指通过高通量测序等方法检测样本的微生物组成和丰度的方法。微生物多样性测序，也称扩增子测序，通过高通量测序，对原核生物 16S rDNA 或真核生物 18S rDNA/ITS/ 功能基因特定区域进行测序。与传统方法相比，无需纯培养，大大减少了研究的费用、周期并提升了物种丰富度。
应用领域
医学研究：疾病标志物筛查、疾病的诊断和分型、疾病复发诊断、病因与病理机制探究、临床疗效评价、药物毒理学评价
生命科学研究：非生物环境关系研究、植物与微生物、在表型鉴定中的应用、代谢途径及功能基因组研究、药用植物研究中的应用
样本要求
● 土壤 / 污泥 / 沉积物 ≥ 3g
● 瘤胃液 / 发酵液 / 组织液 ≥ 3 ml
● 粪便 / 肠道内容物 ≥ 0.5g
● 液氮或 -80℃保存
● 干冰运输
案例分析
粪便微生物和代谢组检测可区分肠易激综合征和胆汁酸吸收不良
Differences in Fecal Microbiomes and Metabolomes of People With vs Without Irritable Bowel Syndrome and Bile Acid Malabsorption
期刊：Gastroenterology 影响因子：19.233
发表时间：2019年 发表单位：爱尔兰国立大学
研究背景与目的
Hox 基因调节造血干细胞（HSCs），在造血因子中重新获得的 Hox 表达参与白血病的发生。
研究设计
收集了 80 例 IBS 患者 65 例非 IBS 患者（对照组）的粪便和尿液样本，以及人体测量、医学和饮食信息。对粪便进行 16S 测序，对尿液和粪便代谢物进行气相色谱和液相色谱 - 质谱分析。通过检测胆汁酸在腹泻患者中的滞留，发现胆汁酸吸收不良（BAM）。
研究结果
IBS 患者与对照组相比，饮食与粪便微生物之间的网络联系有显著性差异，并伴有粪便代谢组的差异。不同 IBS 症状亚型患者粪便微生物组成无显著差异。粪便代谢组分可以区分 IBS 患者和对照组。IBS 患者和对照组之间的尿液代谢组也有显著差异。粪便代谢组可区分 IBS 患者是否伴 BAM。
图 1 图文摘要
图 2 基于多维度数据的可视化分析
结论
IBS 患者的尿液和粪便代谢产物还有粪便微生物群与对照组相比有显著差异，但患者的尿液和粪便代谢产物和粪便微生物群与对照组相比有显著差异，与 IBS 的症状亚型无关。粪便代谢组分析可用于区分有无 BAM 的 IBS 患者。这些发现可能被用来开发基于微生物的治疗这些疾病的方法。
参考文献
I. Jeffery et al., Differences in Fecal Microbiomes and Metabolomes of People With vs Without Irritable Bowel Syndrome and Bile Acid Malabsorption. Gastroenterology. 2019 Dec 13
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引言 依靠航空气体动力学原理设计的枪筒，GDS-80能够以非常低的气体压力进行微粒加速基因传递。 凭借先进的加速原理，在性能方面GDS-80低于80 psi的气压设置，与传统基因传递系统中需要数百甚至上千psi气压设置的传递效果相当，甚至更优。此外，GDS-80便携式的外形可以很容易地搭配各种配件并应用在不同的样品上。本文中将展示出一些典型植物样本，通过GDS-80进行的基因转染的实验效果。针对不同的样本特性，文中相对应地使用了不同配件协助进行轰击
一、接种 将微生物接到适于它生长繁殖的人工培养基上或活的生物体内的过程叫做接种。 在实验室用得最多的接种工具是接种环、接种针。由于接种要求或方法的不同，接种针的针尖部常做成不同的形状，有刀形、耙形等之分。有时滴管、吸管也可作为接种工具进行液体接种。在固体培养基表面要将菌液均匀涂布时，需要用到涂布棒。（图1） 图1 接种和分离工具 1.接种针 2.接种环 3.接种钩 4.5.玻璃涂棒 6.接种圈 7.接种锄 8.小解剖刀 常用的接种方法有以下几种： 1）划线
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